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DDBJ の連絡先
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Copyright © 1995-2006
DDBJ All rights reserved.
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「DDBJing PDBjing 講習会 in 大阪」参加者の皆様へ (3/4)
「DDBJing & PDBjing講習会 in 大阪」に御参加いただき,どうも
ありがとうございました。今回は23名の方が参加してくださいましたが,
年度末の何かと忙しい時期に多くの方に参加していただき, DDBJ ならびに
PDBjの活動に関心を持っていただいたことを感謝しています。
準備には万全を期したつもりでしたが,事前の連絡の不備などで参加者の
皆様に御迷惑をおかけいたしましたことをお詫び申し上げます。
また,アンケートへの様々な御意見の御記入をありがとうございました。
いただいた御意見は,今後の DDBJ ならびにPDBjの活動や講習会開催の
際の参考にさせていただきたいと思います。講習会は終了いたしましたが,
アンケートに書き忘れたことや,テキストを読み返しての感想や御意見,
御質問,さらには DDBJ ならびにPDBjのサービスを実際に使ってみての
感想や御意見等,その他講習会に限らず DDBJ やPDBjに対してのご要望や
ご質問 がありましたら,DDBJ のメールアドレス (ddbj@ddbj.nig.ac.jp)
(PDBjに関するものはpdbjing@protein.osaka-u.ac.jp) にお送り下さい。
DDBJ ならびにPDBjでは,今後も様々な内容で講習会を開催してゆく予定
でいますので。是非また御参加下さい。
今後もDDBJ ならびにPDBjをどうぞよろしくお願いいたします。なお,資料のダウンロードはこちらからできます。

講義中の様子
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| 日 時 | : | 2005年3月2日(水)10時から17時まで |
| 場 所 | : |
大阪大学中之島センター・ キャンパスイノベーションセンター
2階 講義室2*講義室が変更になりました
(大阪市北区中之島4-3-53)
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| 主 催 | : | ・国立遺伝学研究所 DNA Data Bank of Japan (DDBJ)
・大阪大学蛋白質研究所・附属プロテオミクス総合研究センター
日本蛋白質構造データバンク (PDBj)
・独立行政法人科学技術振興機構 (JST) |
| 対 象 | : | DDBJならびにPDBj を利用される方をどなたでも歓迎します(定員30名) |
| 参加費用 | : | 無料 |
講習内容 | : | DDBJ とPDBjの Web サービスなどの利用についての講議と
PC を用いた実習を行ないます。無線LANを用いてネットワークに接続して実習を行ないますので,
無線LANが使用可能な PC をご持参下さい。午前または午後のみの参加でも結構です。
皆様のご参加をお待ちしております。
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== MacintoshのPCを
ご使用の皆様へ ==
PCの条件が,当初の案内では, Mac(OS8以降)となっておりましたが,
その後,PDBjの講義においてOSがMac10.2以前の場合PDBjViewer(jV3)が作動
しないことが判明いたしましたので,条件を変更し,
Mac OSX ver.10.3以降、若しくはWindowsを推奨
させて頂きたいと思います。
ご迷惑をお掛け致しますがよろしくお願いいたします。
この件につきましてご質問等がありましたら、pdbjing@protein.osaka-u.ac.jpまで
ご連絡下さい。(2005.2.22)
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- 講習会の日程:
-
| 時間 |
講義内容・講師 |
| 10:00-10:30 |
