冬はとかく運動不足で体重も増加傾向に。おまけに年末年始の食べ過ぎも重なって，現在ダイエット中，という方も多いのでは？
最近，昼休みなどに歩いている方をよく見かけますが，冬はウォーキングにも最適な季節。遺伝研の周囲には里山や川沿いなど，昼休みのプチウォーキングにもってこいのコースがいくつかあります。晴れた日には富士山も良く見えますし，そろそろ梅も咲き始めました。歩いていると体も温まり，気分もリフレッシュ。さあ、午後も気持ち良く仕事をしましょう！

隔月公開の DDBJ メールマガジン第47号 web 版です。メールマガジンに関するご質問やご意見がありましたら までどうぞ。

DDBJ が WWW ならびにWeb API で提供している相同性検索サービスのうち，下記サービスの提供を終了いたします。ユーザの皆様にはご不便をおかけいたしますが，ご理解くださいますようお願いいたします。

＊1：大型計算機 supernig のご利用にあたっては利用申請が必要です。

DDBJ が登録を受付け，2009年12月から2010年1月にかけて DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースから公開した大量データは以下の通りです。

 オキゴンドウ （Pseudorca crassidens） GSS 90,007 エントリの新規公開 2010.1.7
Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology から登録された オキゴンドウ (Pseudorca crassidens) 由来の GSS データ 90,007 エントリが公開されました。
アクセッション番号 （Anonymous FTP 一括取得ファイル名） は以下の通りです。

• DE647769-DE737775 (Pseudorca_crassidens_GSS_100107_1.seq.gz ) (90,007 entries)

関連サイト

• Genome Research Community

これらは1月7日分の新着データとして DDBJ より公開されております。

Nucleic Acids Research では，毎年データベース特集号が発行されています。2010年1月発行の Vol. 38, Database Issue に，DDBJ の活動に関連する下記の論文が掲載されました。

DDBJ が管理・収集している塩基配列データベースは，リリースとして定期的に年4回オンライン上で公開しています。2009年12月25日に DDBJ リリース80.0 が完成しました。リリース80.0 のエントリ数は 112,314,250，総塩基数は 109,636,862,252 です。
今リリースより DDBJ flat file の source 行の記述形式が変更に（organism name と organelle name の表示順序が変更）なりました。また，一部の DDBJ flat file で，一般名表記が含まれるようになりました。詳細は　DDBJ Release Note をご覧ください。
FTP によるリリースデータの取得は，FTP・WebAPI のページより可能です。

Feature Table Definition(FT-Doc) は， DDBJ/EMBL-Bank/GenBank 国際塩基配列データベース構築のために，DDBJ, EMBL-Bank, GenBank が 三者間で定めた共通のアノテーション規範です。毎年5月に開催される国際実務者会議での決定を受けて改訂が行われ，公開データベースにもその改訂が反映されています。。第22会国際実務者会議（2009年5月に米国 NCBI で開催）での決定事項を基に，2009年12月にFeature Table Definition が改訂されました。

CIB-DDBJ では，2004年4月より H-Invitational Database（H-Inv DB) のミラーサイトを公開していましたが，2009年12月31日をもって終了いたしました。なお，Anoymous-FTP は H-InvDB サーバから DDBJ サーバ に移行いたします。

H-InvDB は，ヒトの遺伝子と転写産物を対象とした統合データベースです。CIB-DDBJ では，2004年4月に H-Invitational で解析されたヒト完全長 cDNA データセットの機能アノテーションの成果を公開するためのデータベース（H-Inv DB）を独立行政法人 産業技術総合研究所 バイオメディシナル情報研究センター（BIRC）と共同で構築し，ミラーサイトを公開していました。また，H-Invitational で付与された機能アノテーションを国際塩基配列データベースに準拠した形式のフラットファイルで表示し，H-Invitational Database CIB-DDBJ Flat File Server を公開していました。

H-InvDB サイトは，BIRC H-InvDB をご利用下さい。長い間ご利用いただきありがとうございました。

2010年4月に中国の上海にて，第9回 日韓中バイオインフォマティクス・トレーニングコースが開催されます。
このコースは日韓中の若手研究者を対象としたトレーニングコースで，講議（英語）と実習を行ないます。受講者には（独）科学技術振興機構　( Japan Science and Technology Agency)より旅費と宿泊費が支給されます。
興味をお持ちの方はサイトにて詳細を確認の上，どうぞご応募下さい。（2010年2月15日まで）

Q．連番登録の途中で登録予定件数を変更することはできますか

A．連番登録が完了しているエントリの件数より，多い件数への変更は可能です。

　連番登録作業の途中で，新たなエントリの登録作業を開始する時に「データ公開について」ページで「予定件数」の項目に変更したい件数を入力して下さい。 次の「情報入力メインページ」でページ上部に「This entry is(何件目)／(登録予定件数)」が表示されますので，「登録予定件数」が変更した件数になっている事を確認して下さい。

例えば，連番登録予定件数１０件で登録作業を開始し，５件目の登録作業が完了した後に予定件数を変更したい場合，６件以上への変更は可能です。 予定件数の変更方法は，６件目の登録作業時に「データ公開について」ページの「予定件数」の項目に希望件数（例：７ or 12）を入力して下さい。 次のページの画面上に「" This entry is 6/7 or 6/12 "」と表示されます。



それ以外の変更を希望される場合は，変更内容とEntryID，コンタクトパーソン電子メールアドレスを までご連絡下さい。

※問い合わせをされた後は，こちらから回答するまで登録作業を一時中断してお待ちください。