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※ご覧になりたい回をクリックすると内容が表示されます。「第26回 DDBJing 講習会 in 三島」 2013年1月24日
- 場所:国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ 研究センター4階
定員:20名
テーマ:大規模計算機を利用した配列解析とDDBJ データ登録
講議タイトル・講師DDBJ のNGS 対応(配布資料なし)
中村 保一 (国立遺伝学研究所 教授)DDBJ 新塩基配列登録システム:Web から塩基配列を登録する
小菅 武英(DDBJ 構築チーム アノテータ)イオントレントデータ解析におけるクラウド環境の活用(配布資料なし)
古川 貴久(ライフテクノロジーズジャパン株式会社)NIG SuperComputer の紹介と見学
川越 千晴(国立遺伝学研究所 スパコン担当SE)クラウドサービス BaseSpace が変える次世代シーケンサーデータ解析(配布資料なし)
鈴木 健介(イルミナ株式会社 マーケティング部)MiGAP:微生物ゲノム注釈ツール利用法
大山 彰(インシリコバイオロジー株式会社)DDBJ Sequence Read Archive(DRA), DDBJ BioProject の紹介
児玉 悠一(DDBJ 構築チーム アノテータ)大量登録システム(MSS):大規模アセンブル配列の登録
大城戸 利久 (DDBJ 構築チーム アノテータ)- 講義の様子はUstream よりご覧頂けます。
「第25回 DDBJing 講習会 in 三島」 2012年1月26日
- 場所:国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ 研究センター4階
定員:20名
テーマ:Next-Generation Sequencer(NGS) 由来のデータ解析(微生物を中心に)やデータ登録
講議タイトル・講師DDBJ のNGS 対応
中村 保一 (国立遺伝学研究所 教授)NGS マルチプレックス法による黄色ブドウ球菌de novo アセンブリ
佐々木 貴史 (慶應義塾大学医学部 特別研究講師)MiGAP~微生物ゲノム注釈ツール利用法
大山 彰 (インシリコバイオロジー株式会社 代表取締役)DBCLS Galaxy: ツール群, 日本語統合環境, etc.
山口 敦子(DBCLS 特任准教授)DDBJ Sequence Read Archive(DRA) の紹介
児玉 悠一 (DDBJ 構築チーム アノテータ)DDBJ pipeline 基礎(de novo assembly)
望月 孝子 (国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室)DDBJ pipeline 高次部(galaxy : contig annotation workflow)
長崎 英樹 (国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室)DDBJ pipeline 高次部(galaxy : 系統樹解析)
猿橋 智 (国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室)NGS 由来アセンブル配列の登録~大量登録システム(MSS)
大城戸 利久 (DDBJ 構築チーム アノテータ)「第24回 DDBJing 講習会 in 東京」 2011年6月30日
- 場所:ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) 東京大学工学部12号館4階
定員:20名
講議タイトル・講師DDBJ の紹介・データ受付など
中村 保一 (国立遺伝学研究所 教授)NGS のベースコール精度とアセンブリ精度について
新井 理 (ビッツ株式会社 三島研究所 所長)MiGAP~微生物ゲノム注釈ツール利用法
大山 彰 (インシリコバイオロジー株式会社 代表取締役)DDBJ Sequence Read Archive (DRA) へのデータ登録
児玉 悠一 (DDBJ 構築チーム アノテータ)Pipeline 基礎(アセンブリ・マッピング)
望月 孝子 (国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室)Pipeline 高次(galaxyとゲノム・SNP 解析例)
長崎 英樹 (国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室)NGS 由来アセンブル配列の登録~大量登録システム(MSS)
大城戸 利久 (DDBJ 構築チーム アノテータ)「第23回 DDBJing 講習会 & PDBj 講習会 in 長浜」 2011年1月17-18日
- 場所:長浜バイオ大学 命江館3階 語学実習室
定員:40名
講議タイトル・講師[1日目]PDBj と wwPDB
中村 春木(大阪大学蛋白質研究所・教授)構造からの機能予測法入門
木下 賢吾(東北大学大学院情報科学研究科・教授)(実習 1)PDBj Mine の使い方
金城 玲 (大阪大学蛋白質研究所・准教授)(実習 2)複雑な構造(電子顕微鏡構造・複合体構造)の見方
鈴木 博文 (大阪大学蛋白質研究所・特任研究員)[2日目]DDBJ の紹介と大量配列のためのクラウド型計算機資源利用法
中村 保一 (国立遺伝学研究所 教授)次世代シークエンサ(NGS)概論とクラウド型解析ツール DDBJ Pipeline
神沼 英里 (国立遺伝学研究所 助教)NGS 登録データベース DDBJ Sequence Read Archive