DDBJの概略とHPの使い方 |
| 金城 玲(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ*・助手) |
| 10:40 - 12:10 |
SAKURAを用いた塩基配列データ登録の概説・模擬登録実習 |
| 大城戸 利久(DDBJ 構築局・アノテータ) |
| 13:10 - 13:40 |
PDBjの紹介とHPの使い方 |
| 中村 春木(大阪大学蛋白質研究所・教授) |
| 13:50 - 14:40 |
xPSSSによる蛋白質立体構造データの検索法の実習 |
| 中村 春木(大阪大学蛋白質研究所・教授) |
| 14:50 - 15:50 |
ADITによる立体構造データ登録法と実習 |
| 小佐田 高史(大阪大学蛋白質研究所・技術職員) |
| 16:00 - 17:00 |
全ゲノム立体構造予測データベースGTOPの使い方 |
| 福地 佐斗志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ*・助手) |
- * 生命情報・DDBJ 研究センター
- 参加申込み:
- web または電子メールにて申し込みを受け付けます。
1月25日より申し込み受け付けを開始します。
- web を利用する場合はここをクリック
してお申し込み下さい。
電子メールを利用する場合は下記のフォーマットでお申し込み下さい。
ご記入いただいたアドレス宛に DDBJing講習会係よりメールを返信いたします。
-
- PCについて:
- 本講習会では,講議内容をよりよく理解していただくためにPCを用いた実習を行ないますので
各自PCを御持参下さい。実習では無線LANを利用してネットワークに接続し,各々のサービスを利用します。
各サービスを利用するために,予め御自分のPCの環境設定や必要なアプリケーションのインストールを
おこなってきてください。
| 実習名 | 条件 |
| 実習全般 | Win(2000以降), Mac(OSX ver.10.3以降), Linux
無線LANに接続可能なこと(LANカードをご携帯ください) |
| SAKURA |
Windows: Internet Explorer 6.0, 5.5
Netscape 7.X, 6.2
Macintosh*: Netscape 7.X, 6.2, 4.7
Linux: Netscape 7.X, 6.2, 4.7, Mozilla 1.7.2
*SAFARIは不可
|
| PDBj | viewer*の利用のために,
・JRE 1.4.2 or later (recommend 1.4.2_05)
・JOGL
*詳細はPDBjのHPをご覧下さい |
== MacintoshのPCを
ご使用の皆様へ ==
PCの条件が,当初の案内では, Mac(OS8以降)となっておりましたが,
その後,PDBjの講義においてOSがMac10.2以前の場合PDBjViewer(jV3)が作動
しないことが判明いたしましたので,条件を変更し,
Mac OSX ver.10.3以降、若しくはWindowsを推奨
させて頂きたいと思います。
ご迷惑をお掛け致しますがよろしくお願いいたします。
この件につきましてご質問等がありましたら、pdbjing@protein.osaka-u.ac.jpまで
ご連絡下さい。(2005.2.22)
|
- 会場へのアクセス:
- 今回は初めて関西地区で開催します。大阪大学中之島センターは
大阪市の中心部にあり,交通の便の非常によいところです。関西地区の方々の参加をお待ちしています。
-
-
大阪大学中之島センター・キャンパスイノベーションセンター(大阪市北区中之島4-3-53)
-
| 電車によるアクセス : |
阪神本線 福島駅より | 徒歩約9分 |
JR東西線 新福島駅より | 徒歩約9分 |
JR環状線 福島駅より | 徒歩約12分 |
地下鉄四つ橋線 肥後橋駅より | 徒歩約10分 |
地下鉄御堂筋線 淀屋橋駅より | 徒歩約16分 |
| バスによるアクセス: |
大阪市バス(53系統・75系統) |
| 大阪駅前バスタミナル → 田蓑橋 下車 徒歩1分 |
| 大阪市バス(107系統) |
| 天満橋 → 淀屋橋 → 肥後橋 → 土佐堀一丁目 下車 徒歩 |
- その他:
- 昼食は中之島センター建物内のカフェテリアをご利用になれます。
DDBJing とは?
