DNA Data Bank of Japan
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DDBJing & PDBjing 講習会
in 東工大

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第3回 DDBJing & PDBjing 講習会 (第16回 DDBjing 講習会)のおしらせ


「第3回 DDBJing & PDBjing 講習会 in 東工大」参加者の皆様へ (12/25)
「第3回 DDBJing PDBjing 講習会 in 東工大」にご参加いただき,ありがとうございました。今回で3回めの開催となり,24名の方々にご参加いただきました。遠方よりご来場くださった方もあり,多くの皆様に DDBJ ならびに PDBj の活動に関心を持っていただきましたことを感謝しております。
また,アンケートに多くのご意見ご感想をお寄せいただき,ありがとうございました。今後の DDBJ ならびに PDBj の活動や講習会開催の参考にさせていただきます。講習会は終了しましたが,講議やテキストについてお気付きになられたこと,DDBJ ならびに PDBj のサービスを実際に使用されてのご意見ご感想,その他,DDBJ や PDBj へのご要望やご質問等ございましたら,講習会に限らずどんなことでも結構ですので,DDBJ のメールアドレス (ddbj@ddbj.nig.ac.jp)(PDBj に関するものは,pdbjing@protein.osaka-u.ac.jp)宛にお送り下さい。 DDBJ ならびに PDBj では,今後も様々な内容で講習会を開催する予定でおりますので,是非またご参加下さい。なお,講習会の資料は後日公開する予定です。過去の講習会の資料はこちらからダウンロードできます。 DDBJ のサービスの新規開始・変更などのお知らせや,今後の講習会の開催などの情報は,DDBJ の HP や DDBJ メールマガジンでお知らせしております。是非ご参照下さい。今後も DDBJ ならびに PDBj をどうぞよろしくお願いいたします。

DDBJing-photo1 DDBJing-photo2

講義中の様子

日    時 2006年12月21日(木)13時から17時まで
2006年12月22日(金)10時から17時まで
場    所 東京工業大学 (〒152-8550 東京都目黒区大岡山2-12-1)
大岡山キャンパス・大岡山北地区
情報ネットワーク演習棟 (地図の1の建物です)
主    催・国立遺伝学研究所  生命情報・研究センタ−
   日本 DNA データバンク (DDBJ)
・大阪大学蛋白質研究所 (IPR)・附属プロテオミクス総合研究センター
   日本蛋白質構造データバンク (PDBj)
・独立行政法人科学技術振興機構 (JST)
対    象 DDBJ ならびに PDBj を利用される方をどなたでも歓迎します(定員30名)
参加費用 無料
講習内容 DDBJ と PDBj の Web サービスなどの利用についての講議と PC を用いた実習を行ないます。
PC は,会場に備え付けの PC (MacOSX) を利用していただきます。皆様のご参加をお待ちしております。
参加申込みに際しては,講習会の詳細の項を必ずお読み下さい。
講習会の詳細:
  [講習会の日程] [参加申込み方法] [PC について]
[東工大・大岡山キャンパスへのアクセス] [その他]
 
講習会の日程:
第1日目 12月21日(木)13:00〜17:00
時間講議内容・講師
13:00-13:20 DDBJ の紹介
坂井 勝呂(日本 DNA データバンク データベース構築局)
13:20-14:55 SAKURA を用いた塩基配列登録の方法・講議及び実習
坂井 勝呂(日本 DNA データバンク データベース構築局)
15:05-15:40 PDBj の紹介と HP の使い方
中村 春木(大阪大学蛋白質研究所・教授)
15:40-17:00 PDBj の各種サービスの基本的な使い方(講議と実習)
金城 玲(大阪大学蛋白質研究所・客員助教授)
第2日目 12月22日(金)10:00〜17:00
時間講議内容・講師
10:00-12:00 PDBML 入門(講議と実習)
金城 玲(大阪大学蛋白質研究所・客員助教授)
12:00-12:50昼休み
12:50-14:50 GTOP の利用法・講議および実習
福地 佐斗志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ*・助手)
15:00-17:00 たんぱく質表面形状と物性データベース,eF-site
木下 賢吾(東京大学医科学研究所・助教授)
*生命情報・DDBJ 研究センター
 
 
参加申込み方法: 講議は終了いたしました,ご了承ください。(12/25)
 
PC について: 
会場の備え付けの PC (MacOSX) をご利用いただきます。
PC の持ち込みはできません。
 

 
東京工業大学・大岡山キャンパス:
東急目黒線 大岡山駅より徒歩1分 (東京駅から京浜東北線&大井町線で約30分)
交通案内(東京工業大学・大岡山キャンパスのサイトへ)
大岡山キャンパスマップ
大岡山北地区 (会場は,大岡山北地区の「1.情報ネットワーク演習室」です。)
 
その他:
昼食は各自ご用意ください。(東工大大岡山キャンパス周辺のお食事処
宿泊の手配はご自身でお願いいたします。
 

DDBJing とは?
国立遺伝学研究所の生命情報・DDBJ 研究センター (CIB-DDBJ; The Center for Information Biology and DNA Data Bank of Japan) には日本 DNA データバンク (DDBJ; DNA Data Bank of Japan) が設置されています。
DDBJ では,生物学研究者の皆様が決定された塩基配列の登録を受け付けて, それらを DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースに格納し公開することや, 塩基配列やアミノ酸配列などのデータベースを検索し解析するソフトを WWW などで広く提供することを行なっています。
DDBJing とは,DDBJ が提供するこれらのシステムを使っていただくことです。
これまで国立遺伝学研究所で6回,所外で9回開催していますが, DDBJ をより有効に活用していただくために, 今後も全国各地で DDBJing 講習会を開催していく予定です。 DDBJ の利用に興味のあるみなさまの参加をお待ちしています。


PDBj とは?
現在,多くの遺伝子情報が解き明かされています。この遺伝情報を有効利用する ためには,各遺伝子がコードする蛋白質分子を理解することが必要です。特に,各蛋白質の立体構造がその特異的な機能発現を与えているため,分子レベルにおいて遺伝子の進化と生物学的機能を把握するには,蛋白質の構造が不可欠です。PDBj では,独立行政法 人科学技術振興機構の支援を受けて,これら蛋白質立体構造のデータベース (PDB) を 大阪大学蛋白質研究所で運営しています。2003年に,米国の RCSB(構造バイオイン フォマティクス研究共同体),欧州 EBI (ヨーロッパバイオインフォマティクス研 究所)の MSD(高分子構造データベース)グループと共に、国際蛋白質構造データバ ンク (wwPDB) を設立し,国際協力による PDB データベースの維持・管理を行なっていま す。また,蛋白質構造を利用した二次データベースやサービスも提供しています。詳細活動については,http://www.pdbj.org をご覧下さい。


過去の DDBJing 講習会  


  参考資料(講習会の予習ができます)

関係サイトへのリンク [ DDBJ | CIB | NIG ]
 [ IPR | PDBj ]


ddbjing@ddbj.nig.ac.jp
Last modified: Jun. 20, 2011