猿橋 智 (DDBJ 構築チーム アノテータ)NGS クラウド型解析ツール DDBJ Pipeline 実習
望月 孝子 (国立遺伝学研究所 エンジニア)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法・実習
真島 淳 (DDBJ 構築チーム アノテータ)「第22回 DDBJing 講習会 & AJACS in 東京」 2010年6月23-24日
- 場所:ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) 東京大学工学部12号館4階
定員:30名
講議タイトル・講師[1日目]統合データベースプロジェクトの紹介
高祖 歩美(ライフサイエンス統合データベースセンター 特任研究員)カタログサービス・横断検索の利用法
川本 祥子(ライフサイエンス統合データベースセンター 特任准教授)文献関連サービスの活用法
山本 泰智(ライフサイエンス統合データベースセンター 特任研究員)遺伝子発現情報を使い倒す
坊農 秀雅(ライフサイエンス統合データベースセンター 特任准教授)BodyParte3D/Anatomography の利用法
三橋 信孝(ライフサイエ>ンス統合データベースセンター 特任研究員)DBCLS Galaxy の利用法
山口 敦子(ライフサイエンス統合データベースセンター 特任准教授)[2日目]DDBJ の紹介と配列データの検索
中村 保一 (国立遺伝学研究所 教授)次世代シーケンサ配列の登録・データ解析:次世代シーケンサのクラウド型パイプライン
神沼 英里 (国立遺伝学研究所 助教)次世代シーケンサ配列の登録・データ解析:次世代シーケンサアーカイブ DB
児玉 悠一 (DDBJ 構築チーム アノテータ)次世代シーケンサ配列の登録・データ解析:クラウド型解析パイプライン・実習assembly/mapping
望月 孝子 (国立遺伝学研究所 エンジニア)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法・実習
小菅 武英(DDBJ 構築チーム アノテータ)相同性検索と系統解析:BLAST とClustalW
望月 孝子 (国立遺伝学研究所 エンジニア)「第21回 DDBJing 講習会 in 三島」 2009年6月17-18日
- 場所:国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ 研究センター 2階会議室
定員:30名
講議タイトル・講師[1日目]DDBJ ホームページの使い方
真島 淳 (DDBJ 構築局アノテータ)データベース検索実習1:キーワード検索を中心に
中村 保一 (国立遺伝学研究所 教授)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法・実習
小菅 武英 (DDBJ 構築局アノテータ)[2日目]データベース検索実習2:FASTA, BLAST, PSI-BLAST, HMMPFAM の使い方
中村 保一 (国立遺伝学研究所 教授)スパコン棟見学
DDBJ スタッフShort Reads データ解析例の紹介
神沼 英里 (国立遺伝学研究所 助教)Short read archive(SRA)登録紹介
児玉 悠一 (DDBJ 構築局アノテータ)大量登録の紹介
野崎 亜沙美 (DDBJ 構築局アノテータ)分子進化解析入門(ClustalW)
中村 保一 (国立遺伝学研究所 教授)「第20回 DDBJing 講習会 & KEGGing 講習会 & PDBjing 講習会 in 京都」 2008年11月27-28日
- 場所:京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター
定員:30名
講議タイトル・講師[1日目]DDBJ の紹介
舘野 義男 (DDBJ バンク長)データ検索から系統樹作成まで
斎藤 成也(国立遺伝学研究所・ 教授)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法
大城戸 利久 (DDBJ 構築局アノテータ)ライフサイエンス統合 DB のサービス紹介
川島 秀一 (東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター・助教)[2日目]KEGG GENES の利用法
守屋 勇樹(京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター・研究員)KEGG LIGAND の利用法
服部 正泰(京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター・助教)KEGG PATHWAY の利用法
五斗 進 (京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター・准教授)PDBj の紹介
中村 春木(大阪大学蛋白質研究所・教授)PDBj へのデータ登録方法
松浦 孝範 (大阪大学蛋白質研究所・客員准教授)PDBj のデータ検索サービスと二次データベース
金城 玲(大阪大学蛋白質研究所・客員准教授)ウェブサービスによる国内外データベースの統合的な活用
片山 俊明 (東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター・助教)「第19回 DDBJing 講習会 in 三島」 2008年6月18-19日
- 場所:国立遺伝学研究所・生命情報・DDBJ 研究センター 2階会議室
定員:30名
