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DDBJ・DAD リリースならびに新着データの FASTA 形式変更 

DDBJ が管理・収集している塩基配列データベースは,「DDBJ・DAD リリース」として定期的に年4回オンライン上で公開しています。 また,最新の DDBJ・DAD 定期リリースの締め日以降に公開されたデータは,「DDBJ・DAD 新着データ」として毎日公開されています。

「DDBJ・DAD 定期リリース」ならびに「DDBJ・DAD 新着データ」の FASTA 形式に変更をおこないました。詳細は以下のとおりです。
:DDBJ リリースデータをもとにしたアミノ酸配列データベース

変更のあったデータの種類 (全て anonymous FTP にて取得可能)

データの種類 変更内容 適用範囲
ddbj,ddbjnew/fasta 大文字 → 小文字 変換 DDBJ 定期リリース83 ならびに
DDBJ 定期リリース83締め日以降の新着データより
ddbj,ddbjnew/cdsdb エントリ末尾の「//」を削除
dad,dadnew/fasta DAD 定期リリース53 ならびに
DAD 定期リリース53締め日以降の新着データより

以下のサービスにも変更が生じました。

データベースの種類 変更内容 適用範囲
getentry
DNA データベース
CDS アミノ酸配列 FASTA エントリ末尾の「//」を削除 DDBJ 定期リリース83 締め日以降
CDS 塩基配列 FASTA
PROTEIN データベース
アミノ酸配列 FASTA エントリ末尾の「//」を削除 DAD 定期リリース53締め日以降
塩基配列 FASTA (for DAD)
 
supernig
ddbj,ddbjnew/fasta大文字 → 小文字 変換 DDBJ 定期リリース83ならびに
DDBJ 定期リリース83締め日以降の新着データより
dad/fasta エントリ末尾の「//」を削除 DAD 定期リリース53より

2010年9月15日