DNA Data Bank of Japan

ARSA 7月に引き続きさらに機能強化

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DDBJ では,7月に続き高速キーワード検索システム ARSA(All-round Retrieval of Sequence and Annotation) に大幅な機能強化をおこないました。

ARSA は,下記のような特徴を有しています。
  • DDBJ (国際塩基配列データベース)を始めとする24種類/3000万件のデータベースを対象に高速なキーワード検索を実現
  • 複雑な検索条件や大量のヒットがある条件で検索しても,24種類すべてのデータベースに対して高速な検索レスポンスを提供
  • DDBJ を対象にした検索では,Features/Qualifiers を指定した詳細な条件による検索が可能
  • SOAP/REST による各種 WEB API の利用が可能


上記に加え,今回追加された主な新機能は下記の通りです。
  • 検索対象 DB への KEGG/PATHWAY データベースの追加
    検索対象となるデータベースに KEGG/PATHWAY を追加しています。 検索結果のリンクをクリックすることで,KEGG の PATHWAY マップを表示することも可能です。

  • DDBJ 以外のデータベースに対する詳細検索機能
    これまで DDBJ 以外の DB については,全文検索のみを提供してきました。今回の機能改善により,全データベースについて,項目を指定した詳細検索が可能になります。(TOP 画面で単一 DB を選択し,Cross Seaerch ボタンを押下)

  • 全24データベースの共通項目による串刺し検索機能
    上記2. で提供する詳細検索機能について,複数 DB を選択し, 共通項目にて串刺し検索を行うことが可能です。(TOP 画面で複数 DB を選択し,Cross Seaerch ボタンを押下)


また,上記以外に下記機能修正・改善を行っています。
  • 検索条件に &(AND 条件), |(OR 条件) を直接入力可能に
    入力例はこちらを参照
  • Refine Search の拡張 (下記文字列についても絞り込み検索が可能になります)
    '」, 「(」, 「)」, 「」, 「
arsatop
新 ARSA トップページ
  
arsatop
Cross Search ヒットカウント表示画面

DDBJ では,今後さらに,皆様からのご意見をもとにして,より使いやすく強力なキーワード検索システムを目指して機能拡張を進めていきます。
ARSA にて 「Your Comment」 をクリックして, 批判とご提案をご記入下さい。

2007年11月2日
Last modified: Jun. 15, 2011