講議タイトル・講師[1日目]DDBJ ホームページの使い方
真島 淳 (DDBJ 構築局アノテータ)データベース検索実習1:キーワード検索を中心に
小笠原 理 (国立遺伝学研究所 助教)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法・実習 及びDDBJ 遺伝子発現データベースCIBEX の簡単なご紹介
児玉 悠一 (DDBJ 構築局アノテータ)[2日目]データベース検索実習2:FASTA, BLAST の使い方
鈴木 善幸 (国立遺伝学研究所 助教)スパコン棟見学
DDBJ スタッフ学部教育におけるDDBJ の活用について
阿部 貴志 (長浜バイオ大学 助教)GTOP を中心としてタンパク質データベース
福地 佐斗志 (国立遺伝学研究所 助教)分子進化解析入門(ClustalW)
隅山 健太 (国立遺伝学研究所 助教)「第18回 DDBJing 講習会 & 寺子屋『情報生物学』 in 香川」 2007年11月29-30日
- 場所:香川大学医学部 看護学科教育研究棟2階マルチメディア実習室
定員:100名
講議タイトル・講師[1日目]バイオインフォマティクス入門
舘野 義男(国立遺伝学研究所 教授)ゲノム進化学入門
斎藤 成也(国立遺伝学研究所 教授)遺伝子発現解析入門
池尾 一穂(国立遺伝学研究所 准教授)[2日目]DDBJ 活動全体の紹介
斎藤 成也(国立遺伝学研究所 教授)SAKURA を中心とする塩基配列登録の方法と実習
小菅 武英(DDBJ 構築局アノテータ)ARSA を中心とするデータベースの検索方法と実習
峯崎 善章(国立遺伝学研究所 助教)BLAST を中心とする相同性検索の方法と実習
鈴木 善幸(国立遺伝学研究所 助教)GIB, GIB-V, GTPS を用いた小型ゲノム解析の紹介
小菅 武英(DDBJ 構築局アノテータ)GTOP などを用いたタンパク質構造分析法の紹介
福地 佐斗志(国立遺伝学研究所 助教)「第17回 DDBJing 講習会 in 三島」 2007年5月29-30日
- 場所:国立遺伝学研究所・生命情報・DDBJ 研究センター 2階会議室
定員:30名
講議タイトル・講師[1日目]DDBJ の紹介
舘野 義男(日本DNAデータバンク バンク長/国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・教授)getentry, ARSA, SRS の検索実習
小笠原 理(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助教)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法・実習
李慶範(国立遺伝学研究所 DDBJ 構築局アノテータ)[2日目]FASTA, BLAST の検索実習
鈴木 善幸(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助教)完全ゲノムデータの利用 GIB, GIB-V, GTPS
阿部 貴志(国立遺伝学研究所 データベース運用開発研究室)ClustalW の講義と実習
鈴木 善幸(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助教)「第16回 DDBJing 講習会 & PDBjing 講習会 in 東京」 2006年12月21-22日
- 場所:東京工業大学 大岡山キャンパス 情報ネットワーク演習棟
定員:30名
講議タイトル・講師[1日目]DDBJ の紹介
坂井 勝呂(DDBJ 構築局アノテータ)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法・講議及び実習
坂井 勝呂(DDBJ 構築局アノテータ)PDBj の紹介とHP の使い方
中村 春木(大阪大学蛋白質研究所・教授)PDBj の各種サービスの基本的な使い方(講議と実習)
金城 玲(大阪大学蛋白質研究所・客員助教授)[2日目]PDBML 入門(講議と実習)
金城 玲(大阪大学蛋白質研究所・客員助教授)GTOP の利用法・講議および実習
福地 佐斗志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)たんぱく質表面形状と物性データベース,eF-site
木下 賢吾(東京大学医科学研究所・助教授)「第15回 DDBJing 講習会 in 三島」 2006年6月14-15日
- 場所:国立遺伝学研究所・生命情報・DDBJ 研究センター 2階会議室
定員:30名
講議タイトル・講師[1日目]INSDC の概略とDDBJ HP の利用法(英語による講議)
Barrero Roberto(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法・講議
野崎 亜沙美(DDBJ 構築局アノテータ)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法・実習
野崎 亜沙美(DDBJ 構築局アノテータ)H-Invitational Database の紹介
大城戸 利久(DDBJ 構築局アノテータ)[2日目]データベース検索実習1(キーワード検索を中心に) - getentry, SRS, ARSA の使い方
小笠原 理(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)データベース検索実習2(相同性検索を中心に) - FASTA, BLAST の使い方
池尾 一穂(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助教授)ゲノム配列解析ツール(Genome Analysis Tools: GAT) と第三者アノテーション
