DNA Data Bank of Japan
第17回 DDBJing 講習会のおしらせ
-- 日本DNAデータバンクをフルに活用しよう! --

講習会 in 三島

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「第17回 DDBJing 講習会 in 三島」参加者の皆様へ (5/31)
5月29-30日の2日間にわたり開催いたしました「DDBJing 講習会 in 三島」に御参加いただき, どうもありがとうございました。 今回は国立遺伝学研究所内外から33名の方にご参加いただき,中には遠方より参加していただいた方もあり, 多くの方に DDBJ の活動に関心を持っていただきましたことを感謝しております。
準備には万全を期したつもりでしたが,いろいろ不手際もあり,参加者の皆様に御迷惑をおかけいたしましたことを 反省し,次回以降の講習会ではさらなる配慮をいたしたいと考えております。
また,アンケートへの様々な御意見の御記入をありがとうございました。いただきました御意見は,今後の DDBJ の活動や DDBJing 講習会開催の際の参考にさせていただきたいと思います。講習会は終了いたしましたが,アンケートに書き忘れたことや,テキストを読み返しての感想や御意見,ご質問,さらにはDDBJのサービスを実際に使ってみての感想や御意見等,その他講習会に限らずDDBJ に対してのご要望やご質問 など,どんなことでも結構ですので,是非DDBJ のメールアドレス (ddbj@ddbj.nig.ac.jp) にお送り下さい また,講習会で講師が言及しましたDDBJのサービスに関する変更についてのお知らせ,新規サービスの開始,今後の講習会の開催などの情報は,DDBJのHPやDDBJ メールマガジンでお知らせしておりますので,こちらもご参照下さい。
DDBJでは,今後も様々内容で講習会を開催してゆく予定でおりますので,是非また御参加下さい。 今後もDDBJをよろしくお願いいたします。

DDBJing-photo2 DDBJing-photo1

講義中の様子


日 時 2007年5月29日(火)13時から 17時まで    (※受付・PC設定  12時〜13時)
2007年5月30日(水)10時から 17時まで
場 所 国立遺伝学研究所・
生命情報・DDBJ研究センター 2階会議室(静岡県三島市)
主 催 国立遺伝学研究所  DNA Data Bank of Japan (DDBJ)
対 象 DDBJ を利用される方をどなたでも歓迎します(定員30名)
参加費用 無料
講習内容 DDBJ の Web サービスなどの利用についての講議と PC を用いた実習を行ないます。 講議内容をよりよく理解していただくために,PC をネットワークに接続して実習を行ないますので, 無線 LAN を用いてネットワークに接続可能な PC をご持参下さい。皆様のご参加をお待ちしております。
参加申込みに際しては,講習会の詳細の項を必ずお読み下さい。
講習会の詳細:
  [講習会の日程] [参加申込み方法] [PC について] [参考資料]
[国立遺伝学研究所へのアクセス] [その他]
*定員になりましたので参加受付はしめきりました。ご了承ください。(5/8)
 
講習会の日程:
第1日目 5月29日(火)受付・PC設定 12:00〜13:00 講義 13:00〜17:00
12:00-13:00 受付・ PC の設定など
PC の設定等に時間がかかることがありますので、お早めにご来場ください。
時間講議内容・講師
13:00-13:30 DDBJ の紹介
舘野 義男(日本DNAデータバンク バンク長/国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ*・教授)
13:30-14:55 getentry, ARSA, SRS の検索実習
小笠原 理(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ*・助教)
14:55-15:05休憩
15:05-17:00 SAKURA を用いた塩基配列登録の方法・実習
李慶範(国立遺伝学研究所 DDBJ 構築局アノテータ)
 
第2日目 5月30日(水)10:00〜17:00
時間講議内容・講師
10:00-11:20 FASTA, BLAST の検索実習
鈴木 善幸(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ*・助教)
11:30-12:00国立遺伝学研究所 大型計算機の見学
12:00-12:50昼休み
12:50-14:50 完全ゲノムデータの利用 GIB, GIB-V, GTPS
阿部 貴志(国立遺伝学研究所 データベース運用開発研究室)
14:50-15:00休憩
15:00-17:00 ClustalW の講義と実習
鈴木 善幸(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ*・助教)
*生命情報・DDBJ 研究センター
 

 
参加申込み方法: 定員になりましたので参加受付はしめきりました。ご了承ください。 (5/8)
 
