DNA Data Bank of Japan
第11回 DDBJing 講習会 & PDBjing 講習会のおしらせ
-- 日本DNAデータバンクをフルに活用しよう! --

講習会 in 大阪

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「DDBJing PDBjing 講習会 in 大阪」参加者の皆様へ (3/4)
「DDBJing & PDBjing講習会 in 大阪」に御参加いただき,どうも ありがとうございました。今回は23名の方が参加してくださいましたが, 年度末の何かと忙しい時期に多くの方に参加していただき, DDBJ ならびに PDBjの活動に関心を持っていただいたことを感謝しています。 準備には万全を期したつもりでしたが,事前の連絡の不備などで参加者の 皆様に御迷惑をおかけいたしましたことをお詫び申し上げます。 また,アンケートへの様々な御意見の御記入をありがとうございました。 いただいた御意見は,今後の DDBJ ならびにPDBjの活動や講習会開催の 際の参考にさせていただきたいと思います。講習会は終了いたしましたが, アンケートに書き忘れたことや,テキストを読み返しての感想や御意見, 御質問,さらには DDBJ ならびにPDBjのサービスを実際に使ってみての 感想や御意見等,その他講習会に限らず DDBJ やPDBjに対してのご要望や ご質問 がありましたら,DDBJ のメールアドレス (ddbj@ddbj.nig.ac.jp) (PDBjに関するものはpdbjing@protein.osaka-u.ac.jp) にお送り下さい。 DDBJ ならびにPDBjでは,今後も様々な内容で講習会を開催してゆく予定 でいますので。是非また御参加下さい。 今後もDDBJ ならびにPDBjをどうぞよろしくお願いいたします。なお,資料のダウンロードはこちらからできます。


講義中の様子


日 時2005年3月2日(水)10時から17時まで
場 所 大阪大学中之島センター・
キャンパスイノベーションセンター 2階 講義室2
*講義室が変更になりました
(大阪市北区中之島4-3-53)
主 催・国立遺伝学研究所  DNA Data Bank of Japan (DDBJ)
・大阪大学蛋白質研究所・附属プロテオミクス総合研究センター
   日本蛋白質構造データバンク (PDBj)
・独立行政法人科学技術振興機構 (JST)
対 象DDBJならびにPDBj を利用される方をどなたでも歓迎します(定員30名)
参加費用無料
講習内容DDBJ とPDBjの Web サービスなどの利用についての講議と PC を用いた実習を行ないます。無線LANを用いてネットワークに接続して実習を行ないますので, 無線LANが使用可能な PC をご持参下さい。午前または午後のみの参加でも結構です。 皆様のご参加をお待ちしております。

== MacintoshのPCを ご使用の皆様へ ==
PCの条件が,当初の案内では, Mac(OS8以降)となっておりましたが, その後,PDBjの講義においてOSがMac10.2以前の場合PDBjViewer(jV3)が作動 しないことが判明いたしましたので,条件を変更し, Mac OSX ver.10.3以降、若しくはWindowsを推奨 させて頂きたいと思います。 ご迷惑をお掛け致しますがよろしくお願いいたします。 この件につきましてご質問等がありましたら、pdbjing@protein.osaka-u.ac.jpまで ご連絡下さい。(2005.2.22)


講習会の日程:
時間 講義内容・講師
10:00-10:30 DDBJの概略とHPの使い方
金城 玲(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ*・助手)
10:40 - 12:10 SAKURAを用いた塩基配列データ登録の概説・模擬登録実習
大城戸 利久(DDBJ 構築局・アノテータ)
13:10 - 13:40 PDBjの紹介とHPの使い方
中村 春木(大阪大学蛋白質研究所・教授)
13:50 - 14:40 xPSSSによる蛋白質立体構造データの検索法の実習
中村 春木(大阪大学蛋白質研究所・教授)
14:50 - 15:50 ADITによる立体構造データ登録法と実習
小佐田 高史(大阪大学蛋白質研究所・技術職員)
16:00 - 17:00 全ゲノム立体構造予測データベースGTOPの使い方
福地 佐斗志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ*・助手)
* 生命情報・DDBJ 研究センター  

参加申込み:
web または電子メールにて申し込みを受け付けます。 1月25日より申し込み受け付けを開始します。
web を利用する場合はここをクリック してお申し込み下さい。 電子メールを利用する場合は下記のフォーマットでお申し込み下さい。 ご記入いただいたアドレス宛に DDBJing講習会係よりメールを返信いたします。
 
PCについて:
本講習会では,講議内容をよりよく理解していただくためにPCを用いた実習を行ないますので 各自PCを御持参下さい。実習では無線LANを利用してネットワークに接続し,各々のサービスを利用します。 各サービスを利用するために,予め御自分のPCの環境設定や必要なアプリケーションのインストールを おこなってきてください。
実習名条件
実習全般Win(2000以降), Mac(OSX ver.10.3以降), Linux
無線LANに接続可能なこと(LANカードをご携帯ください)
SAKURA Windows: Internet Explorer 6.0, 5.5
                Netscape 7.X, 6.2
Macintosh*: Netscape 7.X, 6.2, 4.7
Linux: Netscape 7.X, 6.2, 4.7, Mozilla 1.7.2
*SAFARIは不可
PDBjviewer*の利用のために,
・JRE 1.4.2 or later (recommend 1.4.2_05)
・JOGL
*詳細はPDBjのHPをご覧下さい

