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H-Invitational データベースの公開

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H-Invitational (Human Full-length cDNA Annotation Invitational) はヒト完全長 cDNA (complementaryDNA) に対してさまざまなバイオインフォマティクス解析を実行し,機能アノテーションを付与した国際的プロジェクトで,国立遺伝学研究所(現:大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所)生命情報・DDBJ研究ンセンター(CIB-DDBJ),独立行政法人産業技術総合研究所 生物情報解析研究センター(AIST/JBIRC),社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム(JBIC)によって共同主催されてきました.
CIB-DDBJ では H-Invitational で解析されたヒト完全長 cDNA データセットの機能アノテーションの成果を公開するためのデータベース,H-Invitational Database CIB-DDBJ Flat File Server を構築しました. このデータベースでは H-Invitational で付与された機能アノテーションを国際塩基配列データベースの形式に準拠した形式のフラットファイルで表示しています(DDBJ 版フラットファイル). さらに,本サイトでは cDNA がマップされたヒトゲノム上の Locus 情報も提供しています. 全てのデータに対して,DDBJ 版フラットファイルだけでなく,JBIRC によって作成されたフラットファイル(JBIRC 版フラットファイル)および XML ファイルも提供しています. これらのデータは FTP サイトから取得することができます.
 
また,JBIRC で公開されている H-Invitational Database (H-InvDB) のミラーサイトも合わせてCIB-DDBJから公開しています.
 
H-Invitational Database CIB-DDBJ Flat File Server
http://hinv.ddbj.nig.ac.jp/index-j.html
 
ミラーリング H-InvDB
http://www.ddbj.nig.ac.jp/whatsnew/whatsnew2009-j.html#091208
 
プレスリリース
完全長ヒトcDNAに基づくヒト遺伝子統合データベースを全世界に一斉同時公開
世界最大のヒト遺伝子カタログ  国際協同の下でミレニアムプロジェクトの成果を結集
社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム
独立行政法人産業技術総合研究所生物情報解析研究センター
国立遺伝学研究所生命情報・DDBJ研究センター
 
PLoS BIOLOGY
Integrative Annotation of 21,037 Human Genes Validated by Full-Length cDNA Clones
 
各報道機関の記事
Science Now
朝日新聞
共同通信
日経バイオテク
毎日新聞
 
2004年4月22日

関連記事: アノテーションジャンボリー "H-Invitational" 開催 (2002)
Last modified: Jun. 15, 2011