阿部 貴志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)GTOP の利用法・講議および実習
福地 佐斗志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)分子進化解析入門 (ClustalW)
隅山 健太(国立遺伝学研究所 集団遺伝研究部門・助手)DDBJ の展望「生命科学データベースの現状と課題」
大久保 公策(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・教授)「第14回 DDBJing 講習会 & PDBjing 講習会 in 大阪」 2006年2月2-3日
- 場所:大阪大学中之島センター・キャンパスイノベーションセンター7階 講義室2
定員:30名
講議タイトル・講師[1日目]DDBJ の利用法
斎藤 成也(国立遺伝学研究所集団遺伝研究部門・教授)DDBJ のサービスの紹介と実習 その1 - 検索を中心に:ARSA の使い方
斎藤 成也(国立遺伝学研究所集団遺伝研究部門・教授)PDBj の紹介とHP の使い方
中村 春木(大阪大学蛋白質研究所・教授)PDBj のサービスの紹介と実習 その1 - xPSSS による蛋白質立体構造データの検索法の実習
伊藤 暢聡(東京医科歯科大学大学院・教授)[2日目]ゲノム進化学入門
斎藤 成也(国立遺伝学研究所集団遺伝研究部門・教授)PDBj のサービスの紹介と実習 その2 - Structure Navigator/ Sequence Navigator/ GASH の講義と実習
Daron M. Standley(JST-BIRD・研究員)DDBJ のサービスの紹介と実習 その2 - GTOP データベースの利用法についての講義と実習
金城 玲(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)タンパク質の構造予測とその周辺
金城 玲(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)タンパク質表面形状と物性データベース,eF-site
木下 賢吾(東京大学医科学研究所・助教授)「第13回 DDBJing 講習会 in 東京農大」 2005年9月1-2日
- 場所:東京農業大学世田谷キャンパス 18号館3階コンピューター演習室3
定員:一般募集はなし
講議タイトル・講師[1日目]DDBJ の利用法
菅原 秀明(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ*・教授)データベース検索実習1 - キーワード検索を中心に: getentry, SRS, ARSA の使い方
阿部 貴志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)データベース検索実習2 - 相同性検索を中心に:BLAST/FASTA の簡単な説明 (アルゴリズム・パラメータ 紹介と使い方)
阿部 貴志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)遺伝子発現データベース - 遺伝発現データ活用・将来展望の観点から
池尾 一穂(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助教授)[2日目]分子進化解析入門・実習 - ClustalW から系統樹作成へ
鈴木 善幸(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)タンパク質データの利用法・講議および実習 - UniProt の紹介,GTOP の利用法など
福地 佐斗志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法(講議)
林 意雀(DDBJ 構築局アノテータ)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法(実習) - CDS, 16S rRNA 等の登録の実習
林 意雀(DDBJ 構築局アノテータ)完全ゲノムのデータの利用 - GIB, G-InforBIO
平畠 壮規・田中 尚人(国立遺伝学研究所データベース運用開発研究室)「第12回 DDBJing 講習会 in 三島」 2005年6月8-9日
- 場所:国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ研究センター 2階会議室
定員:30名
講議タイトル・講師[1日目]DDBJ/EMBL/GenBank データベースの概要
舘野 義男(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・教授)web を使ったDDBJ の利用
市川 恵子(DDBJ 情報局)データベース検索実習1(キーワード検索を中心に) getentry, SRS, ARSA の使い方
阿部 貴志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)データベース検索実習2(相同性検索を中心に) BLAST/FASTA の簡単な説明と使い方
阿部 貴志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)分子進化解析入門
鈴木 善幸(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)[2日目]完全ゲノムのデータを入手する
