隔月公開の DDBJ メールマガジン第４号 web 版です。
今回はニュースに合わせて公開を少し遅らせました。どうぞご覧下さい。
  

マウス完全長 cDNA および超大量 EST データ本日公開理化学研究所ゲノム科学総合研
究センターの遺伝子構造・機能研究グループ（林崎良英プロジェクトディレクター）
から，マウス(Mus musculus) EST データ 766,243 件および完全長 cDNA データ
40,803 件が DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースに公開されました。
完全長 cDNA データは既公開データと合わせて，総計 59,971 件となりました。完全
長 cDNA には同グループが主催した FANTOM2 (Functional ANnoTation Of Mouse) で
付けられた機能アノテーションが付与され，HTC Division として登録されています。
今回公開されたデータは以下のとおりです。

＜HTC＞
Update エントリ：AK002213-AK018700, AK018701-AK021412, AK027261-AK027262
新規公開エントリ：AK027903-AK054560, AK075567-AK090394, AK117103-AK117104
 (一部、未公開エントリーを含む)
＜EST＞ 
新規公開エントリ：BY000001-BY766243

また，HTC データに関しては，既存データ 19,168 件を含めた全件に対して，quality 
score (Phrap score) もあわせて公開されました。
なお，この配列データに関する論文は Nature 420, 563-573 (21 Nov 2002) に発表さ
れました。
  

イネ（Oryza sativa (japonica cultivar-group)）染色体１番のほぼ完全な塩基配列が
独立行政法人農業生物資源研究所および農林水産先端技術産業振興センターで構成され
るイネゲノム研究チーム (RGP) によって決定され，Nature 420, 312-316 (21 Nov 
2002) に発表されました。この配列は DDBJ に登録され，DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基
配列データベースから公開されています。DDBJ ではこのデータを複数のエントリを１
つにまとめた CON エントリとしても公開しています。アクセッション番号は BA000010
です。
イネゲノムの全塩基配列の解明は国際イネゲノム塩基配列解析プロジェクトによって進
められています。
４番染色体の配列も中国科学院上海生理研究所国立遺伝子研究センターによって決定さ
れ，Nature 420, 316-320 (21 Nov 2002) に発表されました。
  

11月3日に DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースから公開しているデータの件
数が2000万件を超えました。
12月4日現在の総エントリ数: 20,966,349　総塩基数: 27,577,599,691 bp
  

DDBJ では，国際塩基配列データベースの構築業務を2002年12月28日（土）から2003年
1月5日（日）まで休業いたします。
これにともない，SAKURA によるデータ受け付けは 2002年12月27日（金）から2003年
1月5日（日）までご利用になれません。エントリの新規および再公開も，12月28日から
1月6日まで行われません。検索解析サービスはご利用いただくことができます。
皆様のご理解・ご協力をお願い申し上げます。
  

12/11-14 にパシフィコ横浜で開催される第25回分子生物学会に DDBJ ブースを出展し
ます。このブースでは PC によるデモをはじめ「塩基配列の登録」「検索・解析サー
ビス」に関する資料の配布など DDBJ の紹介を行なう予定です。
ブース番号は 522 番です。

第25回分子生物学会のサイト
  

port 番号の変更にともない getentry の URL を変更して２ヶ月が経ちました。現在，
移行期間として新旧両方の URL をご利用いただくことができますが，旧 URL は2003
年 1月31日をもって停止します。ブックマークやリンクをしている方，個々のエント
リに旧 URL でリンクを設定している方はご注意下さい。

　英語版：http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/
　日本語版：http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/top-j.html
詳細はこちらをご覧下さい。