冬は富士山がきれいに見える季節です。おそらく，多くの方のイメージする富士山は，今日のような青い空と白い雪のコントラストも鮮やかな姿だと思います（DDBJ HP トップページでご確認ください）が，富士はさまざまな表情を見せる山で，その色も赤，オレンジ，ピンク等々美しく変化します。 地球の自然環境が急速に変化しつつある中，この美しい富士の姿がいつまでも変わらずに見られることを願っています。 隔月公開の DDBJ メールマガジン第41号 web 版です。メールマガジンに関するご質問やご意見がありましたら までどうぞ。

DDBJ では，現在，キーワード検索サービスとして，ＳＲＳ(Sequence Retrieval System)　と ＡＲＳＡ(All-round Retrieval of Sequence and Annotation) の２つのシステムを WWW ならびに WABI にて提供しておりますが，2008年12月末日をもちまして，WWW，WABI ともに，ＳＲＳ の提供を終了することになりました。
1999年1月に WWW 版を公開して以来，長らく ＳＲＳ をご利用いただいておりますユーザの方には ＡＲＳＡ に乗り換えていただくお手間をおかけすることになり恐縮ですが，今後は ＡＲＳＡ をご愛用くださいますようお願いいたします。
ＳＲＳ と ＡＲＳＡ の比較の詳細につきましては，こちらをご参照下さい。

ARSA は DDBJ が WWW ならびに Web API で提供している高速なキーワード検索サービスです。
このたび ARSA の機能強化として， Quick Search 等の入力窓から簡易に「NOT 検索」を行える機能を追加いたしました。
例えば，以下のような検索が可能となります。

DDBJ が登録を受付け，2008年10月から12月にかけて DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースから公開した大量データは以下の通りです。

マウス海馬由来 CAGE MGA 552,486エントリの新規公開 2008.12.16
理化学研究所から登録されたマウス海馬由来 CAGE の MGA データ552,486 エントリが公開されました。

これらは12/11分の新着データとしてDDBJより公開されております。

シロアリ腸内細菌 CfPt1-2 ゲノム配列 5 エントリの新規公開
理化学研究所から登録されたシロアリの腸内原生生物の細菌内共生細菌 CfPt1-2 (Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2) の全ゲノム配列データ 5 エントリが公開されました。getentry より検索可能です。
アクセッション番号は以下の通りです。

これらは 11/18 分の新着データとして DDBJ より公開されております。
関連ページ：

DDBJ が管理・収集している塩基配列データベースは，リリースとして定期的に年4回オンライン上で公開しています。12月24日に DDBJ リリース76 が完成しました。リリース76 のエントリ数は 98,220,409 総塩基数は 98,741,908,446 です。 FTP によるリリースデータの取得は，FTP・WebAPI のページより可能です。

今年度も，2009年2月25日から28日まで，京都大学にて，第８回 日韓中バイオインフォマティクス・トレーニングコースを開催します。
このコースは日韓中の若手研究者を対象としたトレーニングコースで，講議（英語）と実習を行ないます。DDBJ のスタッフも講師として参加します。また，受講者には旅費と宿泊費が支給されます。 詳細は，近日中にトレーニングコースのホームページで紹介予定です。興味をお持ちの方はサイト公開後に詳細を確認の上，どうぞご応募下さい。

10月23日に，ミラー H-Invitational Database (H-InvDB) が公開されました。データベースのversion が "5.3" になりました。

DDBJ では，塩基配列の登録方法や DDBJ が提供しているデータベース検索・解析サービスを，ユーザの方々が深く理解し ていただけるように，年に数回，全国各地において「DDBJing 講習会」を開催しています。 11月27-28日に京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター (京都大学宇治キャンパス)にて，第20回 DDBJing 講習会を開催いたしました。 今回の講習会は，KEGG（京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター），PDBj（大阪大学蛋白質研究所），LSDB（ライフサイエンス統合データベースセンター）という，バイオインフォマティクスのトップリーダーとの合同開催で，DDBJ，KEGG，PDBj の代表的なサービスの使い方についての講義と実習，ライフサイエンス統合データベースの活動紹介と国内外データベースの統合的な利用法についての講義，と非常に密度の濃い２日間でした。今回は，講習内容の密度が濃すぎたために，若干実習時間が足りないという反省点がありましたが，この講習会が，１人でも多くの方に DDBJ，KEGG，PDBj，LSDB のサービスを利用していただくきっかけとなることを願っています。 これまでの講習会で使用した資料は ダウンロードページ から取得できますので，どうぞご利用下さい。

また，開催のご要望がありましたら検討いたしますので，以下のメールアドレスにお問い合わせ下さい。

DDBJ は，12月9日から12日まで神戸ポートアイランドで開催された BMB2008 に於いて，NBRP(National BioResource Project) コーナーにブースを出展しました。ブースでは，ポスターの他に，大型モニターでの自動プレゼンテーション上映による DDBJ のサービスの解説，インターネットに接続したパソコンで来場者にじかにDDBJ のサービスを体験してもらう等，の展示を行ないました。また，ブースには DDBJ のスタッフが立ち，訪問者に対しての口頭説明や質問への対応，パンフレット配布等を行ないました。来訪者からは， DDBJ のサービスに関する様々な質問を受けましたが，今後は，ユーザにとってより使いやすいDDBJ を目指してサービスの改善を行なってゆきたいと考えています。

DDBJ では，国際塩基配列データベースの構築業務を 2008年12 月27日(土)から2009年1月4日(日)まで休業いたします。
これにともない，SAKURA によるデータ受け付けは2008年 12月25日(木)から2009年1月5日(月)までご利用いただけません。 エントリの新規および再公開も，2008年12月25日から2009年1月5日まで行なわれません。 ただし，データ検索や ftp は休業期間でも利用可能です。
皆様のご理解・ご協力をお願い申し上げます。

では，よい年をお迎えください。