• CONTIG行の内容が不正になっている ultra-contig エントリのアクセッション番号とバージョン番号は以下の通りです。現在，修正エントリを再公開しております。修正された ultra-contig の各エントリのバージョン番号は".4"となっております。
  ultra-contig エントリ (42 エントリ)

  DF076134.3,	DF076146.3,	DF076156.3,	DF076165.3,	DF076168.3,	DF076174.3,
  DF076189.3,	DF076197.3,	DF076201.3,	DF076203.3,	DF076205.3,	DF076217.3,
  DF076230.3,	DF076245.3,	DF076247.3,	DF076249.3,	DF076256.3,	DF076258.3,
  DF076269.3,	DF076279.3,	DF076281.3,	DF076285.3,	DF076298.3,	DF076306.3,
  DF076312.3,	DF076313.3,	DF076318.3,	DF076341.3,	DF076366.3,	DF076379.3,
  DF076386.3,	DF076387.3,	DF076391.3,	DF076408.3,	DF076411.3,	DF076417.3,
  DF076418.3,	DF076425.3,	DF076430.3,	DF076449.3,	DF076456.3,	DF076457.3
  

• CONTIG 行の内容が不正になっていた chromosome エントリのアクセッション番号とバージョン番号は以下の通りです。

  chromosome エントリ (20 エントリ)

  DG000001.1,	DG000002.1,	DG000003.1,	DG000004.1,	DG000005.1,
  DG000006.1,
  DG000008.1,	DG000009.1,	DG000010.1,	DG000011.1,	DG000012.1,	DG000013.1,
  DG000014.1,	DG000016.1,	DG000018.1,	DG000019.1,	DG000021.1,	DG000022.1,
  DG000023.1,	DG000024.1
  

Chromosome エントリにつきましては，24 エントリでバージョン番号を統一して管理するため，全 24 chromosomeエントリを次のように一括更新いたしました。

anonymous FTPサイト (ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/mass/Oryzias_latipes_CON/) で提供をさせていただいていた Oryzias latipes (メダカ) の CON ファイルのうち，以下の3ファイルには不正な CONTIG を含むエントリが含まれております。これらの3ファイルについては使用しないようにご注意願います。
現在，以下の3ファイルは削除させていただいており，修正後のファイルに差し替えております。

ご迷惑をおかけしましたことを心よりお詫び申し上げます。

• Cancer Genomics & Emerging Technologies (10/2-4)
• Computational Methods in Systems Biology (10/18-19)
• Computational Biology : Networks- The Language of Life (10/27-11/1)
• 3rd International E.Coli Alliance Conference on Systems Biology 2006 (10/31-11/3)
• 4th Rocky Mountains Bioinformatics Conference (12/1-3)
• Data Warehouse Technologies in Bioinformatics (12/4-6)

2007

• Bioinformatics Research and Development (3/12-14)
• 3rd IEEE Symposium on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (4/1-5)
• ISBRA 2007 (5/6-9)
• 23rd International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology (7/1-6)
• ISMB/ECCB (7/19-25)
• Computational Systems Bioinformatics (8/13-17)

• アクセッション番号：AP008207-AP008218 (12 entries)
  
  anonymousFTP 一括取得：ファイル名 Oryza_sativa_Japonica_Group_PLN_060831_1.seq.gz

• getentry：http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/top-j.html

また，RAP1アノテーション情報は国立遺伝学研究所にて公開されていますデータベース Rice Annotation Project Database (RAP-DB) でも閲覧できます。
関連ページ

• IRGSP(International Rice Genome Sequencing Project)
• DDBJ その他の生命情報リンク：生物ごとのデータベース（イネ）

• gap を含むデータでも連続したDNA配列の FASTA 形式での取得が可能になりました。
• 実体配列を持つ CONTIG エントリの実体配列の取得を可能にしました。
  （例：CM 000230）

