「第25回 DDBJing 講習会 in 三島」 のお知らせ

*本講習会は終了しました

日 時:2012年1月26日(木)10:00 ~ 17:00 (受付は 9:30より)
場 所:国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ 研究センター 4F
主 催:日本DNA データバンク(DDBJ)
対 象:DDBJ を利用される方をどなたでも歓迎します(定員20名)
参加費:無料
内 容:今回の講習会では,「Next-Generation Sequencer(NGS) 由来のデータ解析(微生物を中心に)や
データ登録について講義と実習を行ないます。講義内容をよりよく理解して頂くために,PC を使用した
実習を行ないます。
参加申込みに際しては,詳細の項を必ずお読み下さい。
詳 細:[講習会の日程][PC について][アクセス][資料][お問い合わせ]

 

講習会の日程

1月26日(木) 10:00~17:00
時間講義内容・講師
9:30-10:00受付
10:00-10:05 はじめに
神沼 英里 (国立遺伝学研究所 助教)
10:05-10:30 DDBJ のNGS 対応
中村 保一 (国立遺伝学研究所 教授)
10:30-11:10 NGS マルチプレックス法による黄色ブドウ球菌de novo アセンブリ
佐々木 貴史 (慶應義塾大学医学部 特別研究講師)
11:20-12:00 MiGAP~微生物ゲノム注釈ツール利用法
大山 彰 (インシリコバイオロジー株式会社 代表取締役)
12:00-13:00昼食休憩
13:00-13:40 DBCLS Galaxy: ツール群, 日本語統合環境, etc.
山口 敦子(DBCLS 特任准教授)
13:40-14:10 DDBJ Sequence Read Archive(DRA) の紹介
児玉 悠一 (DDBJ 構築チーム アノテータ)
14:10-15:00 DDBJ pipeline 基礎(de novo assembly)
望月 孝子 (国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室)
15:15-15:45 DDBJ pipeline 高次部(galaxy : contig annotation workflow)
長崎 英樹 (国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室)
15:45-16:15 DDBJ pipeline 高次部(galaxy : 系統樹解析)
猿橋 智 (国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室)
16:15-16:55 NGS 由来アセンブル配列の登録~大量登録システム(MSS)
大城戸 利久(DDBJ 構築チーム アノテータ)

 

PC について

本講習会の実習で使用するPC は,各自ご持参下さい。どうしてもPC をご用意できない方は,申込み受付時にご相談下さい。
【実習に必要なPC の条件は下記の通りです】
・ 無線LAN にてネットワーク接続が可能なこと
・ ウイルス駆除ソフトにて検疫済みのPC であること
・ ご利用のOS(MacX, WindowsXP, 7 など) とブラウザが最新の状態にアップデートされていること

 

アクセス

〒411-8540  静岡県三島市谷田1111 国立遺伝学研究所 (アクセス) 生命情報・DDBJ 研究センター 4F
・ JR三島駅から国立遺伝学研究所までタクシーで15分(約1500円)・バスで20分(240円)
  JR三島駅バス発着時刻表
 

資料

「第25回 DDBJing 講習会 in 三島」資料ダウンロード
  (今回使用する資料は,準備ができ次第受講者へご連絡いたします)
DDBJing 講習会資料ダウンロード(過去のDDBJing 講習会資料)
 

お問い合わせ

講習会に関するご意見ご質問,またはご要望等がありましたら検討いたしますので,お問い合わせ の「講習会」までご連絡下さい。
 

参加申込み

参加申込みは締切りました
 

DDBJing 講習会とは?

国立遺伝学研究所の生命情報・DDBJ 研究センター (CIB-DDBJ; The Center for Information Biology and DNA Data Bank of Japan) には,日本DNA データバンク (DDBJ; DNA Data Bank of Japan) が設置されています。
DDBJ では,生物学研究者の皆様が決定された塩基配列の登録を受け付けて,それらを DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースに格納し公開することや,塩基配列やアミノ酸配列などのデータベースを検索し解析するソフトを WWW などで広く提供することを行なっています。
DDBJing とは,DDBJ が提供するこれらのシステムを使って頂くことです。
これまで国立遺伝学研究所で9回,所外で15回開催していますが, DDBJ をより有効に活用して頂くために,今後も全国各地で DDBJing 講習会を開催していく予定です。 DDBJ の利用に興味のある皆様の参加をお待ちしています。
 

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