BLAST の解析結果で表示される E Value は,どのように計算されていますか?

Last updated:2017.4.13.

クエリ配列の長さを l 、データベースに保存されている配列の本数を n 、核酸あるいはアミノ酸同士の相似度を表すスコアを S としたとき、E value は次の式によって書き表さされます。(ただし、k 、m は正の定数です)

E=k*l*n*exp^(-mS)

この式から、BLASTの出力結果は、1E-Xと表示されている場合は、10-X という意味になります。

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