最終更新日:2013.6.17.

DDBJ スタッフの発行物(2001年)

| 2008 | 2007 | 2006 | 2005 | 2004 | 2003 | 2002 | 2001 | 2000 | 1999 | 1998 | 1997 | 1996 |


*太字が DDBJ スタッフです

  • Bellgard M, Schibeci D, Trifonov E, Gojobori T. (2001) Early detection of G + C differences in bacterial species inferred from the comparative analysis of the two completely sequenced Helicobacter pylori strains. J. Mol. Evol. 53(4-5):465-8.

  • Cebria F, Nakazawa M, Mineta K, Ikeo K, Gojobori T, Agata K. (2001) D
    issecting planarian central nervous system regeneration by the expression of neu
    ral-specific genes. Dev Growth Differ. 44(2):135-46.

  • Fukuchi S, Nishikawa K. (2001) Protein surface amino acid compositions distinctively differ between thermophilic and mesophilic bacteria. J Mol Biol. 309(4):835-43.

  • Goto K, Miyazaki S, Sugawara H. (2001) Genome Information Broker for Data Retrieval and Comparative Analysis of Microbial Genomes. Journal of Japan Society of Information and Knowledge. 10(4):4-13.

  • Fukami-Kobayashi K, Nishikawa K. (2001) Parallel evolution at molecular level: Phylogenetic analysis of the LacI/GalR family repressors and their PBP homologues. Genes and Genetic Systems. 76:439.

  • International Human Genome Sequencing Consortium. (2001) Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature 409: 860-921.

  • Kinjo AR, Kidera A, Nakamura H, Nishikawa K. (2001) Physicochemical evaluation of protein folds predicted by threading. Eur Biophys J. 30(1):1-10.

  • Kinjo AR, Nishikawa K. (2001) Comparison of energy components of proteins from thermophilic and mesophilic organisms. Eur. Biophys. J. 30:378-84.

  • Misu S, Iizuka T, Kawanishi Y, Fukami K, Saitou N. (2001) CAMUS DB for amino acid sequence data. Genome Informatics. 502-3.

  • Miyazaki S, Sugawara H. (2001) Visualization of features in the Flat File by use of DDBJ-XML. Currents in computational molecular biology. 249-50.

  • Nakashima H, Yamashita S, Nishikawa K. (2001) Directional gene distributions of two mycoplasma species exhibited in the nucleotide composition space. Res. Comm. In Biochem., Cell & Mol. Biol. 5:27-35.

  • Noguchi T, Ito M, Matsuda H, Akiyama Y, Nishikawa K. (2001) Prediction of protein secondary structure using the threading algorithm and local sequence similarity. Res. Comm. In Biochem., Cell & Mol. Biol. 5:115-31.

  • Osawa M, Yuasa I, Kitano T, Heinke J, Kaneko M, Saitou N, Umetsu K. (2001) Haplotype analysis of human alpha2-HS glycoprotein (fetuin). Annals of Human Genetics. 65(1):27-34.

  • Osawa S, Gojobori T. (2001) Preface. J. Mol. Evol. (Thomas Jukes special issue) 53(4-5):257.

  • Ota M, Isogai Y, Nishikawa K. (2001) Knowledge-based potential defined for a rotamer library to design protein sequences. Protein Eng. 14:557-64.

  • RIKEN Genome Exploration Research Group Phase II Team and FANTOM Consortium (Okazaki Y, Gojobori T, et al.), Genelal organizer: Y.Hayashizaki (2001) Functional anotation of a full-length mouse cDNA collection. Nature. 409(6821):685-90.

  • Sanders AR, Cao Q, Taylor J, Levin TE, Badner JA, Cravchik A, Comeron JM, Saitou N, Del Rosario A, Salvi DA, Walczyk KA, Mowry BJ, Levinson DF, Crowe RR, Silverman JM, Gejman PV. (2001) Genetic diversity of the human serotonin receptor 1B (HTR1B) gene. Genomics. 72(1):1-14.

