イネアノテーションプロジェクトデータベース (RAP-DB) 公開

2004年に日本を中心とする国際イネゲノム解読プロジェクト (International Rice Genome Sequencing Project : IRGSP) によってOryza sativa ssp. japonica cultivar Nipponbareゲノムの完全解読が達成され，イネ研究はポストゲノムの時代に突入しました (IRGSP, Nature. 2005 Aug 11;436 (7052):793 - 800)。

これを受けて世界中からイネ研究者・アノテーターが集結しマンパワーによりイネ全遺伝子を高精度に注釈付けする試み，イネアノテーションプロジェクト (Rice Annotation Project : RAP) が推進されています (論文準備中)。

RAP-DB は，RAP によって得られたイネゲノムの注釈情報を収録・公開することによって，この貴重な情報をイネ研究のコミュニティに還元するためのデータベースです (Nucleic Acids Research 2006年データベース特集号, in press)。RAP-DB は2種類のアノテーションビューアから成り，キーワードや配列類似性による検索機能を備えています。また完全長cDNA やTos17 ミュータントパネル等の有用情報へのリンクを持つことにより，イネゲノム学の「ハブ」となることを目指しています。

RAP-DBへはhttp://rapdb.lab.nig.ac.jp/よりアクセスできます。

（参考）

• IRGSP(International Rice Genome Sequencing Project)
• 更新情報 (Build4.0)(2005.8.31)
• DDBJ その他の生命情報リンク：生物ごとのデータベース（イネ）