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「ライフサイエンス・データベース講習会 in 名大」のお知らせ

下記の要領で,「ライフサイエンス・データベース講習会 in 名大」 を開催いたします。現在参加申し込み受付中です。多くの方の参加をお待ちしています。

日 時 2010年8月9日(水), 10日(火)
場 所 名古屋大学情報文化学部棟(全学教育棟) SIS ラボ(地図の41番の建物) 
代表者 名古屋大学情報文化学部 太田元規
大阪大学タンパク質研究所 中村春木
参加費用 無料
申し込み方法 PDBj 専用ホームページにて受付
全日程,並びに各 Part ごとの申し込みが可能です
詳細 PDBj ホームページ

プログラム:

第1日目 8月9日(月)   13:00〜17:40
時間講義内容・講師
13:00-13:20 ライフサイエンス統合データベースと国のDB施策
高木 利久 (ライフサイエンス統合データベースセンター)
13:20-14:00 LSDB(生命科学統合データベース)の利用法
川本 祥子(ライフサイエンス統合データベースセンター)
14:00-14:20 データベースアーカイブとTogoProtによるデータベース共有と統合化
畠中 秀樹(ライフサイエンス統合データベースセンター)
  休憩
14:40-15:20 DBCLS Galaxy ではじめるゲノムスケールデータの共同研究
山口 敦子,中尾 光輝 (ライフサイエンス統合データベースセンター)
15:20-15:50 文献執筆支援ツールAllie、inMeXes、TogoDoc
DBCLS講師陣(ライフサイエンス統合データベースセンター)
  休憩
16:10-16:40 DDBJ past and future
大久保 公策(国立遺伝学研究所, DDBJ)
16:40-17:10 DDBJ collaborates with DBCLS to cope with BigData
中村 保一(国立遺伝学研究所, DDBJ)
17:10-17:40 Parsing the Legacy DDBJ-- old but new
小笠原 理(国立遺伝学研究所, DDBJ)
 
第2日目 8月10日(火)9:30〜16:30
時間講義内容・講師
9:30-10:00 日本蛋白質構造データバンク(PDBj)と wwPDB
中村 春木 (大阪大学蛋白質研究所)
10:00-11:00 PDBのデータとその見方・探し方
金城 玲(大阪大学蛋白質研究所)
休憩
11:15-12:00 EM NavigatorとYorodumiで3次元構造を眺める
鈴木 博文(大阪大学蛋白質研究所)
  昼休み
13:30-14:30 配列アラインメントプログラムMAFFTとその構造への拡張 - MAFFTash -」
加藤 和貴,藤 博幸(産業技術総合研究所・生命情報工学研究センター)
休憩
14:45-15:30 eF-site/eF-surf/eF-seekによる蛋白質分子表面の活用
木下 賢吾(東北大学大学院情報科学研究科)
休憩
15:45-16:30 A Functional Annotation Pipeline for Orphan Seauences
Daron M. Standley(大阪大学免疫学フロンティア研究センター)
 

参加申込み方法:

PDBj 専用ホームページよりお申込み下さい。