2012/3実施のスーパーコンピュータシステム移行に伴うお知らせ

GTOP, PMD サービス再開 2012.04.03
2012年2月15日(水)より停止しておりました，GTOP, PMD のサービスを4月2日(月)より再開しました。
ユーザのみなさまには，大変長らくお待たせいたしました。
どうぞご利用下さい。

（参考）2012/3実施のコンピュータシステム移行に伴うお知らせ（タイトル一覧）
DDBJ サービスの再開について（4/2 現在の状況） 2012.04.03
日頃より DDBJ をご利用頂きましてありがとうございます。

国立遺伝学研究所では，2012年3月にスーパーコンピュータシステムの新システムへの更新（リプレース）を予定しています。新システムへの移行により，DDBJ では，データ登録受付件数の増加への対応，検索・解析サービスの高速化，新サービスの提供を実現いたします。

（参考）（重要）スーパーコンピュータシステムの移行に伴うサービスの中断・変更など (2012.02.03)
          DDBJ サービスの中断・変更について (2/15 現在の状況) (2012.02.16)

新システムへの移行に伴い，2012年2月15日15時より，国立遺伝学研究所ならびにDDBJ の一部の現行サービスを一時中断（一部サービスについては終了）しております。
4月2日より再開したサービス
 検索・解析
 
3月21日より新スパコン利用申込を開始
 国立遺伝学研究所　スーパーコンピュータシステム（以下「スパコン」）
スパコンの利用申込を 3月21日より開始致しました。
利用をご希望の方は，「スーパーコンピュータシステムの利用申込」より申請して下さい。
詳しくは，「新スパコン紹介ページ」，「スーパーコンピュータシステムの利用方法」をご参照下さい。
 
休止中のサービス・業務（再開日程は決まり次第，当ホームページに掲載）
 検索・解析
BLAST・ClustalW
（3月中旬　新スパコン稼働開始後に再開予定です。お急ぎの場合は，
NCBI BLAST, EBI-ClustalW，Genomenet-ClustalW（京都大学） をご利用ください）
DDBJ Read Annotation Pipeline
Web API
GIB・GIB-V
 塩基データ登録受付
massFTP を利用した大量データ登録
（データは，メールの添付またはメディアにてお送りください）
 
中断しないで続行するサービス・業務
 DDBJ HP
HP の閲覧
HP の更新
 塩基データ登録受付・公開・更新業務
SAKURA での受付
大量データ登録での受付（massFTP を利用しない場合）
アクセッション番号発行
データ公開・更新業務 など
 DRA, DTA, Bioproject 受付・更新・公開業務, データ検索
 CIBEX 受付・更新・公開業務, データ検索
 検索・解析
GTPS
 anonymous FTP によるデータ取得
 
新サービスに移行済み
 エントリ検索・キーワード検索
 
 
新スーパーコンピューターシステムの利用申込を開始 2012.03.22
国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステム（以下「スパコン」）は3月に更新され，2012年3月21日（水）より運用を開始致しました。
スパコンでは最新鋭の CPU を搭載した350台余のクラスタマシン，10TB のメモリを搭載するサーバおよび総計 5PB に及ぶ大規模記憶装置を，高速ネットワークで接続したシステムです。

国立遺伝学研究所のスーパーコンピュータシステム(以下「スパコン」)にログインして利用する場合は，計算機のアカウントが必要です。
利用をご希望の方は,情報・システム研究機構国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステム利用の条件（暫定）をご覧の上，「スーパーコンピュータシステムの利用申込」より申請して下さい。

詳しくは，「スーパーコンピュータシステム利用」をご参照下さい。
DDBJ サービスの中断・変更について（2/15 現在の状況） 2012.02.20
日頃より DDBJ をご利用頂きましてありがとうございます。

国立遺伝学研究所では，2012年3月にスーパーコンピュータシステムの新システムへの更新（リプレース）を予定しています。新システムへの移行により，DDBJ では，データ登録受付件数の増加への対応，検索・解析サービスの高速化，新サービスの提供を実現いたします。

（参考）（重要）スーパーコンピュータシステムの移行に伴うサービスの中断・変更など (2012.02.03)

新システムへの移行に伴い，2012年2月15日15時より，国立遺伝学研究所ならびにDDBJ の一部の現行サービスを一時中断（一部サービスについては終了）しております。
休止中のサービス・業務（再開日程は決まり次第，当ホームページに掲載）
 検索・解析
BLAST・ClustalW
（3月中旬　新スパコン稼働開始後に再開予定です。お急ぎの場合は，
NCBI BLAST, EBI-ClustalW，Genomenet-ClustalW（京都大学） をご利用ください）
DDBJ Read Annotation Pipeline
Web API
GIB・GIB-V
GTOP
PMD
 塩基データ登録受付
massFTP を利用した大量データ登録
（データは，メールの添付またはメディアにてお送りください）
 
中断しないで続行するサービス・業務
 DDBJ HP
HP の閲覧
HP の更新
 塩基データ登録受付・公開・更新業務
SAKURA での受付
大量データ登録での受付（massFTP を利用しない場合）
アクセッション番号発行
データ公開・更新業務 など
 DRA, DTA, Bioproject 受付・更新・公開業務, データ検索
 CIBEX 受付・更新・公開業務, データ検索
 検索・解析
GTPS
 anonymous FTP によるデータ取得
 
新サービスに移行済み
 エントリ検索・キーワード検索
 
2月24日にサービス終了し，新スパコン利用サービスとして再開予定
 国立遺伝学研究所　大型計算機(supernig)
新スパコンの一般利用は 4月上旬より開始予定です。ユーザの募集はDDBJホームページにて3月上旬頃にお知らせいたします
 
 
DDBJ エントリへのリンク設定方法の変更 2012.02.13
これまで，getentry を利用して，DDBJ の個々のエントリに対してリンクを設定することが可能でしたが，新 getentry への移行に伴い，この方法も変更になります。従来の方法を利用されている方は，設定変更をお願いいたします。

新 getentry でのリンクの設定は，(1)　または (2) のいずれかの方法で可能です。
(1) 通常のGET method
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=データベース名&accession_number=アクセッション番号&追加のパラメーター（任意)
(2) smart URL
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/データベース名/アクセッション番号
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/データベース名/アクセッション番号/?追加のパラメーター(任意)


詳細： 新getentry (Web API) について
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