PC について: 
本講習会の実習で使用しますので各自 PC をご持参下さい。 実習に必要な PC の条件は下記の表の通りです。
国立遺伝学研究所のネットワークに接続するために,IP アドレスの設定変更やドライバのインストール等の作業が必要になります。 作業にあたっては,DDBJ のスタッフがお手伝いいたしますが,PC の機種によって設定方法が異なるため,限られた時間内で参加者全員の設定変更作業に対応するのは困難と予想されます。
このため,あらかじめ以下の点をご確認下さい。
  • PC の設定変更方法(パスワードが必要な場合もあります)。
    過去の講習会において,他人の PC を借りてきたためにパスワードがわからず,ネットワークに接続できない,という例がありましたので, 借用 PC を使用される際は,管理者権限のパスワード等を必ず把握しておいてください。
  • 講習会への参加申込みの際には,お持ちになる PC のOS とバージョン,無線または有線でのネットワークへの接続の実績を必ずご連絡下さい。
 
 実習名 条件
[実習全般]
利用可能な PC
ウイルス駆除ソフトにて検疫済みであり, 最新パッチが適用されている PC であること。
Windows(2000 以上):
無線 LAN に接続可能なこと。
無線 LAN カードは当方で用意いたします。
(このため,無線 LAN カード挿入のための空きスロットが必要です。)
ご注意:  無線 LAN カードの持ち込みはできません。また内蔵型の無線 LAN カードは使用できません。
Macintosh(OS9 以上):
Mac に内蔵されている無線 LAN を利用し,AirMac に接続可能なこと。
無線 LAN を内蔵していない機種をお持ちの方はケーブル LAN 接続にて対応いたします。
ご注意:  無線 LAN カードの持ち込みはできません。
OSXユーザへのお願い
ブラウザとして Fire Fox をダウンロードしておいてください。

「SAKURAを用いた塩基配列登録の方法・実習」の実習の際,Safari のブラウザをご使用されますと, 文字化けすることがあります。
[実習全般]
推奨ブラウザ
Windows:
  Internet Explorer 5.X 以上,Firefox 2.X
  (GIB-V,GTPS :上記に加え,Netscape 6.X 以上が推奨ブラウザとなります。)
Macintosh:
  Safari 1.3.X/2.0.X,Firefox 2.X
  (GIB-V,GTPS :上記に加え,Netscape 6.X 以上が推奨ブラウザとなります。)
[ClustalW の講義と実習] 系統樹作成用に TreeView をダウンロードしてください。
 

 
国立遺伝学研究所までのアクセス:
JR三島駅まで東京から1時間,名古屋から2時間(東海道新幹線こだまを利用の場合)
三島駅からバス・タクシーで約15分(バス250円・タクシーはおおよそ1500円)
周辺地図・バス時刻表など国立遺伝学研究所の案内(国立遺伝学研究所のサイトへ)
 
その他:
昼食は国立遺伝学研究所内の食堂(Cafeteria) をご利用いただけます。
宿泊の手配はご自身でお願いいたします(国立遺伝学研究所のサイトに 三島市内のホテルリストがありますのでご参照下さい)。
大学関係者の方は国立遺伝学研究所内の研究員宿泊施設の利用が可能です。 予約が必要ですので,希望者は参加申し込み時にお問い合わせ下さい。 利用できる人数に限りがありますので,ご希望に添えない場合もあることをご承知おき下さい。
 

DDBJing とは?
国立遺伝学研究所の生命情報・DDBJ 研究センター (CIB-DDBJ; The Center for Information Biology and DNA Data Bank of Japan) には日本 DNA データバンク (DDBJ; DNA Data Bank of Japan) が設置されています。
DDBJ では,生物学研究者の皆様が決定された塩基配列の登録を受け付けて, それらを DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースに格納し公開することや, 塩基配列やアミノ酸配列などのデータベースを検索し解析するソフトを WWW などで広く提供することを行なっています。
DDBJing とは,DDBJ が提供するこれらのシステムを使っていただくことです。
これまで国立遺伝学研究所で6回,所外で10回開催していますが, DDBJ をより有効に活用していただくために, 今後も全国各地で DDBJing 講習会を開催していく予定です。 DDBJ の利用に興味のあるみなさまの参加をお待ちしています。

過去のDDBJing  


  参考資料(講習会の予習ができます)

関係サイトへのリンク [DDBJ | CIB | NIG]


ddbjing@ddbj.nig.ac.jp
Last modified: Jun. 20, 2011