WABI BLAST の使用方法

概要

WABI は、 BLAST を利用するための Web API を提供しています。

1. BLAST検索条件 を受け付けて 検索ジョブ をキューに登録します。応答データとして Request ID を返します。
   検索ジョブは、キューに登録されると「待機」→「実行」→「完了」と状態が遷移して行きます。
   状態が「完了」になると検索結果を閲覧できますが、閲覧期間は実行後 7日間 です。
   ( http://www.ddbj.nig.ac.jp/search/help/blasthelp-j.html#results の「検索結果閲覧期間」より。)
2. 指定された Request ID に対する BLAST検索ジョブの状態 を返します。
3. 指定された Request ID に対する BLAST検索条件 を返します。
4. 指定された Request ID に対する BLAST検索結果 を返します。

使用例

• Javaの使用例
• Perlの使用例
• Rubyの使用例

Web API の詳細

• URI POST /blast (検索ジョブの登録)
• URI GET /blast/{Request-ID}?info=status (検索ジョブの状態確認)
• URI GET /blast/{Request-ID}?info=request (検索条件の確認)
• URI GET /blast/{Request-ID}?info=result (検索結果の閲覧)
• URI GET /blast/{Request-ID}?imageId={Image-ID} (検索処理によって出力された画像データの取得)
• URI GET /blast/help/{Help-Command} (ヘルプ情報の閲覧)
※開発者向け URI GET /blast/{Request-ID}?info=result_stdout (検索処理の標準出力の閲覧)
※開発者向け URI GET /blast/{Request-ID}?info=result_stderr (検索処理の標準エラー出力の閲覧)
※開発者向け URI GET /blast (環境情報の確認)

指定可能なパラメーター

指定可能なパラメーターと各パラメーターの詳細は、次の通りです。

• パラメーター Request ID
• パラメーター 検索配列データ
• パラメーター データセット
• パラメーター データベース
• パラメーター BLASTプログラム
• パラメーター BLASTプログラムのオプション指定
• パラメーター 応答データの形式
• パラメーター 結果取得方法
• パラメーター メールアドレス
• パラメーター 参照するジョブ情報の種類
• パラメーター 検索処理出力画像のID
※開発者向け パラメーター 参照する環境情報の種類

その他の情報

検索結果は 7日間 保存されます。
( http://www.ddbj.nig.ac.jp/search/help/blasthelp-j.html#results の「検索結果閲覧期間」より。)
その期間中であれば、 Request ID を指定して GET リクエストすることで、 処理結果を参照する ことが可能です。