[Detail view 画面] samtools view -bS -o out.bam out.sam このコマンドでSAM—>BAM変換するのか?

Last updated:2015.2.4.

samtools view はレファレンス配列(ゲノム)へのマップ結果のうち、特定領域の結果のみ出力するコマンドです。しかし、基本的に許可していないので、レファレンス配列(ゲノム)全体での結果となります。
http://samtools.sourceforge.net/samtools.shtml#3

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