DNA Data Bank of Japan

新キーワード検索システムのテスト公開

ARSA (All-round Retrieval of Sequence and Annotation)
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DDBJ 新キーワード検索システム ARSA (All-round Retrieval of Sequence and Annotation) のプロトタイプ版を12月27日からテスト公開いたしました。富士通製の高速 XML 型データベース検索エンジン「インターステージシュンサク(Interstage Shunsaku)」を基盤技術として採用しております。
 
第1の特徴は、複雑な検索条件や大量のヒットがある条件で検索しても、これまで提供してきたキーワード検索システムに比べて遥かに短時間で検索結果を返すことができる点です。すなわち、どのような条件でも約5〜10秒で検索結果を出力します。
第2の特徴は、国際塩基配列データベースのフラットファイル (FF) 形式で定義されている Feature/Qualifier を個々に選択して詳細な検索条件を指定することができる点です。
  • 検索対象は,DDBJ 定期リリースと DDBJ 新着データです。
  • DDBJ フラットファイル形式に沿った詳細な検索条件を指定することができます。
  • 検索条件やヒット件数に依らず,ほぼ一定(約5秒〜10秒)の検索レスポンスが得られます。
  • 検索結果は,フラットファイル,DDBJ-XML,FASTA の3つの形式で取得することができます。
  • 検索結果をファイルとしてダウンロードすることができます。
※定期メンテナンスの為、毎日夜間に2,3時間程度サービスを停止いたします。
 
 
参考資料として下記もご覧下さい
遺伝研と富士通が次世代データベースシステムの共同研究開発
 
 
2004年12月27日
Last modified: Jun. 15, 2011