Transcriptome の各段階と登録データの種別の対応を示します。
下図では典型的な手法の各段階を模式的に示しています。
なお、大規模な transcriptome プロジェクトは BioProject へご登録ください。
重要: ヒトを対象としたデータ登録について
ヒトを対象とした全ての研究において DDBJ に送付するデータの元になる個人のプライバシーは、適用されるべき法律、規定や所属する組織の方針に従い、登録者の責任において保護されている必要があります。 個人を直接特定できるような情報を、登録データから完全に取り除いてください。 データ元となる個人との間で大規模な塩基配列情報が公開されることについてのインフォームドコンセントが得られている必要があります。 「ヒトゲノム・遺伝子解析研究に関する倫理指針」上、問題となるような登録は受け付けません。

[DRA] Raw outputs 次世代シークエンサの出力
次世代シークエンサからの出力データは DDBJ Sequence Read Archive (DRA)へご登録ください。
[DTA] Chromatograms, Sequences, Qualities: Sanger 法の出力
single-path read の DNA sequence chromatograms (traces), base calls, quality estimates は、DDBJ Trace Archive (DTA) へご登録ください。
[TSA] Contigs: assemblies (overlapping reads) と Scaffolds
アセンブルされた cDNA 配列データは、TSA として Mass Submission System から ご登録ください。
[EST] Expressed Sequence Tags
single-pass read の cDNA 配列は、EST として Mass Submission System から ご登録ください。
[HTC] draft sequences of full length insert cDNA clones
完全長の cDNA (mRNA) を cloning する手法を用いて作製された cDNA library から得られた概要配列データは HTC として Mass Submission System から ご登録ください。
Finished sequences of cDNA clones
一般的なデータ、または、full length insert cDNA として Mass Submission System から ご登録ください。