• 期間：
  [DDBJ 由来エントリ] 2006年4月24日から5月24日
  [GenBank 由来エントリ] 2005年1月4日^*から2006年5月24日
  *上記 CH エントリをピースとしているエントリの初公開日から算出した発生日（例：CM000126）
• 原因：web 用検索プログラムの不具合
• 状況：上記期間に次の条件で検索を行なった場合正しい結果を得ることができませんでした。

ID指定に［Accession］を，データベースに［DNAデータベース］を，出力形式に［フラットファイル (DDBJ)］を，取得方法に［画面表示］を選択し，クエリ入力欄に下記の対象エントリを入力して検索を実行した場合

• 表示不可エントリ：（-->番号リストはこちら）
  [DDBJ 由来エントリ] 1121 エントリ
  [GenBank 由来エントリ] 1092 エントリ

• DDBJing 講習会のページ
• DDBJing 講習会資料ダウンロードページ

• 「解析配列データ」欄をページ上部へ移動しました。
• 「TYPE」を「ALIGN」から独立させました。
• 「TYPE」欄に「AUTOMATIC」を追加しました。
  ※ AUTOMATIC の場合，プログラムが配列の種類を自動判別して全てデフォルト値で解析を行います。

• 「DISTANCE」欄に「p-distance」を追加しました。
• 「KIMURA」オプションを「DISTANCE」へ統合しました。

• 17th Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching (7/5-7)
• SBMC 2006 (7/12-14)
• Diffraction Methods In Structural Biology (7/16-21)
• 第８回ＲＮＡミーティング (7/18-20)
• BioScience 2006 (7/23-27)
• CBI学会2006年大会：Integration of Chem-Bio-Pharma Informatics for Rational Drug Development and e-ADMET (7/24-26)
• 20th Symposium of The Protein Society (8/5-9)
• 12th Annual International Computing and Combinatorics Conference (8/15-18)
• Multi-Protein Complexes Involved in Cell Regulation (8/18-23)
• Models, Mysteries and Magic of Molecules (8/20-25)
• Microarray Data Analysis and Interpretation (8/23-25)
• Cellular and Molecular Basis of Regeneration and Tissue repair (9/10-15)
• 5th International NCCR Symposium on New Trends in Structural Biology (9/15-16)
• 3rd Biologie Prospective Santorini Conference 2006 (9/29-10/2)
• The American Society of Human Genetics 56th Annual Meeting (10/9-13)
• Quantitative PCR, Microarrays, and Biological Validation (10/23-24)
• HUPO 5th Annual World Congress (10/28-11/1)
• ICE-EM Summer Symposium in Bioinformatics (12/4-8)

2007

• Protein Expression (1/9-10)
• 5th IASTED International Conference on Biomedical Engineering (2/14-16)

• scaffold/CON DF076466-DF083206 (6741 エントリ)
      Oryzias_latipes_CON_060608_1.seq.gz

• ultra/CON DF083207-DF083411 (205 エントリ)
     Oryzias_latipes_CON_060613_1.seq.gz

• chromosome/CON DG000001-DG000024 (24 エントリ)
      Oryzias_latipes_CON_060615_1.seq.gz

これらは，それぞれ 6/8, 6/13, 6/15分の新着データとして DDBJ より公開されています。

ご迷惑をおかけしたことをお詫びいたします。

• 53rd Annual Systematics Symposium Missouri Botanical Garden (10/13-14)

• scaffold/CON DF069194-DF076129 (6936 エントリ)
      Oryzias_latipes_CON_060525_1.seq.gz

• ultra/CON DF076130-DF076465 (336 エントリ)
     Oryzias_latipes_CON_060531_1.seq.gz

• chromosome/CON DG000001-DG000024 (24 エントリ)
      Oryzias_latipes_CON_060605_1.seq.gz

これらは，それぞれ 5/25, 5/31, 6/5分の新着データとして DDBJ より公開されています。
※gap長の取り扱いに関する手違いのため，一部のエントリは更新されています。
anonymousFTP サイト

