論文にアクセッション番号を記載するときのフォーマットはありますか

Last updated:2014.7.1.

投稿を予定している雑誌などの規定に従っていただければ、通常は問題はありません。
国際塩基配列データベースでは、論文のタイトルページの footnote に以下のような記載をすすめています。

Note: Nucleotide sequence data reported are available in the DDBJ/EMBL/GenBank databases under the accession number(s)----'.

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