  • Sato S, Tanaka M, Miura H, Ikeo K, Gojobori T, Takeuchi T, Yamamoto H (2001) Functional conservation of the promoter regions of vertebrate tyrosinase genes. J Investig Dermatol Symp Proc. 6(1):10-8.

  • Sato T, Terabe M, Watanabe H, Gojobori T, Hori-Takemoto C, Miura Ki. (2001) Codon and base biases after the initiation codon of the open reading frames in the Escherichia coli genome and their influence on the translation efficiency. J Biochem. 129(6):851-60.

  • Suzuki Y, Gojobori T, Nei, N. (2001) ADAPTSITE:detecting natural selection at single amino acid sites. Bioinformatics. 17(7):660-1.

  • Suzuki Y, Gojobori T. (2001) Positively selected amino acid sites in the entire coding region of hepatitis C virus subtypes 1b. Gene. 276(1):83-7.

  • Suzuki Y, Wyndham A, Gojobori T. (2001) Virus Evolution. Handbook of statistical genetics, eds. D.J.Balding, M.Bishop, and C.Canning. John Wiley & Sons. 377-413.

  • Tanaka H, Chinami M, Mizushima T, Ogasawara K, Ota M, Tsukihara T, Yutani K. (2001) X-ray crystalline structures of pyrrolidone carboxyl peptidase from a hyperthermophile, Pyrococcus furiosus and its cys-free mutant. J. of Biochem. 130:107-18.

  • Tsunoyama K, Bellgard MI, Gojobori T. (2001) Intragenic variation of synonymous substitution rates is caused by nonrandom mutations at methylated CpG. J Mol Evol. 53(4-5):456-64.

  • Umetsu K, Tanaka M, Yuasa I, Saitou N, Naito E, Ago K, Nakayashiki N, Miyoshi A, Kashimura S, Watanabe G, Osawa M. (2001) Multiplex amplified product length polymorphism analysis to rapidly detect human mitochondrial DNA variations. Electrophoresis. 22:3533-8.

  • Yamamoto M, Lin X-H, Kominato Y, Hata Y, Noda R, Saitou N, Yamamoto F. (2001) Murine equivalent of the human histo-blood group ABO gene is a cis-AB gene and encodes a glycosyltransferase with both A and B transferase activity. Journal of Biological Chemmistry. 276(17):13701-8.

  • Yuasa I, Umetsu K, Ago K, Sun C-S, Pan I-H, Ishida T, Saitou N, Horai S. (2001) Population genetic studies on nine aboriginal ethnic groups of Taiwan. II. Serum protein systems. Anthropological Science. 109(4):257-73.


日本語による発行物

  • 池尾一穂(2001)配列に共通のパターンを探す.蛋白質核酸酵素.46(9):1299-305.

  • 池尾一穂(2001)アミノ酸配列から既知のパターンを探す.蛋白質核酸酵素.46(12):1893-8.

  • 磯貝泰弘,太田元規 (2001) シリーズ・ニューバイオフィジックス9巻「生体ナノマシンの分子設計」城所俊一編 共立出版.2-2章 人工タンパク質の合理的設計.102-21.

  • 今西規,宮崎智(2001)既知の配列と比較する:相同性検索.蛋白質核酸酵素.46(7):856-62.

  • 岩間久和,五條堀孝 (2001) 神経伝達にかかわる蛋白質分子の進化.蛋白質核酸酵素.46(11):1586-93.

  • 岩間久和,五條堀孝 (2001) 研究資源としてのバイオインフォマティックス.財団会報『ヒューマンサイエンス』ヒューマンサイエンス振興財団.12(1):19-21.

  • 遠藤高帆,五條堀孝 (2001) 比較ゲノムによる機能予測.実験医学.19(11):1357-62.