平畠 壮規(国立遺伝学研究所 データベース運用開発研究室)GTOP の利用法・講議および実習
福地 佐斗志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法(講議)
林 意雀(DDBJ 構築局アノテータ)SAKURA を用いた塩基配列登録の方法(実習)
林 意雀(DDBJ 構築局アノテータ)遺伝子発現データベース
池尾 一穂(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助教授)遺伝研スーパーコンピュータの利用
金城 玲(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)「第11回 DDBJing 講習会 & PDBjing 講習会 in 大阪」 2005年3月2日
- 場所:大阪大学中之島センター・キャンパスイノベーションセンター2階 講義室2
定員:30名
講議タイトル・講師DDBJ の概略とHP の使い方
金城 玲(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)SAKURA を用いた塩基配列データ登録の概説・模擬登録実習
大城戸 利久(DDBJ 構築局・アノテータ)PDBj の紹介とHP の使い方
中村 春木(大阪大学蛋白質研究所・教授)xPSSS による蛋白質立体構造データの検索法の実習
中村 春木(大阪大学蛋白質研究所・教授)ADIT による立体構造データ登録法と実習
小佐田 高史(大阪大学蛋白質研究所・技術職員)全ゲノム立体構造予測データベースGTOP の使い方
福地 佐斗志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)「第10回 DDBJing 講習会 in 三島」 2004年7月7-8日
- 場所:国立遺伝学研究所 ゲストハウス2階セミナー室
定員:30名
講議タイトル・講師[1日目]新しいHP を使った DDBJing
斎藤 成也(国立遺伝学研究所 集団遺伝研究部門・教授)データ登録入門編:SAKURA による塩基配列データ登録の概論
真島 淳(DDBJ 構築局・アノテータ)データ登録実習編:SAKURA による模擬登録実習
真島 淳(DDBJ 構築局・アノテータ)[2日目]データベース検索入門編:相同性検索の仕組みと使い方を中心に
阿部 貴志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)データベース検索実習編:相同性検索の仕組みと使い方を中心に
阿部 貴志(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)データ登録応用編:大量塩基配列データ登録の概論
真島 淳(DDBJ 構築局・アノテータ)ゲノム時代のタンパク質データベース "GTOP" について
西川 建(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・教授)XML 技術の広がり
菅原 秀明(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・教授)発現データとデータベース
伊藤 孝一(国立遺伝学研究所 CIB-DDBJ・助手)「第9回 DDBJing 講習会 & 第6回 情報生物学『寺子屋』 in 東京」 2004年3月28日
- 場所:国立情報学研究所学術総合センター 一橋記念講堂中会議場
定員:200名
講議タイトル・講師Web サービスによるDDBJ の活用について
宮崎 智(遺伝研生命情報・DDBJ 研究センター・助教授)DDBJ への塩基配列の登録について
坂井 勝呂(DDBJ 構築局・アノテータ)バイオインフォマティクス研究におけるDDBJ の役割
五條堀 孝(遺伝研生命情報・DDBJ 研究センター長)生物学知識をどう扱うか?
大久保 公策(遺伝研生命情報・DDBJ 研究センター・教授)ゲノム規模立体構造予測データベース・GTOP
福地 佐斗志(遺伝研生命情報・DDBJ 研究センター・助手「第8回 DDBJing 講習会 in 遺伝学会」 2003年9月24日
- 場所:日本遺伝学会第75回大会 東北大学 川内北キャンパス B会場 (B201)
講議タイトル・講師DDBJ の利用法~データベースとソフトウエア~
池尾一穂(国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ 研究センター・助教授)「第7回 DDBJing 講習会 in 高知」 2003年8月29日
- 場所:高知医科大学 看護学科棟2階情報処理実習室
定員:30名
講議タイトル・講師DDBJ 活動の概略
深海薫(理化学研究所バイオリソースセンター)SAKURA を用いたデータ登録法
小菅武英(DDBJ 構築局・アノテータ)SAKURA を用いないデータ登録法
小菅武英(DDBJ 構築局・アノテータ)配列検索方法 (getentry, SRS)
深海薫(理化学研究所バイオリソースセンター)配列から系統樹まで (BLAST, CLUSTALW)
深海薫(理化学研究所バイオリソースセンター)GIB の紹介
小菅武英(DDBJ 構築局・アノテータ)GTOP の紹介
福地佐斗志(遺伝研生命情報・DDBJ 研究センター・助手)「第6回 DDBJing 講習会 in 三島」 2002年1月30-31日
- 場所:国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ 研究センター3階
定員:30名
講議タイトル・講師[1日目]DDBJ とは?
