2012/3実施のスーパーコンピュータシステム移行に伴うお知らせ

キーワード・エントリ検索システムの統合

DDBJではこれまで
1. データベースのIDから,該当するデータを取得する : getentry
2. データのキーワード検索 : ARSA
という2つのサービスを別々の web application として提供していましたが,2012年3月実施の国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステム更新に伴い,2012年2月15日より,これら2つの機能は単一のweb applicationとして統合し,新 ARSA として提供いたします。

一方,従来の getentry, ARSA の個々の機能は, webAPI としても提供します。 web application は,内部でこれら webAPI にクエリーを渡し,webAPI が返した結果を web application が受け取って表示する形になります。

ユーザーはこれら webAPI を直接利用することも可能で,これまでの getentry web application に近い機能は,この webAPI を利用したほうが便利と思われます。
 
 

新 getentry についてと新 ARSA について



新getentry の詳細について

新ARSA (2/15 より切り替わります)
 
 

DDBJ エントリへのリンク設定方法の変更

これまで,getentry を利用して,DDBJ の個々のエントリに対してリンクを設定することが可能でしたが新 getentry への移行に伴い,この方法も変更になります。従来の方法を利用されている方は,設定変更をお願いいたします。

新 getentry でのリンクの設定は,(1) または (2) のいずれかの方法で可能です。
(1) 通常のGET method
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=データベース名&accession_number=アクセッション番号&追加のパラメーター(任意)
(2) smart URL
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/データベース名/アクセッション番号
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/データベース名/アクセッション番号/?追加のパラメーター(任意)

 
 
2012年3月に実施予定のスーパーコンピュータシステムの移行(リプレース)に関連した一部作業のため,下記の日程で,SAKURA によるデータ受付を一時休止いたします。
[make_table title=yes color = #d5ffcc line = yes set_width = 400px] 休止期間 2012年2月23日(木)15:00~2月27日(月)15:00 [/make_table]
皆様には大変ご迷惑をお掛けいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
サービスを再開しました。ご協力ありがとうございました。(2月27日14時30分 JST)
 
日頃より DDBJ をご利用頂きましてありがとうございます。

国立遺伝学研究所では,2012年3月にスーパーコンピュータシステムの新システムへの更新(リプレース)を予定しています。新システムへの移行により,DDBJ では,データ登録受付件数の増加への対応,検索・解析サービスの高速化,新サービスの提供を実現いたします。

新システムへの移行に伴い,2012年2月15日15時より,国立遺伝学研究所ならびにDDBJ の一部の現行サービスを一時中断(一部サービスについては終了)いたします。再開日程につきましては決まり次第,当ホームページにてお知らせいたします。
一時中断するサービス・業務
 検索・解析
BLAST・ClustalW
TXSearch
Vector Screening System
DDBJ Read Annotation Pipeline
Web API
GIB・GIB-V
GTOP
PMD
 塩基データ登録受付
massFTP を利用した大量データ登録
 Anonymous FTP
 
新サービスに移行(2/15 切り替え予定)
getentry
ARSA
(新サービスの詳細は,別途 DDBJ HP にてお知らせいたします)
 
サービス終了(終了日:2012年2月24日)
 国立遺伝学研究所 大型計算機(supernig)
 
中断しないで続行するサービス・業務
 DDBJ HP
HP の閲覧
HP の更新
 塩基データ登録受付・公開・更新業務
SAKURA での受付
大量データ登録での受付(massFTP を利用しない場合)
アクセッション番号発行
データ公開・更新業務 など
 DRA, DTA, Bioproject 受付・更新・公開業務, データ検索
 CIBEX 受付・更新・公開業務, データ検索
 検索・解析
GTPS
 
 
ユーザの皆さまには多大なご迷惑とご不便をお掛けいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。