このバージョンアップにともない，FASTA と SSEARCH の検索結果の identity に関する表記が ungapped の　値から similar の値を表示する形式に変更されました。

• identity=完全一致でヒットした数/相同性があると判断された領域全体の数（ギャップ座位を含む）
• ungapped=完全一致でヒットした数/相同性があると判断された領域全体の数（ギャップ座位を含まない）
• similar=類似のアミノ酸を含めヒットした数/相同性があると判断された領域全体の数（ギャップ座位を含む）

バージョンアップ前の形式
>>sp|P94604|GYRB_CLOAB DNA gyrase subunit B (EC 5.99.1.3  (637 aa)
 initn: 178 init1: 116 opt: 185  Z-score: 272.1  bits: 57.1 E(): 5.2e-08
Smith-Waterman score: 185;  55.932% identity (61.111% ungapped) in 59 aa
overlap (1-58:167-221)

                                             10        20        30
query                                TTTHFVPDPEIFTETIEFDYDTLANRVREL
                                     :  .: :::::: .: :.:::::..:.:::
sp|P94 KTEGHIWKQTYHRGKVASPFEKIGDSDEHGTKIYFKPDPEIFEDT-EYDYDTLSQRLREL
        140       150       160       170       180        190

               40        50
query  AFLTKGVNIIIEDLREGKERKNE-YCYEG
       :::.::..: . : :.    ::: . :::
sp|P94 AFLNKGIKIELTDERHD---KNEIFHYEGGLKSFVSYLNRNKEVVFKEPIYVEGSIDSNY
         200       210          220       230       240       250

バージョンアップ後の形式
>>sp|P94604|GYRB_CLOAB DNA gyrase subunit B (EC 5.99.1.3  (637 aa)
 initn: 178 init1: 116 opt: 185  Z-score: 271.6  bits: 57.0 E(): 5.5e-08
Smith-Waterman score: 185;  55.932% identity (76.271% similar) in 59 aa
overlap (1-58:167-221)

                                             10        20        30
query                                TTTHFVPDPEIFTETIEFDYDTLANRVREL
                                     :  .: :::::: .: :.:::::..:.:::
sp|P94 KTEGHIWKQTYHRGKVASPFEKIGDSDEHGTKIYFKPDPEIFEDT-EYDYDTLSQRLREL
        140       150       160       170       180        190

               40        50
query  AFLTKGVNIIIEDLREGKERKNE-YCYEG
       :::.::..: . : :.    ::: . :::
sp|P94 AFLNKGIKIELTDERHD---KNEIFHYEGGLKSFVSYLNRNKEVVFKEPIYVEGSIDSNY
         200       210          220       230       240       250

２．web ページの画面レイアウト変更
検索配列データを指定する際には「検索配列データ」欄のテキストボックスかファイルアップロード機能を利用します。これまではこの欄がページ下部にありましたが，使いやすさを考慮して上部に移動しました。
３．Safariへの対応
FASTA，PSI-BLAST の結果表示画面の Safari への対応が完了しました。

• 6th International Conference for the Critical Assessment of Microarray Data Analysis (6/8-9)
• ASM Conference on Streptococcal Genetics (6/18-21)
• Computational and Statistical Aspects of Microarray
  Analysis (6/18-23)
• Behavior Genetics Association 36th Annual Conference
  (6/20-24)
• 3rd RECOMB Satellite Workshop on Regulatory Genomics (7/17-18)
• 1st International Conference on Computational Systems Biology (7/20-23)
• 2006 Yeast Genetics and Molecular Biology Meeting (7/25-30)
• Post-Transcriptional Gene Regulation, The Biology Of (8/13-18)
• Histochemistry 2006 (8/23-27)
• 3rd International Meeting on Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics (8/29-31)
• 6th Workshop on Algorithms in Bioinformatics (9/11-13)
• Nuclear Receptors 2006 (9/17-20)
• 4th RECOMB Comparative Genomics Satellite Workshop (9/24-26)
• 4th International Conference on Pathways, Networks, and Systems (10/8-13)
• 2006 Asia-Pacific Workshop on Genetic Programming (10/13-14)
• IEEE 6th Symposium on Bioinformatics & Bioengineering (10/16-18)
• International Conference on Structural Genomics 2006 (10/22-26)
• ISBMDA '06 (12/7-8)
• International Conference on Bioinformatics 2006 (12/18-20)

