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ヒト腸内微生物群 metagenomic WGS データ 353,805 エントリの公開

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Anonymous FTP から公開されている WGS データファイルの不具合に関するお詫び (2007.11.12)


ヒト腸内微生物群 metagenomic WGS データ 353,805 エントリの公開 2007.10.18
東京大学，奈良先端科学技術大学院大学，宮崎大学，徳島大学，独立行政法人海洋研究開発機構，麻布大学，北里大学，三菱総合研究所，理研ゲノム科学総合研究センターから登録された，ヒト腸内微生物群メタゲノム WGS データ 353,805 エントリが公開されました。

研究成果は以下の論文に紹介されています。

Kurokawa,K. et al. (2007). DNA Res. 18:1-13


アクセッション番号は以下の通りです。

BAAU01000001-BAAU01028900 (28900 entries) (BAAU.gz)
BAAV01000001-BAAV01036326 (36326 entries) (BAAV.gz)
BAAW01000001-BAAW01016539 (16539 entries) (BAAW.gz)
BAAX01000001-BAAX01036455 (36455 entries) (BAAX.gz)
BAAY01000001-BAAY01030198 (30198 entries) (BAAY.gz)
BAAZ01000001-BAAZ01031237 (31237 entries) (BAAZ.gz)
BABA01000001-BABA01035177 (35177 entries) (BABA.gz)
BABB01000001-BABB01020226 (20226 entries) (BABB.gz)
BABC01000001-BABC01009958 ( 9958 entries) (BABC.gz)
BABD01000001-BABD01037296 (37296 entries) (BABD.gz)
BABE01000001-BABE01020532 (20532 entries) (BABE.gz)
BABF01000001-BABF01016164 (16164 entries) (BABF.gz)
BABG01000001-BABG01034797 (34797 entries) (BABG.gz)

これらは10/18分の新着データとしてDDBJより公開されており， Anonymous FTP 一括取得が可能です（ファイル名はカッコ内）。

参考：

2007年10月18日

 
Anonymous FTP から公開されている WGSデータファイルの不具合に関するお詫び (2007.11.12)
Anonymous FTP の /database/wgs/ 配下もしくは /database2/wgs/ 配下に存在する BAAU.gz から BABG.gz までの計１３ファイルに おきまして，エントリが２重に存在したまま公開されておりました。 これらのファイルには，ヒト腸内微生物群 metagenomic WGS データエントリに 対応する塩基配列公開ファイル(フラットファイル)が含まれております。

みなさまにご不便をおかけしたことを心よりお詫びいたします。 現時点で，エントリが２重に存在する問題は修正されております。 該当期間中にファイルを取得された場合は，修正済みの該当ファイルを 取得しなおしていただけるようお願い申し上げます。

公開ファイル(フラットファイル)が２重に含まれていた期間，および， 該当ファイルと各ファイルに含まれるアクセッション番号は以下の通りです。

  • 期間:2007.10.18 - 2007.11.12 12:30 PM
  • 該当ファイルの詳細
    ファイル名アクセッション番号
    BAAU.gz BAAU01000001-BAAU01028900
    BAAV.gz BAAV01000001-BAAV01036326
    BAAW.gz BAAW01000001-BAAW01016539
    BAAX.gz BAAX01000001-BAAX01036455
    BAAY.gz BAAY01000001-BAAY01030198
    BAAZ.gz BAAZ01000001-BAAZ01031237
    BABA.gz BABA01000001-BABA01035177
    BABB.gz BABB01000001-BABB01020226
    BABC.gz BABC01000001-BABC01009958
    BABD.gz BABD01000001-BABD01037296
    BABE.gz BABE01000001-BABE01020532
    BABF.gz BABF01000001-BABF01016164
    BABG.gz BABG01000001-BABG01034797
  ヒト腸内微生物群 metagenomic WGS データ 353,805 エントリの公開 2007.10.18
Last modified: Jun. 15, 2011