登録配列の生物学的な特徴を、feature key (特徴を表す項目)、location (配列上の位置情報)および Qualifier (特徴をさらに特定する項目)を用いて記述します。EST と GSS には原則として source 以外の feature key は記述されません。
Feature 情報は、原則として登録者からの報告に基づいて記述され,それらの記述が適正になされるよう、データバンクが補足訂正を行ないます。記述項目と記述方法については、国際塩基配列データベースが定めるThe DDBJ/EMBL/GenBank Feature Table: Definition に詳しく説明されています。
配列の特徴を記述するための feature key は、下記のように分類できます。
(1) は、すべてのエントリに必須で、/organism と /mol_type も必須の qualifier になっています。
(2) においては、生物学的特徴を限定的に記述する key (e.g. TATA_signal) から、より幅広く記述するための key (e.g.misc_feature) などに分類されていて、できるだけ具体的な記述がなされるように構成されています。
Feature key の中で、最も頻繁に使用されるのはタンパク質のコーディング領域を記述する CDS です。 CDS featureの説明ページもご参照ください。
例
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..450
/chromosome="12"
/clone="GT200015"
/clone_lib="lambda gt11 human liver cDNA (GeneTech.
No.20)"
/db_xref="taxon:9606"
/map="12p13"
/mol_type="mRNA"
/organism="Homo sapiens"
/tissue_type="liver"
CDS 86..>450
/codon_start=1
/gene="GAPD"
/product="glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase"
/protein_id="BAA12345.1"
/transl_table=1
/translation="MAKIKIGINGFGRIGRLVARVALQSDDVELVAVNDPFITTDYMT
YMFKYDTVHGQWKHHEVKVKDSKTLLFGEKEVTVFGCRNPKEIPWGETSAEFVVEYTG
VFTDKDKAVAQLKGGAKKV"