• 停電の発生時刻：5月22日00:19-19:00
• 影響のあったサービス：国立遺伝学研究所のネットワーク通信停止

ネットワークは復旧し，現在は正常にサービスを提供しています。ご迷惑をおかけいたしましたことをお詫びいたします。

• 発生時刻：5月20日16時から
• 影響のあるサービス：
  ARSA, BLAST, ClustalW, FASTA, getentry, Lib score, LIBRA-I,
  PDB Retriever, PSI-BLAST, SQmatch, SRS, SSEARCH, SSthread

• 発生時刻：5月22日0時10分から
• 影響のあるサービス：
  DDBJ HP, GIB, Mirroring H-InvDB, SAKURA, Txsearch,
  Vector Screening System

復旧次第，DDBJ のHP にてお知らせいたします。ご迷惑をお掛け致しますが，皆様のご理解とご協力お願い致します。

5月23日19時にサービスを再開しましたので，どうぞご利用下さい。 ご迷惑をおかけいたしましたことをおわび致します。

ご迷惑をおかけいたしましたことをお詫びいたします。

• FTP サービス
• データベース検索サービス（getentry*, SRS, ARSA）
• 相同性検索サービス (BLAST, FASTA, SSEARCH)*
• データ解析サービス (CLUSTALW）*

ご迷惑をお掛け致しますが，皆様のご理解とご協力お願い申し上げます。

作業が終了し，サービスを再開いたしました。どうぞご利用ください(5/15 18:00)

• International Multi-Symposiums on Computer & Computational Sciences (6/20-24)
• Gut Microbiology 2006 (6/21-23)
• 2nd Congress of the International Cytogenetics and Genome Society (6/25-29)
• The 2006 International Conference on Bioinformatics & Computational Biology (6/26-29)
• 11th International Conference on Crystallization of BioMacromolecules (8/16-21)
• 11th International Symposium on Microbial Ecology (8/20-25)
• QMB 2006 (8/29-9/1)
• 8th International Meeting on Human Genome Variation and Complex Genome Analysis (9/14-16)
• 10th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles (9/20-22)
• 14th Annual Meeting on Microbial Genomics (9/24-28)
• 2006 IEEE Symposium on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology (9/28-29)
• Biotechnology and Bioinformatics Symposium (10/20-21)
• 9th Annual Conference on Computational Genomics (10/28-31)
• Advances in Microarray Technology (10/31-11/2)
• 21st International Symposium on Computer and Information Sciences (11/1-3)
• Progress in Systems Biology 2006 (11/9-10)

2007

• PSB 2007 (1/3-7)
• 5th Asia Pacific Bioinformatics Conference (1/15-17)
• Genome Instability and Repair (1/17-22)
• MicroRNAs and siRNAs: Biological Functions and Mechanisms (1/28-2/2)
• RNAi for Target Validation and as a Therapeutic (1/28-2/2)

• Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 (by Sanger Institute)
• Streptococcus pyogenes MGAS9429 (by NIH)
• Streptococcus pyogenes MGAS10270 (by NIH)
• Streptococcus pyogenes MGAS2096 (by NIH)
• Streptococcus pyogenes MGAS10750 (by NIH)
• Acidobacteria bacterium Ellin345 (by JGI)
• Deinococcus geothermalis DSM 11300 (by JGI)
• Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 (by University of Minnesota)

