Upload annotation file
Upload 可能な annotation file について
- annotation file の作成方法に関する手引きに関しては、大量登録用データ作成の手引きをご覧ください。
- annotation file には、アノテーション部のみを含めてください。
- WGS、CON、AGP、EST、GSS、STS、HTG、HTC、TSA ファイルのuploadには対応していません。これらの登録については、大量登録システム(MSS) をご利用ください。
- 1. Contact person、2. Hold date、3. Submitter、4. Reference に記載された内容は、COMMON情報として upload された annotation file の先頭に加えられます。
- COMMON がannotation file内に記載されていた場合は、 1. Contact person、2. Hold date、3. Submitter、4. Reference に記載された内容に置き換わります。
- TPA 登録においては、PRIMARY_CONTIG を annotation file に含めないでください。5. Sequence 中の Assembly Information の入力内容が自動的に変換され、annotation file の各エントリーに挿入されます。
Link:
Feature key の定義
Qualifier key の定義
Organism qualifier に記載する生物名
CDS feature について
Uploadするannotation fileの例
サンプルアノテーションファイルをダウンロードできます(タブ区切りテキスト)
annotation file の Upload & Confirm => Error無い場合
annotation file の Upload & Confirm => Error/Warningが生じた場合
- Submitter、Reference、Sequence に Error/Warning が生じた場合、画面上部にあるプログレスバー内の各ページをクリックし、修正してください。各ページにおいて修正後は"Next"ボタンをクリックした後、プログレスバーの"7.Annotation"をクリックすると annotatoin file の upload 画面に戻ることができます。