最終更新日:2015.2.3.

データアーカイブ

データダウンロード

FTPサーバー ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/
現在公開されているリリースの情報

DDBJリリースデータ

DDBJではEMBL,GenBankと塩基配列データの交換を行い、3極のデータをマージした「DDBJリリースデータ」を年4回作成・公開しています。

DDBJ リリースノート
DDBJ 最新リリースデータ
最新のDDBJ定期リリースデータ。
DDBJ 新着データ
最新の DDBJ 定期リリース後に公開されたデータ
16S rRNA (Prokaryotes)README
16S rRNA (Prokaryotes)
最新DDBJリリースから16S rRNA配列データを抜き出したもの

DADリリースデータ

DAD リリースノート
DAD 最新リリースデータ
DDBJ最新リリースデータをもとにしたアミノ酸配列データベース。
DAD 新着データ
最新の DAD 定期リリース後に公開されたデータ

特許庁由来のアミノ酸配列データ

PATENT
日本特許庁(Japan Patent Office: JPO)と韓国特許庁(Korean Intellectual Property Office: KIPO)から転送されたアミノ酸配列データ

DDBJリリース以外の塩基配列データ

以下の塩基配列データデータは、DDBJリリースには含まれていません。

TPA データ
TPA(Third Party Data) データ
WGS データ
Whole Genome Shotgun データ
TSA データ
GenBank から公開された Transcriptome Shotgun Assembly データ
MGA データ
Mass sequence for Genome Annotation データ

塩基配列以外の登録データ

DDBJ では、塩基配列データだけでなく次世代シークエンサからの出力データなど、様々な登録データを公開しています。

DDBJ Sequence Read Archive データ
次世代シークエンサからの出力データのためのアーカイブ
DDBJ Trace Archive データ
大規模シークエンシングプロジェクトのシングルパスの配列データについて,trace (クロマトグラフ) にベースコールと品質のデータを加えたアーカイブ
DDBJ BioProject Database データ
DDBJ から公開したプロジェクトデータ, サマリー,スキーマ
DDBJ BioSample Database データ
DDBJ から公開した生物学的試料 (サンプル) データ, サマリー,スキーマ




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