5月10日17:00 にサービスを再開いたしましたのでどうぞご利用下さい。ご迷惑をおかけいたしましたことをお詫びいたします。

• ＦＴＰサービス
  
• データベース検索サービス（getentry*, SRS, ARSA）
  
• 相同性検索サービス(BLAST, FASTA, SSEARCH)*
  
• データ解析サービス(CLUSTALW）*
  

5月8日20:00 に障害が復旧し，サービスを再開いたしました。長期間の停止となりご迷惑をおかけいたしましたことをお詫びいたします。

• ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/mga/
• プロジェクトインデックス

関連ページ：

• 理研プレスリリース
• MGA 配列データについて

1. cDNA エントリ数が 56,419 から 167,992 に増加しました。
2. LOCUS エントリ数が 25,585 から 35,005 に増加しました。
3. ミラー H-Invitational Database (H-InvDB)* の version が "3.0" になりました。

*ミラー H-InvDB は近日中に更新されます。
H-Invitational 関連データベース

• 2nd International Symposium on Semantic Mining in Biomedicine (4/9-12)
• CDB Symposium 2006: Logic of Development: New Strategies and Concepts (4/10-12)
• 「東京大学の生命科学」 (4/15)
• 16th Penn State Plant Physiology Symposium RNA Biology : Novel Insights from Plant Systems (5/18-20)
• Signalling to Chromatin - Epigenetics (6/5-9)
• Atlantic Islands Neogene International Congress (6/12-14)
• Gene Networks: Theory and Application (6/26-29)
• EURO XXI 2006, 21st European Conference on Operational Research, Stream (7/2-5)
• 2nd Structural Bioinformatics and Computational Biophysics meeting (8/4-5)
• 2006 LSS Computational Systems Bioinformatics Conference (8/14-18)
• 日本進化学会2006年大会 (8/29-31)
• 2nd Automated Function Prediction Meeting (8/30-9/1)
• 29th European Peptide Symposium (9/3-8)
• Dynamic Organization of Nuclear Function (9/27-10/1)
• Germ Cells (10/11-15)
• Genomes, Medicine, and the Environment Conference (10/16-18)
• RNAi for Functional Analysis and Target Validation (10/25-26)
• 5th International Congress on Autoimmunity (11/29-12/3)
• Neurodegenerative Diseases: Biology & Therapeutics (11/30-12/3)

• 影響のあった範囲：DDBJRELEASE の AUTHORS と TITLE の一部
• 期間：
  AUTHORS に関する検索 2004/10～2006/3/13
  TITLE に関する検索 2006/2～2006/3/13

• 対応：対象となる項目の再インデクシング（3月13日対応済）

正しい検索ができない状況が続いていたことにより，ユーザの皆様にご迷惑をお掛けいたしましたことを深くお詫び申し上げます。

• ファイルの作成状況の確認
  下部フレームの，ファイル名の下の 「ファイル作成状況」をクリックすると作成状況を示すメッセージが 表示されます。

• ファイル作成完了通知メール
  メールアドレスを入力しますと ファイル作成完了後に通知メールを送信します。

3月上旬まで起こっていました「FTP ファイル転送」 選択時に一度に取得できるエントリが 5000 件程度に限られるという不具合は解消されましたので，今後はこの機能を大いにご利用下さい。

• オミックス情報シンポジウム (3/20-21)

• 国際ワークショップ「生物情報資源の相互運用性」 (3/17)
  
  ＤＤＢＪの菅原が講演します

• 影響期間：2006年2月19日12時から2月27日 15時30分まで
• 影響のあったサービス：PSI-BLAST を除く相同性検索の全サービス（WWW，E-mail とも）*

* S&W SEARCHにつきましては，データベースを反映させるのに若干の時間を要するため，もうしばらく復旧に時間が掛かります事をご了承下さい。
復旧しました。現在全てのサービスが正常です(3/1 02:15)。

