「ライフサイエンス・データベース講習会 in 名大」のお知らせ
下記の要領で,「ライフサイエンス・データベース講習会 in 名大」 を開催いたします。現在参加申し込み受付中です。多くの方の参加をお待ちしています。
| 日 時 | : | 2010年8月9日(水), 10日(火) | ![]() |
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| 場 所 | : | 名古屋大学情報文化学部棟(全学教育棟) SIS ラボ(地図の41番の建物) | ![]() |
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| 代表者 | : | 名古屋大学情報文化学部 太田元規 大阪大学タンパク質研究所 中村春木 |
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| 参加費用 | : | 無料 | ![]() |
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| 申し込み方法 | : | PDBj 専用ホームページにて受付 全日程,並びに各 Part ごとの申し込みが可能です |
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| 詳細 | : | PDBj ホームページ | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() |
プログラム:
| 第1日目 8月9日(月) 13:00〜17:40 | |
| 時間 | 講義内容・講師 |
| ライフサイエンス統合データベースと国のDB施策 | |
| 高木 利久 (ライフサイエンス統合データベースセンター) | |
| 13:20-14:00 | LSDB(生命科学統合データベース)の利用法 |
| 川本 祥子(ライフサイエンス統合データベースセンター) | |
| 14:00-14:20 | データベースアーカイブとTogoProtによるデータベース共有と統合化 |
| 畠中 秀樹(ライフサイエンス統合データベースセンター) | |
| 休憩 | |
| 14:40-15:20 | DBCLS Galaxy ではじめるゲノムスケールデータの共同研究 |
| 山口 敦子,中尾 光輝 (ライフサイエンス統合データベースセンター) | |
| 15:20-15:50 | 文献執筆支援ツールAllie、inMeXes、TogoDoc |
| DBCLS講師陣(ライフサイエンス統合データベースセンター) | |
| 休憩 | |
| 16:10-16:40 | DDBJ past and future |
| 大久保 公策(国立遺伝学研究所, DDBJ) | |
| 16:40-17:10 | DDBJ collaborates with DBCLS to cope with BigData |
| 中村 保一(国立遺伝学研究所, DDBJ) | |
| 17:10-17:40 | Parsing the Legacy DDBJ-- old but new |
| 小笠原 理(国立遺伝学研究所, DDBJ) | |
| 第2日目 8月10日(火)9:30〜16:30 | |
| 時間 | 講義内容・講師 |
| 9:30-10:00 | 日本蛋白質構造データバンク(PDBj)と wwPDB |
| 中村 春木 (大阪大学蛋白質研究所) | |
| 10:00-11:00 | PDBのデータとその見方・探し方 |
| 金城 玲(大阪大学蛋白質研究所) | |
| 休憩 | |
| 11:15-12:00 | EM NavigatorとYorodumiで3次元構造を眺める |
| 鈴木 博文(大阪大学蛋白質研究所) | |
| 昼休み | |
| 13:30-14:30 | 配列アラインメントプログラムMAFFTとその構造への拡張 - MAFFTash -」 |
| 加藤 和貴,藤 博幸(産業技術総合研究所・生命情報工学研究センター) | |
| 休憩 | |
| 14:45-15:30 | eF-site/eF-surf/eF-seekによる蛋白質分子表面の活用 |
| 木下 賢吾(東北大学大学院情報科学研究科) | |
| 休憩 | |
| 15:45-16:30 | A Functional Annotation Pipeline for Orphan Seauences> |
| Daron M. Standley(大阪大学免疫学フロンティア研究センター) | |
参加申込み方法:
- PDBj 専用ホームページよりお申込み下さい。

