新 getentry の機能について

• 新 getentry では，アクセッション番号からの DDBJ フラットファイルの検索にご利用いただけます。
• 新 getentry は webAPI として実装しており，簡単な web フォームから利用するだけでなく，プログラムなどから直接呼び出すことが可能です。
• データの変更履歴 検索機能 が，webAPI プログラムの "gethistory" として新規に追加されました。
• 従来の getentry にあった "DDBJ フラットファイルのキーワード検索" は 新 ARSA で利用することが可能です。

入力フォームによる検索

http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/top-j.html からご利用下さい。

WebAPI プログラムと URL

新 getentry の web API は以下の２つのプログラムからなります。

*特許庁由来アミノ酸配列の更新履歴は今のところとっておりません。

パラメータの指定方法

以下の2種類があります。

指定可能なパラメータについて

getentry

• accession 番号（必須）：　検索対象の Accession 番号を指定します。
• database（任意）：　検索対象のデータベースを指定します。
• revision（任意）：　指定された revision 時点を検索します。
• format（任意）：　結果の出力フォーマットを指定します。
• filetype（任意）：　出力のファイルタイプを指定します。
• show_suppressed（任意）：　suppressed または replaced のデータを表示します。
• limit（任意）：　データの取得上限を設定します。

accession 番号（必須）：　検索対象の Accession 番号を指定します。

database（任意）：　検索対象のデータベースを指定します。

revision（任意）：　指定された revision 時点を検索します。

format（任意）：　結果の出力フォーマットを指定します。

filetype（任意）：　出力のファイルタイプを指定します。

パソコン上に上記のような画面が表示されます。

show_suppressed （任意）：　suppressed　データを表示します。

limit（任意）：　データの取得上限を設定します。

件数が多い場合，表示に時間がかかる場合があります。また，ブラウザの性能により，全件表示できない場合があります。

gethistory

• accession 番号（必須）：検索対象のAccession番号を指定します。
• database（任意）：　検索対象のデータベースを指定します。
• revision（任意）：　指定されたrevision時点を検索します。
• filetype（任意）：　出力のファイルタイプを指定します。

accession 番号（必須）：検索対象のAccession番号を指定します。

指定方法は getentry と同じです。

特許庁由来アミノ酸配列の履歴はありません

 

 

database（任意）：検索対象のデータベースを指定します。

指定したデータベースが履歴管理に対応していない場合は，空の結果を返します。

type（必須）：表示する履歴のタイプを指定します。

 

 
filetype（任意）：　出力のファイルタイプを指定します。

DDBJ エントリへのリンク設定方法

DDBJ の個々のエントリに対して，以下の方法でリンクを設定することができます。

例えば，アクセッション番号が AB000001 であるエントリに対する URL は

アクセッション番号が BD500001 である特許庁由来アミノ酸配列のエントリに対する URL は，

です。これを指定すると，該当のエントリが表示されます。試しに次のアクセッション番号をクリックしてみて下さい。

 
DRA へのリンク設定方法は，上記の方法とは異なりますので，DRA のホームページをご参照下さい。

ご自身のホームページを作成される場合に，この URL をご活用下さい。