• 期間：2006年2月19日より
• 影響のあるサービス：PSI-BLAST を除く相同性検索の全サービス（WWW，E-mail とも）
• 影響のあるデータベース：塩基配列データベース
• 影響のあるディビジョン：
  BCT（バクテリア(原核生物)）
  GSS (genome survey sequences)
  INV（無脊椎動物）
  MAM（哺乳類（ヒト，霊長類，齧歯類を除く））
  PLN（植物・酵母・藻類）
  ROD（齧歯類）
  SYN（合成配列 (合成遺伝子））
  VRT（脊椎動物）
  VRL（ウイルス）

ユーザの皆様にご迷惑をお掛しておりますことを深くお詫び申し上げます。

• ライフサイエンス合同シンポジウム2006 (3/14-15)
  ＤＤＢＪの五條堀が講演します
• ライフサイエンス合同シンポジウム2006 (3/23)
  ＤＤＢＪの五條堀が講演します

• MGED9-The Meeting of the Microarray Gene Expression Data Society (9/7-10)

• Optical Spectroscopy of Biomolecular Dynamics II (3/19-23)
• Symposium on Alternate Transcript Diversity II - Biology and Therapeutics (3/21-23)
• From Functional Genomics of Model Organisms to Crop Plants for Global Health (4/3-5)
• Advance in Functional Genomics (4/25-26)
• Genomics & Public Health (6/4-7)
• 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (7/16-22)
• RNAi Europe (9/28-29)
• International Congress of Immunogenomics and Immunomics (10/8-12)
• Computational and Systems Biology (11/13-15)
• Pharmacogenomics (11/15-18)

• 日時：3月14日から17日
• 場所：国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ 研究センター（静岡県三島市)
• 対象：バイオインフォマティックスの研究を行っているか行おうとしている大学院生かポストドクで，日本国籍を有し，英会話ができる人（日本からの参加定員10名）
• 特典：選考の上受講生に選ばれた人には旅費と滞在費支給（受講料無料），パソコン貸与
• 応募締切：2月20日

• 結果表示画面機能拡張
  結果表示画面の Graphical View および Text View について，以下の (1)，(2) による指定と，2つの間で AND または OR 条件での選択を可能としました。
  (1)E Value または Score：どちらか一つを選択し入力欄に値を指定してから SELECT ボタンをクリックすることで条件を満たす配列を選択することができます。
  (2) Overlapping Positions：query の範囲を指定し，Entirely または Partially を選択してから SELECT ボタンをクリックすることで条件を満たす配列を選択します（Entirely は入力した範囲がすべて含まれる場合，Partially は入力した範囲が部分的にでも含まれる場合に配列が選択されます。
  また，入力欄の片方にだけ値を指定すると入力した位置を含む配列が選択されます）。
  さらに複合条件として，E Value または Score の条件と Overlapping Positions の条件との間で，AND または OR を指定することも可能です。
  どちらかの条件しか使用しない場合は AND，OR の指定はどちらも同じ扱いです。

• ClustalW との連携機能の修正
  blastx, tblastx で検索し，Query とヒットしたエントリを選択して ClustalW へ連携すると，DNA 配列のエントリとアミノ酸配列のエントリが混在して設定されてしまいます。
  これを回避するために blastx, tblastx で検索した場合は，Query を選択できないよう変更しました。

• その他
  ClustalW オプション設定画面に移動するための "GO TO CLUSTALW" ボタンを GraphicalView の下だけでなく，上にも追加しました。スクロールの手間が省けます。

• CI000001-CI778739

これらは1月31日-2月2日分の新着データとして DDBJ より公開されており， FTP サイト から取得することができます。
- rice_EST1.seq.gz（CI000001-CI250000：圧縮サイズ83MB）
- rice_EST2.seq.gz（CI250001-CI500000：圧縮サイズ76MB）
- rice_EST3.seq.gz（CI500001-CI778739：圧縮サイズ79MB）

• AU116789-AU117215
• AU117217-AU144110
• AU144112-AU160826
• AU279383-AU280837
• BP192706-BP383670
• DA000001-DA999999
• DB000001-DB384947

