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DDBJ メールマガジン
No. 46   2009年12月04日発行
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akinosora 朝晩の冷え込みが日増しに厳しくなってきました。澄み渡った秋の青空は,黄色く色付いたイチョウの葉をより鮮やかに見せてくれます。みなさま,紅葉狩りには出かけられましたでしょうか?伊豆の各地で行われている「紅葉まつり」も終盤にさしかかっている様子です。
早いもので本年も残すところ一ヵ月。年末,何かとお忙しいことと思いますが,お体に,飲みすぎ食べすぎにお気を付けて師走を乗り切りましょう。

隔月公開の DDBJ メールマガジン第46号 web 版です。メールマガジンに関するご質問やご意見がありましたら ddbjmag@ddbj.nig.ac.jp までどうぞ。

DDBJ では,国際塩基配列データベースの構築業務を 2009年12月29日(火)から 2010年1月3日(日)まで休業いたします。
これにともない,SAKURA によるデータ受け付けは 2009年12月25日(金)から 2010年1月4日(月)までご利用いただけません。 エントリの新規および再公開も,2009年12月25日から 2010年1月4日まで行なわれません。 ただし,データ検索や ftp は休業期間でも利用可能です。
皆様のご理解・ご協力をお願い申し上げます。
       休業期間: 2009年12月29日(火)から 2010年1月3日(日)まで
       SAKURA 停止: 2009年12月25日(金)17時から 2010年1月4日(月)10時まで
       新規・再公開停止: 2009年12月25日(金)から 2010年1月4日(月)まで
では,よい年をお迎えください。
DDBJ が登録を受付け,2009年11月から12月にかけて DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースから公開した大量データは以下の通りです。

 リョクトウ (Vigna radiata) WGS 46,645 エントリの新規公開 2009.12.1
タイの National Center for Genetic Engineering and Biotechnology から登録された リョクトウ (Vigna radiata) 由来の WGS データ 46,645 エントリが公開されました。

アクセッション番号 (Anonymous FTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。
  • BABL01000001-BABL01046645 (BABL.gz) (46,645 entries)
関連サイト
これらは11月30日分の新着データとして DDBJ より公開されております。

 トマト (Solanum lycopersicum) WGS 100,783 エントリの新規公開 2009.11.9
かずさDNA研究所から登録されたトマト (Solanum lycopersicum) の WGS データ 100,783 エントリが公開されました
アクセッション番号 (AnonymousFTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。
    BABP01000001-BABP01100783 (BABP.gz) (100,783 entries)
関連サイト
これらは11月6日分の新着データとして DDBJ より公開されております。

 ナス (Solanum melongena) と スズメノナスビ (Solanum torvum) EST 126,465 エントリの新規公開 2009.10.20
野菜茶業研究所から登録された ナス (Solanum melongena) とスズメノナスビ (Solanum torvum) 由来のEST データ 126,465 エントリが公開されました。
アクセッション番号 (Anonymous FTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。
これらは10月20日分の新着データとしてDDBJより公開されております。
真正細菌・古細菌・真核生物ゲノムの統合検索 GIB の検索結果から,ターゲットタンパク研究プログラムで開発された大腸菌全タンパク質の可溶率データベース eSOL のデータを参照できるようになりました。
gib
Q.EntryID を用いての登録作業の再開ができません。

A.登録作業が再開できない要因として,よくあるものは以下の通りです。

(1) 登録作業を始めた時に,コンタクトパーソン電子メールアドレスとして登録した以外のメールアドレスや,登録途中以外のEntryID で登録作業を再開することはできません。
コンタクトパーソン電子メールアドレス,EntryID をもう一度ご確認ください。
(2) 登録済のEntryID を用いての登録作業を再開することはできません。
登録途中の EntryID を用いて登録作業を再開してください。
(3) SAKURA では,テンプレートを作成したときに ,"T" から始まるTemplateID を発行します。 EntryID を用いての登録作業の再開をする時には,この TemplateID を使うことはできません。
EntryID を用いて登録作業を再開してください。
(4) EntryIDの保存期間は最終登録作業日から1ヶ月です。
最後に登録作業を行った日から1ヶ月以上経った EntryID につきましては,原則として 呼び出すことはできません。 その場合は,SAKURA トップページの「エントリ登録の開始」の [Start] ボタンより改 めて登録作業を行って下さい。
(5) SAKURA には「通常登録」と「TPA登録」があります。
 「通常登録」で登録作業を開始した場合は「通常登録」のトップページより,「TPA登録」 で登録作業を開始した場合は「TPA登録」のトップページより登録を再開して下さい。

連続したアクセッション番号の発行を希望し,「通常登録」と「TPA登録」を間違えて登 録作業を開始してしまった場合,連番登録情報の解除と登録済エントリ(EntryID)の削 除をする必要があります。
それらの作業は DDBJ で行いますので,コンタクトパーソン電子メールアドレス,登録 済エントリ(EntryID) を添えてその旨を までご連絡下さい。
※上記の方法で問題が解決しない場合や,ご自分の登録状況が分からない場合には,こ ちらで登録状況を確認いたしますので,登録作業を一時中断してコンタクトパーソン電 子メールアドレス,EntryID ,エラーメッセージなどを添えて までご連絡下さい。
  ddbjmag@ddbj.nig.ac.jp

この DDBJ メールマガジンは国立遺伝学研究所内の方と,所外の希望者に配信しています。 配信希望・変更・不要の方は,「申込み・変更」ページをご利用になるか,次のメールアドレスまでご連絡下さい: ddbjmag@ddbj.nig.ac.jp
発行:日本 DNA データバンク (DDBJ)
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〒411-8540  静岡県三島市谷田1111