DEFINITION

データの定義や遺伝子などに関する情報が簡単に記載されています。一定の記述ルールに従ってデータバンク側で作成しています。
ただし、Mass Submission System からの登録では、登録者に作成していただくことがあります。

例: トウモロコシ catalase gene の完全配列

DEFINITION  Zea mays Cat3 gene for catalase, complete cds.
書式: [organism name] [gene name] gene for [product name], complete cds.
  • organism name は原則としてscientific name.
  • gene name は locus を示す象徴的な略号。
  • product name は産物、CDS の場合はタンパク質、の一般名。
  • タンパク質の全長配列を含むことを示す "complete cds" を記述。

例: ヒト glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase の cDNA 部分配列

DEFINITION  Homo sapiens mRNA for glyceraldehyde-3-phosphate 
            dehydrogenase, partial cds.
書式: [organism name] mRNA for [product name], partial cds.
  • gene name が記載されていない場合は省略。
  • タンパク質の部分配列を含むことを示す "partial cds" を記述。

例: Bacillus 属 16S rRNA の部分配列

DEFINITION  Bacillus sp. AZ25 gene for 16S rRNA, partial 
            sequence.
書式: [organism name] [strain name] gene for [product name], partial sequence.
  • 種を特定できない場合、種内比較の場合などでは strain name などを識別子として記載。
  • 部分配列を含むことを示す "partial sequence" を記述。

例: 複数の CDS がある ラット mitochondria DNA の配列

DEFINITION  Rattus norvegicus mitochondrial genes for cytochrome 
            c oxidase subunit II, ATPase subunit 6, cytochrome c 
            oxidase subunit III, partial and complete cds.
書式: [organism name] [gene name 1], [gene name 2], .... genes for [product name 1], [product name 2], ..... , partial and complete cds.
  • 5'側から3'側へ順番に gene name, product name をならべる
  • partial, complete and partial cds は省略して partial and complete cds とする。
  • gene name, product name が1対1で対応しない時は、原則、gene name のみ あるいは product name のみを記述。
  • 長くなりすぎる場合は map position などで表記。
  • 妥当と判断される場合は gene cluster, operon などを用いて表記。
  • 例: ヒト肝臓 EST の 3'末端の配列

    DEFINITION  Homo sapiens cDNA, clone:ABC123, 3' end, expressed 
                in liver.
    書式: [organism name] cDNA, clone:[clone name], [その他の情報].
    • clone name の記載が必要。

    例: マウス chromosome 1q の GSS

    DEFINITION  Mus musculus DNA, clone:1H11A14, 1q region.
    書式: [organism name] DNA, clone:[clone name], [その他の情報].

    • clone name の記載が必要。

    例: ヒト GAPD,TPA (Third Party Data) の配列

    DEFINITION  TPA_exp: Homo sapiens GAPD mRNA for
                glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, complete cds.
    書式: [TPA header]: [organism name] [gene name] mRNA for [product name], complete cds.
    • TPA (Third Party data) のデータの場合、TPA_exp: (TPA:experimental の場合)、または、TPA_inf: (TPA:inferential の場合) が行頭に記述される。
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