最終更新日:2017.5.17.

データアーカイブ

データダウンロード

FTPサーバー ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/
現在公開されているリリースの情報

DDBJリリースデータ

DDBJではEMBL,GenBankと塩基配列データの交換を行い、3極のデータをマージした「DDBJリリースデータ」を年4回作成・公開しています。

リリースノート
conventional sequence data
最新定期リリース中の conventional sequence data
new conventional sequence data
最新定期リリース後に公開された conventional sequence data
WGS data
Whole Genome Shotgun データ
TSA data
Transcriptome Shotgun Assembly データ
TLS data
Targeted Locus Study データ

DADリリースデータ

DDBJ リリースデータ中の conventional sequence data をもとにして作成したアミノ酸配列データ。

リリースノート
最新リリースデータ
最新の DDBJ 定期リリース中の conventional sequence data をもとにして作成したアミノ酸配列データ
新着データ
最新の DDBJ 定期リリース後に公開された conventional sequence data をもとにしたアミノ酸配列データ

特許庁由来のアミノ酸配列データ

PATENT
日本特許庁(Japan Patent Office: JPO)と韓国特許庁(Korean Intellectual Property Office: KIPO)から転送されたアミノ酸配列データ

DDBJ リリースに含まれない塩基配列データ

TPA データ
TPA(Third Party Data) データ
MGA データ
Mass sequence for Genome Annotation データ
16S rRNA (Prokaryotes)README
16S rRNA (Prokaryotes)
最新 DDBJ リリースから16S rRNA 配列データを抜き出したもの

その他の登録データ

DDBJ では、塩基配列データだけでなく次世代シークエンサからの出力データなど、様々な登録データを公開しています。

DDBJ Sequence Read Archive データ
次世代シークエンサからの出力データのためのアーカイブ
DDBJ Trace Archive データ
大規模シークエンシングプロジェクトのシングルパスの配列データについて,trace (クロマトグラフ) にベースコールと品質のデータを加えたアーカイブ
DDBJ BioProject Database データ
DDBJ から公開したプロジェクトデータ, サマリー,スキーマ
DDBJ BioSample Database データ
DDBJ から公開した生物学的試料 (サンプル) データ, サマリー,スキーマ

ミラーデータベース

ArrayExpress
Refseq
UniProt




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