  • 太田元規 (2001) 複雑系の事典 —適応複雑系のキーワード150— 相関係数,モンテカルロ法.複雑系の事典編集委員会編.朝倉書店.

  • 太田元規,西川建 (2001)タンパク質高次構造の予測.プロテオミクスの基礎.綱沢進,平野久編.講談社サンエンティフイク.82-111.

  • 川端猛,西川建 (2001) 蛋白質立体構造予測データベースGTOP.蛋白質核酸酵素.増刊ゲノムサイエンスの新たなる挑戦.46:2592-7.

  • 五條堀孝監訳,遠藤俊徳代表訳 (2001) 分子生物学のためのバイオインフォマティクス入門-生物情報解析の理論とアリゴリズム(J.C.Setubal, J.Meidanis著).共立出版.

  • 五條堀孝 (2001) 遺伝子から見た生物の進化.Computer Today.104:30-7.

  • 五條堀孝 (2001) ゲノム比較から見えるもの.biohistory.JT生命誌研究館.8(3):8-9.

  • 斎藤成也 (2001) 類人猿ゲノム計画.平凡社ネットで百科.デジタル百科.10月号.

  • 斎藤成也 (2001) 霊長類ゲノムの比較解析.蛋白質核酸酵素.46(16):2481-5.

  • 斎藤成也 (2001) ルーツを明かすDNAの世界.日本人はるかなる旅 (1)マンモスハンター,シベリアからの旅立ち.NHKスペシャル「日本人」プロジェクト.133-47.

  • 斎藤成也 (2001) 配列から遺伝子の進化を探る.蛋白質核酸酵素.46(10):1410-3.

  • 斎藤成也 (2001) ヒトにいたるゲノム進化.榊佳之,小原雄治編.ゲノムから個体へ.中山書店.180-92.

  • 斎藤成也 (2001) ヒトと類人猿のゲノム比較から人間の独自性を探る.特集:ゲノム研究から見た21世紀の生命科学.細胞工学.20(1):65-9.

  • 菅原秀明 (2001) ゲノム情報から多様性情報まで.情報知識学会誌.10(4):1-3.

  • 菅原秀明 (2001) バイオインフォマティクス「ツール」から「学」へ.生体の科学.52(4):347-53.

  • 菅原秀明 (2001) 数値分類.鈴木健一朗,平石明,横田明編集.微生物の分類・同定実験法.シュプリンガー・フェアラーク東京.231-24.

  • 菅原秀明 (2001) バイオインフォマティクスへの期待.蛋白質核酸酵素.46(6):761-3.

  • 菅原秀明,宮崎智 (2001) ヒトゲノムデータが DNA Data Bank of Japan (DDBJ) に与えた影響.ゲノムサイエンスニュース.5(2):2-7.

  • 舘野義男,五條堀孝 (2001) 国際DNAデータバンクとバイオインフォマティクス.ESTRELA.(財)統計情報研究開発センター.88:11-7.

  • 舘野義男,五條堀孝 (2001) DNAデータバンクとゲノム研究.ゲノム医科学がわかる わかる実験医学シリーズ.羊土社.86-92.

  • 西川建 (2001) 配列空間の“島モデル”再考.物性研究.75:790-2.

  • 西川建 (2001) タンパク質立体構造の予測問題.Computer Today.18(7):10-5 .

  • 深海-小林薫(2001)アミノ酸配列の保存領域から蛋白質を知る.蛋白質核酸酵素.46(14):2098-103.

  • 松澤史子,西川建 (2001) 機能モチーフと機能ドメイン.プロテオミクスの基礎.綱沢進,平野久編.講談社サンエンティフイク.65-82.

  • 宮崎智(2001)配列を手に入れる DDBJが提供する SRS システムにより検索の仕方.蛋白質核酸酵素.46(6):764-70.

  • 宮崎智,菅原秀明,五條堀孝 (2001) ゲノム情報学.最新医学.最新医学社.56(1):64-71.

ページの先頭へ戻る