舘野義男(遺伝研生命情報・DDBJ 研究センター・教授)DDBJ web の使い方概論
深海薫(遺伝研生命情報・DDBJ 研究センター・助手)SAKURA を中心とした塩基配列データの登録法
岡田あゆみ(DDBJ 構築局・アノテーター)SRS を中心とした検索方法
DDBJ データベース運用開発局[2日目]GIB の活用
DDBJ データベース運用開発局生命情報学分野におけるXML の評価とDDBJ の取り組み
宮崎智(遺伝研生命情報・DDBJ 研究センター・助手)DDBJ と計算機センターの見学
DDBJ 情報局生命情報学と分子進化学
池尾一穂(遺伝研生命情報・DDBJ 研究センター・助手)ヒトゲノム配列データベースと多型データベースの活用
今西規((独)産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター統合データベース解析グループ・チームリーダー)GTOP の利用を中心とするタンパク質立体構造予測
西川建(遺伝研生命情報・DDBJ 研究センター・教授)「第5回 DDBJing 講習会 in 東京」 2001年9月3日
- 場所:国立情報学研究所 学術総合センタービル2階 中会議場2~4
定員:150名
講議タイトル・講師日本DNA データバンクと「DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベース」
舘野義男塩基配列データの登録法
青野英雄DDBJ データベースの検索法(キーワード検索,相同性検索,種名検索など)
深海薫DDBJ ClustalW の利用法(多重整列から系統樹作成まで)
斎藤成也DDBJ から利用できるタンパク質立体構造解析ツール
太田元規「第4回 DDBJing 講習会 in 福岡」 2000年11月30日
- 場所:九州大学情報基盤センター情報サロン(箱崎キャンパス)
定員:36名
講議タイトル・講師DDBJ 活動の概略とデータベースの検索法
斎藤成也分子進化学的データ解析法
深海薫SAKURA を用いたデータ登録法
鈴木満美(データベース構築局)登録データの更新と大量データ登録法
島田明美(データベース構築局)「第3回 DDBJing 講習会 in 三島」 2000年8月23日
- 場所:国立遺伝学研究所 生命情報研究センター
定員:30名
講議タイトル・講師DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースについて
舘野義男DDBJ Web の使い方
斎藤成也解析ソフトの使い方
深海薫新SAKURA の使い方
データベース構築局検索ソフト(SRS など)の使い方
運用開発局「第2回 DDBJing 講習会 in 札幌」 1999年11月10日
- 場所:北海道大学地球環境科学研究科 講堂
定員:50名
講議タイトル・講師日本DNA データバンクと「DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベース」
斎藤成也DDBJ への塩基配列登録の方法(SAKURA・大量登録ツールMST などの利用))
真島淳・橋爪亜紀DDBJ のwww 活用方法(キーワード検索,FASTA/BLAST 相同性検索など)
斎藤成也・大藤由紀子塩基配列・アミノ酸配列から系統樹を作成する方法
斎藤成也「第1回 DDBJing 講習会 in 三島」 1999年9月13日
- 場所:国立遺伝学研究所 生命情報研究センター2階AV 室
定員:30名
講議タイトル日本DNA データバンクと「DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベース」DDBJ への塩基配列登録の方法(SAKURA・大量登録ツールMST などの利用)データベース検索の基礎(キーワード検索,FASTA/BLAST 相同性検索など)分子進化解析入門(多重整列,遺伝子系統樹作成,同義・非同義置換数推定など)タンパク質立体構造解析入門(PDB ブラウザー,二次構造・立体構造予測など) - 場所:国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ 研究センター4階
