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「第24回 DDBJing 講習会 in 東京」 のお知らせ

＊本講習会は終了しました

  日　時 ： 2011年6月30日（木）10:00 〜 17:00   （受付は 9：30より）
  場　所 ： ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS)
東京大学工学部12号館4階 （アクセス）
  主　催 ： 国立遺伝学研究所　生命情報・DDBJ 研究センター　日本DNA データバンク（DDBJ）
ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS)
  対　象 ： DDBJ を利用される方をどなたでも歓迎します（定員20名）
  参加費 ： 無料
  内　容 ： 今回の講習会では，Next-Generation Sequencer(NGS) について中心に講義と実習を行ないます。 講義内容をよりよく理解して頂くために，PC を使用した実習を行ないます。
参加申込みに際しては，詳細の項を必ずお読み下さい。
  詳　細 ： [講習会の日程] [参加申込み方法] [PC について] [アクセス] [お問い合わせ]

講習会の日程

6月30日（木）  10:00〜17:00
時間講義内容・講師
 9:30-10:00 受付
10:00-10:30 DDBJ の紹介・データ受付など
中村　保一 （国立遺伝学研究所　教授）
10:30-11:10 NGS のベースコール精度とアセンブリ精度について
新井　理 （ビッツ株式会社　三島研究所 所長）
11:20-12:00 MiGAP〜微生物ゲノム注釈ツール利用法
大山　彰 （インシリコバイオロジー株式会社　代表取締役）
12:00-13:00 昼食休憩
13:00-13:30 DDBJ Sequence Read Archive (DRA) へのデータ登録
児玉　悠一 （DDBJ 構築チーム　アノテータ）
13:40-14:40 Pipeline 基礎（アセンブリ・マッピング）
望月　孝子 （国立遺伝学研究所　大量遺伝情報研究室）
14:50-15:50 Pipeline 高次（galaxyとゲノム・SNP 解析例）
長崎　英樹 （国立遺伝学研究所　大量遺伝情報研究室）
16:00-17:00 NGS 由来アセンブル配列の登録〜大量登録システム(MSS)
大城戸　利久 （DDBJ 構築チーム　アノテータ）
 

参加申込み方法

＊本講習会は終了しました
 

PC について

本講習会の実習で使用するPC は，各自ご持参下さい。
どうしてもPC をご用意できない方は，申込み受付時にご相談下さい。

【実習に必要なPC の条件は下記の通りです】
・無線LAN にてネットワーク接続が可能なこと
・ウイルス駆除ソフトにて検疫済みの PC であること
・OSとブラウザが最新の状態にアップデートされていること
（OS の状態を更新して頂いていましたら，Windows, Mac のどのOS でも問題ありません。
　ブラウザも現在問題なく見えるバージョンで構いません。）

アクセス

ライフサイエンス統合データベースセンター （〒113-0032　東京都文京区弥生2−11−16　東京大学工学部12号館4・5階）
東京大学本郷キャンパス（浅野地区）内にあります。アクセス

お問い合わせ

講習会に関するご意見ご質問，または開催のご要望がありましたら検討いたしますので， お問い合わせ の「講習会」までご連絡下さい。
 

資料

「第24回 DDBJing 講習会 in 東京」資料ダウンロード

DDBJing 講習会とは？

国立遺伝学研究所の生命情報・DDBJ 研究センター (CIB-DDBJ; The Center for Information Biology and DNA Data Bank of Japan) には， 日本 DNA データバンク (DDBJ; DNA Data Bank of Japan) が設置されています。
DDBJ では，生物学研究者の皆様が決定された塩基配列の登録を受け付けて， それらを DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースに格納し公開することや， 塩基配列やアミノ酸配列などのデータベースを検索し解析するソフトを WWW などで広く提供することを行なっています。
DDBJing とは，DDBJ が提供するこれらのシステムを使って頂くことです。
これまで国立遺伝学研究所で9回，所外で14回開催していますが， DDBJ をより有効に活用して頂くために， 今後も全国各地で DDBJing 講習会を開催していく予定です。 DDBJ の利用に興味のある皆様の参加をお待ちしています。
 

過去の DDBJing 講習会

ddbjing@ddbj.nig.ac.jp
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