Amino Acid Codes

配列の記載に用いる略号

国際塩基配列データベースで使用するアミノ酸コードは以下の通りです。CDS feature の translation には以下の一文字表記で表されます。

/transl_except, /codon, /anticodon に記載するアミノ酸は、以下の省略形を使用します。
これ以外のアミノ酸を記載する場合には, Modified and unusual Amino Acidsを参照して下さい。

Abbreviation 1 letter abbreviation Amino acid name
Ala A Alanine
Arg R Arginine
Asn N Asparagine
Asp D Aspartic acid
Cys C Cysteine
Gln Q Glutamine
Glu E Glutamic acid
Gly G Glycine
His H Histidine
Ile I Isoleucine
Leu L Leucine
Lys K Lysine
Met M Methionine
Phe F Phenylalanine
Pro P Proline
Pyl O Pyrrolysine
Ser S Serine
Sec U Selenocysteine
Thr T Threonine
Trp W Tryptophan
Tyr Y Tyrosine
Val V Valine
Asx B Aspartic acid or Asparagine
Glx Z Glutamic acid or Glutamine
Xaa X Any amino acid
Xle J Leucine or Isoleucine
TERM termination codon
参考文献
IUPAC-IUB Joint Commission on Biochemical Nomenclature.Nomenclature and Symbolism for Amino Acids and Peptides. Eur. J. Biochem. 138: 9-37 (1984).
DDBJ/EMBL/GenBank Feature Table Definition 7.4.3 Amino acid abbreviations
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