ペアエンドのファイル30個をde novo assemblyする手順を教えてください

Last updated:2016.6.14.

DDBJ Pipelineのde novo assemblyでは、複数のクエリファイルを一度に実行することが可能です。以下の手順をご参考にしていただければと思います。

1. 「Selecting Query Files」の画面で、アップロードした複数のファイルを選択。
2. 「Selecting Tools for Basic Analysis of DDBJ ANNOTATION PIPELINE」の画面で de novo assembly のツールを選択。
3. 「Generating Query Sets from Query Read Files 」の画面で使用したい複数のファイルを選択。右下の「Set as Pair-End」ボタンをクリック。これにより、複数のファイルが1つのクエリセットに結合されます。
4. オプション設定、実行へ

得られた結果を見るために必要なソフトですが、結果ファイルの容量は非常に大きいと推測されます。そのため、通常のテキストエディタで開くことは困難になりますので、ターミナルでのコマンド操作(moreやlineなど)が必要になってくると思われます。

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