DDBJ Web Magazine No.85 2013年9月3日 DDBJ 発行

（予告）「第28回 DDBJing 講習会 in 新潟」開催予定

DDBJ では、DDBJ のサービスをより有効に活用して頂くため「DDBJing 講習会」を開催しております。

2013年11月、新潟にて DDBJing 講習会を開催する予定です。
日時場所、プログラム等の詳細は、決まり次第 DDBJ ホームページや Twitter などでお知らせいたします。
みなさまのご参加をお待ちしております。

過去の DDBJing 講習会についてはこちらをご覧ください。

第26回国際実務者会議報告

DDBJ, EBI, NCBI で構成される International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC) は、その共同事業の運営・推進を図るために、国際実務者会議を年１回開催しています。
2013年は 5月21日-23日に EBI で開催され、DDBJ、EMBL-Bank、GenBank、Sequence Read Archive (SRA)、Trace Archive を運営する上での実務的な問題を討論しました。
会議の報告はこちらをご覧ください。

8/21 の落雷によるサービス停止のお詫び

8月21日（水） 19:00頃の静岡県東部地区（DDBJ 所在地）への落雷が原因の停電により、国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステムが緊急停止したため、DDBJ HP を含めてDDBJ の多くのサービスが停止いたしました。

8月23日（金）に全てのサービスが再開いたしましたが、長時間にわたるサービス停止となり、ユーザの皆さまには大変なご迷惑をおかけいたしましたことをお詫びいたします。

EMBL-Bank 由来 TPA データの不備についてお詫び

EMBL-Bank 由来の TPA データを分ける処理に不具合があり、一部データに不備が生じていたことが判明しました。
詳細は以下の通りです。

対象： EMBL-Bank 由来の一部の TPA データ 865 entries

  HE804769-HE804772
  HG322958-HG323812
  BN001513-BN001519
  FR749997

期間： 2013.04.24 ～ 2013.07.27
影響サービス： anonymous FTP，getentry

状況：
anonymous FTP について: TPA データは、本来であれば、primary data とは別のディレクトリ (/ddbj_database/tpa/ddbjnew/) で区別して公開しますが、 primary data とともに下記のファイルに含まれています。

directory: ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/ddbjnew/
file name: DDBJNEWr93.043.dat.gz （HG322958-HG323812 を含む）
           DDBJNEWr93.046.dat.gz （HG322958-HG323812 を含む）
           DDBJNEWr93.050.dat.gz （BN001513-BN001519,FR749997 を含む）
           DDBJNEWr93.054.dat.gz （HG322958-HG323812 を含む）
           DDBJNEWr93.056.dat.gz （HG322958-HG323812 を含む）
           DDBJNEWr93.065.dat.gz （HG322958-HG323812 を含む）

getentry について: 該当するエントリが格納されていませんでした。

対応： 問題のあったソフトウェアを修正しました。
anonymous FTP について: 該当する TPA エントリは DDBJ 定期リリース 94 以降に正しく再配置されます。
getentry について: 該当する TPA エントリは既に getentry に格納されています。

ユーザの皆様にご迷惑をお掛けいたしました事を深くお詫び申し上げます。

サンゴに共生するカッチュウソウ (Symbiodinium minutum) ゲノム配列データの公開

沖縄科学技術大学院大学から登録されたサンゴに共生するカッチュウソウ (Symbiodinium minutum) のゲノム配列データが公開されました。

参考; サンゴ共生カッチュウソウのゲノム解読

アクセッション番号は以下の通りです。getentry または DRASearch から検索可能です。

    scaffold CON: DF239013-DF260911 (21,899 entries)
    WGS: BASF01000001-BASF01033816 (BASF.gz) (33,816 entries)
    raw data: DRR003834-DRR003864

    GSS: GA393224-GA605429 (212,206 entries)

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