国立遺伝学研究所の生命情報・DDBJ 研究センター (CIB-DDBJ; The Center
for Information Biology and DNA Data Bank of Japan) には日本 DNA データバンク
(DDBJ; DNA Data Bank of Japan) が設置されています。
DDBJ では,生物学研究者の皆様が決定された塩基配列の登録を受け付けて,
それらを DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースに格納し公開することや,
塩基配列やアミノ酸配列などのデータベースを検索し解析するソフトを WWW
などで広く提供することを行なっています。
DDBJing とは,DDBJ が提供するこれらのシステムを使っていただくことです。
これまで国立遺伝学研究所で4回,所外で6回開催していますが,
DDBJ をより有効に活用していただくために,
今後も全国各地で DDBJing 講習会を開催していく予定です。
DDBJ の利用に興味のあるみなさまの参加をお待ちしています。
- 電子メールでのお申し込み用フォーマット
-
- 宛先:ddbjing@ddbj.nig.ac.jp
- 参加日:全日・午前のみ・午後のみ
- 持参PCは:Win XP・Win Me・Win 2000・Mac OSX10.3・Mac OSX10.2以前
- その他 (その他の場合には具体的にご記入下さい):
- 氏名:
- よみがな:
- E-mail:(DDBJing 係との連絡に使用するアドレス)
- 所属:
- 住所:〒
-
- 講議の参考にするため、以下の質問にご回答下さい。
| DDBJの利用について |
| 1. |
今までに DDBJを利用されたことはありますか? |
| | はい・いいえ |
| | はい と回答した方へ
2.何を利用されましたか?(複数回答可) |
| |
配列の登録・検索/解析サービス・DDBJメールマガジン
HP閲覧・講習会に参加・その他 |
| 登録について |
| 3. |
過去2年以内に DDBJ に配列を登録したことはありますか? |
| | はい・いいえ |
| | はい と回答した方へ
4.登録に用いた方法は何ですか?(複数回答可) |
| |
SAKURA・大量登録システム・その他 |
| 5. |
今後1年以内に DDBJ に塩基配列を登録する予定はありますか? |
| | はい・いいえ |
| | はい と回答した方へ
6.登録を予定している配列は何件程度でしょうか? |
| | 10件以下・11〜50件・ 50件以上 |
| |
| GTOPについて |
| 7. |
GTOPを利用したことはありますか? |
| | はい・いいえ |
| | はい と回答した方へ
8.どのような目的で利用しましたか(複数回答可) |
| |
立体構造予測・機能予測・その他の解析 |
| 9. |
GTOPに期待することがあったらお書き下さい
|
| 検索/解析サービスについて
|
| 10. | DDBJ
のサービスの中で使用したことのあるものは何ですか?(複数回答可) |
| |
getentry | SRS | TXsearch |
ClustalW | BLAST |
| |
FASTA | SSEARCH | SQmatch |
GIB | GTOP |
| |
XML Central of DDBJ |
Human Genomics Studio | H-InvDB |
| 11. | 今後使ってみたい DDBJ
のサービス何ですか?(複数回答可) |
| |
getentry | SRS | TXsearch |
ClustalW | BLAST |
| |
FASTA | SSEARCH | SQmatch |
GIB | GTOP |
| |
XML Central of DDBJ |
Human Genomics Studio | H-InvDB |
| PDBjについて |
| 12. |
PDBを御存知ですか? |
| | はい・いいえ |
| 13. |
PDBデータを利用されたことがありますか? |
| | はい・いいえ |
| | はい と回答した方へ
14.どのような目的で利用されたことがありますか?(複数回答可) |
| |
データ登録・検索/解析・その他 |
| 15. |
PDBjのページにアクセスされたことがありますか? |
| | はい・いいえ |
| | はい と回答した方へ
16.どのような目的で利用されたことがありますか?(複数回答可 |
| |
データ登録・検索/解析・その他 |
| 17. |
今後、PDBデータベースをどのような目的で利用される予定がありますか?(複数回答可) |
| |
データ登録・検索/解析・その他 |
| その他 |
|
18.DDBJ,PDBj,講習会等に関する御意見・御要望がございましたら,ご自由にお書きください。 |
過去のDDBJing
DDBJing 講習会 資料のダウンロード
ddbjing@ddbj.nig.ac.jp
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