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「第21回 DDBJing講習会 in 三島」のお知らせ

第21回 DDBJing 講習会は終了しました
日 時 ：
 		 2009年6月17日（水）13時から 17時まで     （※受付は，12時00分より）
2009年6月18日（木）10時から 17時00分まで
場 所 ： 国立遺伝学研究所　生命情報・DDBJ 研究センター　2階会議室
主 催 ： 国立遺伝学研究所　生命情報・DDBJ 研究センター　日本 DNA データバンク（DDBJ）
対 象 ： DDBJ を利用される方をどなたでも歓迎します（定員30名）
参加費用 ： 無料
講習内容 ： DDBJ の Web サービスなどの利用についての講義と PC を用いた実習を行ないます。 講義内容をよりよく理解していただくために，PC を使用した実習を行ないますので，ネットワークに接続可能な PC をご持参下さい。 参加申込みに際しては，講習会の詳細の項を必ずお読み下さい。
講習会の詳細 ： [講習会の日程] [参加申込み方法] [PC について] [参考資料]
[その他]

講習会の日程：

第1日目 6月17日（水）   13:00〜17:00
時間講義内容・講師
12:00-13:00 受付（講義開始までの間に PC のネットワークの設定）
13:00-13:30 ＤＤＢＪホームページの使い方
真島　淳 （DDBJ 構築局アノテータ）
13:30-15:00 データベース検索実習１：キーワード検索を中心に
中村　保一 （国立遺伝学研究所　教授）
15:10-17:00 SAKURA を用いた塩基配列登録の方法・実習
小菅　武英 （DDBJ 構築局アノテータ）
 
第2日目 6月18日（木）10:00〜17:00
時間講義内容・講師
10:00-12:00 データベース検索実習２：FASTA, BLAST, PSI-BLAST, HMMPFAM の使い方
中村　保一 （国立遺伝学研究所　教授）
12:00-12:50 昼食休憩
12:50-13:20 スパコン棟見学
DDBJ スタッフ
13:30-14:30 short read archive(SRA)登録紹介とshort reads データ解析例の紹介
神沼　英里 （国立遺伝学研究所　助教）・児玉　悠一 （DDBJ 構築局アノテータ）
14:40-15:20 大量登録の紹介
野崎　亜沙美 （DDBJ 構築局アノテータ）
15:30-17:00 分子進化解析入門(ClustalW)
中村　保一 （国立遺伝学研究所　教授）
 

参加申込み方法：

web または電子メールにて申し込みを受け付けます。
Web を利用する場合はここをクリックしてお申し込み下さい。
電子メールを利用する場合はこちらのフォーマットでお申し込み下さい。
ご記入いただいたアドレス宛に DDBJing 講習会係よりメールを返信いたします。
 

PC について：

本講習会の実習で使用しますので各自 PC をご持参下さい。
実習に必要な PC の条件は下記の表の通りです。
国立遺伝学研究所のネットワークに接続するために，IP アドレスの設定変更やドライバのインストール等の作業が必要になります。
作業にあたっては，DDBJ のスタッフがお手伝いいたしますが，PC の機種によって設定方法が異なるため，限られた時間内で参加者全員の設定変更作業に対応するのは困難と予想されます。 このため，あらかじめ以下の点をご確認下さい。
  • PC の設定変更方法
    設定変更には，パスワードが必要な場合があります。昨年，他人の PC を借りてきたためにパスワードがわからず，ネットワークに接続できない，という例がありましたのでご注意下さい。
  • PC の OS とバージョン
    また，PC や OS によってネットワークへの接続方法や設定変更方法が異なりますので，講習会への参加申込みの際には，お持ちになる PC のOS とバージョン，ネットワークへの接続の実績を必ずご連絡下さい。
 実習名   条件 
[実習全般]
利用可能な PC		 ・ウイルス駆除ソフトにて検疫済みの PC であること
・有線にてネットワークに接続可能（ケーブルの差込口がついている）なこと
・Windows（2000 以降）
  Macintosh（OSX 以降）
[実習全般]
推奨ブラウザ		 Windows:
  Internet Explorer 5.X 以上
  Firefox 2.0 以上
Macintosh:
（実習によっては使用できない場合がありますので，できれば複数のブラウザをご用意下さい）
  SAFARI 1.3.X/2.0.3 以上
  Firefox 2.x 以上
[分子進化
解析入門]		 系統樹作成用に TreeView をダウンロード

国立遺伝学研究所までのアクセス：

ＪＲ三島駅まで東京から１時間，名古屋から２時間（東海道新幹線こだまを利用の場合）
三島駅からバス・タクシーで約15分（バス250円・タクシーはおおよそ1500円）
周辺地図・バス時刻表など国立遺伝学研究所の案内（国立遺伝学研究所のサイトへ）

その他：

昼食は国立遺伝学研究所内の食堂(Cafeteria) をご利用いただけます。
宿泊の手配はご自身でお願いいたします（国立遺伝学研究所のサイトに 三島市内のホテルリストがありますのでご参照下さい)。

DDBJing 講習会とは？

国立遺伝学研究所の生命情報・DDBJ 研究センター (CIB-DDBJ; The Center for Information Biology and DNA Data Bank of Japan) には日本 DNA データバンク (DDBJ; DNA Data Bank of Japan) が設置されています。
DDBJ では，生物学研究者の皆様が決定された塩基配列の登録を受け付けて， それらを DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースに格納し公開することや， 塩基配列やアミノ酸配列などのデータベースを検索し解析するソフトを WWW などで広く提供することを行なっています。
DDBJing とは，DDBJ が提供するこれらのシステムを使っていただくことです。
これまで国立遺伝学研究所で8回，所外で12回開催していますが， DDBJ をより有効に活用していただくために， 今後も全国各地で DDBJing 講習会を開催していく予定です。 DDBJ の利用に興味のあるみなさまの参加をお待ちしています。
 

過去の DDBJing 講習会

 

参考資料（講習会の予習ができます）

関係サイトへのリンク

DDBJ | CIB | NIG]
ddbjing@ddbj.nig.ac.jp
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