HOME > 利用の手引き > DDBJing 講習会
ここから本文です

「AJACS & 第22回DDBJing 講習会 in 東京」のお知らせ

AJACS ＆ 第22回 DDBJing 講習会は終了しました

講習会の資料は，こちらよりダウンロードできます

日 時 ：
 		 2010年6月23日（水）10時から 17時まで     （※受付は，9時30分より）
2010年6月24日（木）10時から 17時まで
場 所 ： ライフサイエンス統合データベースセンター　（東京大学本郷キャンパス　工学部12号館4階）
主 催 ： 大学共同利用機関法人　情報・システム研究機構　ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)
国立遺伝学研究所　生命情報・DDBJ 研究センター　日本 DNA データバンク（DDBJ）
対 象 ： DBCLS・DDBJ を利用される方をどなたでも歓迎します（定員30名）
参加費用 ： 無料
講習内容 ： DBCLS/DDBJ の Web サービスなどの利用についての講義と PC を用いた実習を行ないます。 講義内容をよりよく理解していただくために，PC を使用した実習を行ないます。 参加申込みに際しては，講習会の詳細の項を必ずお読み下さい。
講習会の詳細 ： [講習会の日程] [参加申込み方法] [PC について] [アクセス] [参考資料]

講習会の日程：

第1日目 6月23日（水）   10:00〜17:00
時間講義内容・講師
9:30-10:00 受付
10:00-10:15 統合データベースプロジェクトの紹介
高祖　歩美（ライフサイエンス統合データベースセンター　特任研究員）
10:15-11:30 カタログサービス・横断検索の利用法
川本　祥子（ライフサイエンス統合データベースセンター　特任准教授）
11:30-12:20 文献関連サービスの活用法
山本　泰智（ライフサイエンス統合データベースセンター　特任研究員）
12:20-13:30 昼食休憩
13:30-15:00 遺伝子発現情報を使い倒す
坊農　秀雅（ライフサイエンス統合データベースセンター　特任准教授）
15:00-15:20 休憩
15:20-16:10 BodyParts3D/Anatomographyの利用法
三橋　信孝（ライフサイエンス統合データベースセンター　特任研究員）
16:10-17:00 DBCLS Galaxyの利用法
山口　敦子（ライフサイエンス統合データベースセンター　特任准教授）
 
第2日目 6月24日（木）10:00〜17:00
時間講義内容・講師
10:00-11:30 DDBJ の紹介と配列データの検索
中村　保一 （国立遺伝学研究所　教授）
11:30-12:30 次世代シーケンサ配列の登録・データ解析
次世代シーケンサのクラウド型解析パイプライン（15分）
          神沼　英里 （国立遺伝学研究所　助教）
次世代シーケンサアーカイブDB （20分）
          児玉　悠一 （DDBJ 構築チーム　アノテータ）
クラウド型解析パイプライン・実習assembly/mapping（25分）
          望月　孝子　（国立遺伝学研究所　エンジニア）
12:30-13:30 昼食休憩
13:30-15:10 SAKURA を用いた塩基配列登録の方法・実習
小菅　武英（DDBJ 構築チーム　アノテータ）
15:10-15:30 休憩
15:30-17:00 相同性検索と系統解析：BLAST と ClustalW
中村　保一 （国立遺伝学研究所　教授）
 

参加申込み方法：

＊本講習会は終了しました。
 

PC について：

本講習会の実習で使用する PC は、Macintosh を貸し出し致します。
また，個人の PC を持ち込んで頂くことも可能です。
実習に必要な PC の条件は下記の通りです。
・無線LAN にてネットワーク接続が可能なこと
・ウイルス駆除ソフトにて検疫済みの PC であること
・OSとブラウザが最新の状態にアップデートされていること

ライフサイエンス統合データベースセンター（東京大学本郷キャンパス）までのアクセス：

ライフサイエンス統合データベースセンターは東京大学本郷キャンパス内にあります。
ライフサイエンス統合データベースセンターの交通案内（ライフサイエンス統合データベースセンターのサイトへ）
 

参考資料（講習会の予習ができます）

DDBJing 講習会とは？

国立遺伝学研究所の生命情報・DDBJ 研究センター (CIB-DDBJ; The Center for Information Biology and DNA Data Bank of Japan) には日本 DNA データバンク (DDBJ; DNA Data Bank of Japan) が設置されています。
DDBJ では，生物学研究者の皆様が決定された塩基配列の登録を受け付けて， それらを DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースに格納し公開することや， 塩基配列やアミノ酸配列などのデータベースを検索し解析するソフトを WWW などで広く提供することを行なっています。
DDBJing とは，DDBJ が提供するこれらのシステムを使っていただくことです。
これまで国立遺伝学研究所で8回，所外で12回開催していますが， DDBJ をより有効に活用していただくために， 今後も全国各地で DDBJing 講習会を開催していく予定です。 DDBJ の利用に興味のあるみなさまの参加をお待ちしています。
 

過去の DDBJing 講習会

ddbjing@ddbj.nig.ac.jp
▲このページの先頭へ