これらは1/17-1/26分の新着データとして DDBJ より再公開されており，getentry で取得することができます。

• 期間：2004年7月より2006年1月20日まで
• 影響のあったサービス：PSI-BLAST を除く相同性検索の全サービス（WWW，E-mail とも）
• 状況：検索対象ディビジョンとして EST の S. tropicalis ディビジョンを指定して検索を行なってもヒットしない（EST division を「select-all」または「上記以外」を指定した場合にはヒットした）。
• 対応：データ作成処理および検索ページの表記を修正し，現在は正しい検索結果が得られます。
  なお，今後の防止対策として，データのチェックシステムを導入する予定です。

正しい検索ができない状況が長期間にわたって続いていたことにより，ユーザの皆様に多大なご迷惑をお掛けいたしましたことを深くお詫び申し上げます。

• DDBJ の活動の紹介
  "DDBJ in preparation for overview of research activities behind data submissions."
  Kousaku Okubo, Hideaki Sugawara, Takashi Gojobori and Yoshio Tateno
  Nucleic Acids Research, 2006, Vol. 34, Database issue D6-D9
  （内容）INSDC の結成，新規データベースの公開等の活動報告。特に，INSDC に登録されたデータの詳細な分析内容が "Breakdown Statistics"（統計の詳細）として DDBJ HP 上で公開されたことが詳しく記載されています。
  (PMID: 16381940)

• 新規データベース：BodyMap の紹介
  "BodyMap-Xs: anatomical breakdown of 17 million animal ESTs for
  cross-species comparison of gene expression."
  Osamu Ogasawara, Makiko Otsuji, Kouji Watanabe, Takayasu Iizuka,
  Takuro Tamura, Teruyoshi Hishiki, Shoko Kawamoto, and Kousaku Okubo
  BodyMap-Xs: anatomical breakdown of 17 million animal ESTs for
  cross-species comparison of gene expression
  Nucleic Acids Research, 2006, Vol. 34, Database issue D628-D631
  （内容）BodyMap-Xs は組織や細胞ごとの遺伝子発現データベースで，EST データを基に作成されています。
  (PMID: 16381946)

• 新規データベース：RAP-DB の紹介
  "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): hub for Oryza sativa
  ssp. japonica genome information."
  Hajime Ohyanagi, Tsuyoshi Tanaka, Hiroaki Sakai, Yasumasa Shigemoto,
  Kaori Yamaguchi, Takuya Habara, Yasuyuki Fujii, Baltazar A. Antonio,
  Yoshiaki Nagamura, Tadashi Imanishi, Kazuho Ikeo, Takeshi Itoh, Takashi
  Gojobori, and Takuji Sasaki
  Nucleic Acids Research, 2006, Vol. 34, Database issue D741-D744
  （内容）RAP-DB は、国際イネゲノム解読プロジェクトの成果に基づくイネの高精度アノテーション情報を収録したデータベースで，昨年１２月に 公開されました。
  
  (PMID: 16381971)

• Molecular Evolution (2/5-10)
• BIFI-2006 (2/8-11)
• 2006 Biophysical Society Annual Meeting (2/18-22)
• Computing Workshop: Getting the most from fission yeast genome date (3/15-16)
• Evolution of Biomolecular Structure, Vienna (5/25-27)
• Nucleic Acids (6/4-9)
• Symposium of Computations in Bioinformatics and Bioscience (SCBB06) (6/22-26)
• Genetic and Evolutionary Computation Conference (7/8-12)
• 4th International Workshop on Biological Data Management (9/4-8)
• 5th European Conference on Computational Biology 2006 (9/10-13)
• Genome Informatics (9/13-17)
• 2nd International Symposium on Computational Life Science (9/27-29)
• Metabolic Engineering VI: From recDNA towards Engineering Biological Systems (10/1-5)
• 7th International Conference on Sysytems Biology (10/9-13)
• Functional Genomics of Critical Illness and Injury (11/13-14)