| 日 時 | : | 2013年1月24日(木)10:00~17:00 (受付は 9:30より) td> |
| 場 所 | : | 国立遺伝学研究所 DDBJセンター 4F td> |
| 主 催 | : | 日本DNA データバンク(DDBJ) td> |
| 対 象 | : | DDBJ を利用される方をどなたでも歓迎します(定員20名) td> |
| 参加費 | : | 無料 td> |
| 内 容 | : | 今回の講習会では,「大規模計算機を利用した配列解析とDDBJ データ登録」について講義を行ないます。 参加申込みに際しては,詳細の項を必ずお読みください。 td> |
| 詳 細 | : | [講習会の日程][PC について][アクセス][資料][お問い合わせ][参加申込み] td> |
講習会の日程
| 1月24日(木) 10:00~17:00 | |
| 時間 | 講義内容・講師 |
| 9:30-10:00 | 受付 |
| 10:00-10:05 | はじめに |
| 神沼 英里(国立遺伝学研究所 助教) |
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| 10:05-10:20 | DDBJ のNGS 対応 |
| 中村 保一(国立遺伝学研究所 教授) |
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| 10:20-11:00 | DDBJ 新塩基配列登録システム:Web から塩基配列を登録する |
| 小菅 武英(DDBJ 構築チーム アノテータ) |
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| 11:10-11:45 | イオントレントデータ解析におけるクラウド環境の活用 |
| 古川 貴久(ライフテクノロジーズジャパン株式会社) |
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| 11:45-12:20 | NIG SuperComputer の紹介と見学 |
| 川越 千晴(国立遺伝学研究所 スパコン担当SE) |
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| 昼食休憩 | |
| 13:20-13:55 | クラウドサービス BaseSpace が変える次世代シーケンサーデータ解析 |
| 鈴木 健介(イルミナ株式会社 マーケティング部) |
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| 13:55-14:45 | MiGAP:微生物ゲノム注釈ツール利用法 |
| 大山 彰(インシリコバイオロジー株式会社) |
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| 15:00-15:40 | DDBJ Pipeline の紹介 |
| 長崎 英樹(国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室) |
|
| 15:40-16:10 | DDBJ Sequence Read Archive(DRA), DDBJ BioProject の紹介 |
| 児玉 悠一(DDBJ 構築チーム アノテータ) |
|
| 16:10-16:40 | 大量登録システム(MSS):大規模アセンブル配列の登録 |
| 大城戸 利久(DDBJ 構築チーム アノテータ) | |
PC について
無線LAN 接続が可能なPC をご持参ください。
アクセス
〒411-8540 静岡県三島市谷田1111 国立遺伝学研究所 DDBJ センター 4F
アクセス
資料
・今回の講習会で使用する資料は,準備ができ次第受講者へご連絡いたします。
・ DDBJing 講習会資料ダウンロード / 過去の講習会 一覧(過去のDDBJing 講習会資料)
お問い合わせ
お問い合わせ の「講習会」までご連絡ください。
参加申込み
本講習会は終了いたしました
DDBJing 講習会とは?
国立遺伝学研究所の生命情報・DDBJ 研究センター (CIB-DDBJ; The Center for Information Biology and DNA Data Bank of Japan) には,日本DNA データバンク (DDBJ; DNA Data Bank of Japan) が設置されています。
DDBJ では,生物学研究者の皆様が決定された塩基配列の登録を受け付けて,それらを DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースに格納し公開することや,塩基配列やアミノ酸配列などのデータベースを検索し解析するソフトを WWW などで広く提供することを行なっています。
DDBJing とは,DDBJ が提供するこれらのシステムを使って頂くことです。
これまで国立遺伝学研究所で10回,所外で15回開催していますが, DDBJ をより有効に活用して頂くために,今後も全国各地で DDBJing 講習会を開催していく予定です。 DDBJ の利用に興味のある皆様のご参加をお待ちしています。