== MacintoshのPCを ご使用の皆様へ ==
PCの条件が,当初の案内では, Mac(OS8以降)となっておりましたが, その後,PDBjの講義においてOSがMac10.2以前の場合PDBjViewer(jV3)が作動 しないことが判明いたしましたので,条件を変更し, Mac OSX ver.10.3以降、若しくはWindowsを推奨 させて頂きたいと思います。 ご迷惑をお掛け致しますがよろしくお願いいたします。 この件につきましてご質問等がありましたら、pdbjing@protein.osaka-u.ac.jpまで ご連絡下さい。(2005.2.22)


会場へのアクセス:
今回は初めて関西地区で開催します。大阪大学中之島センターは 大阪市の中心部にあり,交通の便の非常によいところです。関西地区の方々の参加をお待ちしています。
 
大阪大学中之島センター・キャンパスイノベーションセンター(大阪市北区中之島4-3-53)
電車によるアクセス : 阪神本線 福島駅より徒歩約9分
JR東西線 新福島駅より徒歩約9分
JR環状線 福島駅より徒歩約12分
地下鉄四つ橋線 肥後橋駅より徒歩約10分
地下鉄御堂筋線 淀屋橋駅より徒歩約16分
バスによるアクセス: 大阪市バス(53系統・75系統)
  大阪駅前バスタミナル → 田蓑橋 下車 徒歩1分
大阪市バス(107系統)
  天満橋 → 淀屋橋 → 肥後橋 → 土佐堀一丁目 下車 徒歩
中之島センター地図

その他:
昼食は中之島センター建物内のカフェテリアをご利用になれます。


DDBJing とは?
国立遺伝学研究所の生命情報・DDBJ 研究センター (CIB-DDBJ; The Center for Information Biology and DNA Data Bank of Japan) には日本 DNA データバンク (DDBJ; DNA Data Bank of Japan) が設置されています。
DDBJ では,生物学研究者の皆様が決定された塩基配列の登録を受け付けて, それらを DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースに格納し公開することや, 塩基配列やアミノ酸配列などのデータベースを検索し解析するソフトを WWW などで広く提供することを行なっています。
DDBJing とは,DDBJ が提供するこれらのシステムを使っていただくことです。
これまで国立遺伝学研究所で4回,所外で6回開催していますが, DDBJ をより有効に活用していただくために, 今後も全国各地で DDBJing 講習会を開催していく予定です。 DDBJ の利用に興味のあるみなさまの参加をお待ちしています。

電子メールでのお申し込み用フォーマット
 
宛先:ddbjing@ddbj.nig.ac.jp
参加日:全日・午前のみ・午後のみ
持参PCは:Win XP・Win Me・Win 2000・Mac OSX10.3・Mac OSX10.2以前
       その他 (その他の場合には具体的にご記入下さい):
氏名:
よみがな:
E-mail:(DDBJing 係との連絡に使用するアドレス)
所属:
住所:〒
 
講議の参考にするため、以下の質問にご回答下さい。
DDBJの利用について
1. 今までに DDBJを利用されたことはありますか?
 はい・いいえ
 はい と回答した方へ
2.何を利用されましたか?(複数回答可)
  配列の登録・検索/解析サービス・DDBJメールマガジン
HP閲覧・講習会に参加・その他
登録について
3. 過去2年以内に DDBJ に配列を登録したことはありますか?
 はい・いいえ
 はい と回答した方へ
4.登録に用いた方法は何ですか?(複数回答可)
  SAKURA・大量登録システム・その他
5. 今後1年以内に DDBJ に塩基配列を登録する予定はありますか?
 はい・いいえ
 はい と回答した方へ
6.登録を予定している配列は何件程度でしょうか?
 10件以下・11〜50件・ 50件以上
 
GTOPについて
7. GTOPを利用したことはありますか?
 はい・いいえ
 はい と回答した方へ
8.どのような目的で利用しましたか(複数回答可)
  立体構造予測・機能予測・その他の解析
9. GTOPに期待することがあったらお書き下さい

検索/解析サービスについて
10.DDBJ のサービスの中で使用したことのあるものは何ですか?(複数回答可)
  getentrySRSTXsearch ClustalWBLAST
  FASTASSEARCHSQmatch GIBGTOP
  XML Central of DDBJ Human Genomics StudioH-InvDB
11.今後使ってみたい DDBJ のサービス何ですか?(複数回答可)
  getentrySRSTXsearch ClustalWBLAST
  FASTASSEARCHSQmatch GIBGTOP
  XML Central of DDBJ Human Genomics StudioH-InvDB


PDBjについて
12. PDBを御存知ですか?
 はい・いいえ
13. PDBデータを利用されたことがありますか?
 はい・いいえ
 はい と回答した方へ
14.どのような目的で利用されたことがありますか?(複数回答可)
  データ登録・検索/解析・その他
15. PDBjのページにアクセスされたことがありますか?
 はい・いいえ
 はい と回答した方へ
  16.どのような目的で利用されたことがありますか?(複数回答可
  データ登録・検索/解析・その他
17. 今後、PDBデータベースをどのような目的で利用される予定がありますか?(複数回答可)
  データ登録・検索/解析・その他


  その他  
18.DDBJ,PDBj,講習会等に関する御意見・御要望がございましたら,ご自由にお書きください。



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ddbjing@ddbj.nig.ac.jp
Last modified: Jun. 20, 2011