- 時間:2009年12月28日(月)0:00 - 12:30 (JST)
- 状況:解析内容送信後に受付番号は表示されるが,結果が表示されない
- 原因:一定期間経過後に自動的に削除されるはずの結果が削除されなかったために,システムが受け付ける解析数が上限に達してしまい,新規の解析ができなくなってしまった
- 対応:一定期間を経過した解析を手動で削除し,システムを復旧させた。
現在は正しく解析が行われていますが,上記期間内に送信された解析については,大変申し訳ありませんが,再度解析の実行をお願いいたします。
ユーザの皆様にご迷惑をお掛けいたしました事を深くお詫び申し上げます。皆様のご理解とご協力をお願いいたします。
- エントリ数:112,314,250 塩基数:109,636,862,252
- 今リリースより DDBJ flat file の source 行の記述形式が変更に(organism name と organelle name の表示順序が変更)なりました。また,一部の DDBJ flat file で,一般名表記が含まれるようになりました。詳細は DDBJ Release Note をご覧下さい。
- 現在公開されているリリースの情報
"DDBJ launches a new archive database with analytical tools for next-generation sequence data"
Kaminuma E, Mashima J, Kodama Y, Gojobori T, Ogasawara O, Okubo K, Takagi T and Nakamura Y.
Nucleic Acids Research, 2010, Vol. 38, Database issue D33-D38
"Archiving next generation sequencing data"
Shumway M, Cochrane G and Sugawara H.
Nucleic Acids Research, 2010, Vol. 38, Database issue D870-D871
H-InvDB は,ヒトの遺伝子と転写産物を対象とした統合データベースです。CIB-DDBJ では,2004年4月に H-Invitational で解析されたヒト完全長 cDNA データセットの機能アノテーションの成果を公開するためのデータベース(H-Inv DB)を独立行政法人 産業技術総合研究所 バイオメディシナル情報研究センター(BIRC)と共同で構築し,ミラーサイトを公開していました。また,H-Invitational で付与された機能アノテーションを国際塩基配列データベースに準拠した形式のフラットファイルで表示し,H-Invitational Database CIB-DDBJ Flat File Server を公開していました。
H-InvDB サイトは,BIRC H-InvDB をご利用下さい。長い間ご利用頂きありがとうございました。
アクセッション番号 (Anonymous FTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。
- AMAAA0000001-AMAAA0023916 (AMAAA_variable.gz ) (23,916 entries)
- AMAAB0000001-AMAAB0024086 (AMAAB_variable.gz ) (24,086 entries)
関連サイト
これらは12月4日分の新着データとして DDBJ より公開されております。
アクセッション番号 (Anonymous FTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。
- BABL01000001-BABL01046645 (BABL.gz) (46,645 entries)
関連サイト
これらは11月30日分の新着データとして DDBJ より公開されております。
| サービス名 | 停止期間 |
| SAKURA | 11月27日(金) 13:00~11月30日(月) 12:00(再開済) |
|
getentry,ARSA, 相同性検索システム,ClustalW, TXSearch,ベクタースクリーニングシステム, Anonymous-FTP |
11月27日(金) 17:00~11月30日(月) 11:00(再開済) |
| H-Inv DB(ミラーサーバ) | 11月27日(金) 17:00~11月30日(月) 11:00(再開済) |
| DDBJ HP | 11月27日(金) 17:00~11月29日(日) 18:00 (再開済) |
| GIB | 11月27日(金) 10:00~11月30日(月) 11:00(再開済) |
| 大型計算機(supernig) | 11月27日(金) 17:00~11月30日(月) 9:00 (再開済) |
皆様には大変ご迷惑をお掛けいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
全てのサービスが再開しました。ご協力ありがとうございました。(11月30日11時 JST)

アクセッション番号 (Anonymous FTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。
- BABP01000001-BABP01100783 (BABP.gz) (100,783 entries)
関連サイト
これらは11月6日分の新着データとして DDBJ より公開されております。

関連サイト
- 停止期間: 2009年11月3日(火)11時30分より11月4日(水)13時30分まで
- 停止サービス: ARSA の DDBJ,DAD 以外(全18DB)検索の一時休止
- 備考: 上記停止期間において,ARSA で DDBJ,DAD の検索は可能な状況でした。
- 対応状況:
・11月4日13:30現在,10月25日時点のデータを検索が可能な状況に復旧しております。
・最新のデータに復旧後,再度アナウンスさせて頂きます。
ユーザの皆様にはご迷惑をお掛けいたしました事を深くお詫び申し上げます。
復旧作業は終了しました。(11月05日 13時30分)
うち,BLAST の Text View での結果表示画面にて,不具合が発生していたことが判明しました。詳細は以下の通りです。
- 期間:2007年2月27日から2009年10月22日まで
- 対象サービス:BLAST
- 不具合の内容:BLAST の結果表示方法で Text View を選択した場合,結果表示画面にて,ClustalW 解析を行うための配列選択用
のチェックボックスの位置がずれていた。そのため,配列を選択して「GO TO CLUSTALW」をクリックした時に,選択した配列の1つ下の
配列が入力されてしまっていた。
なお,この不具合は表示のみに限定され,BLAST の検索結果には問題ありませんでした。 - 対応:チェックボックスと配列が正しく並ぶように修正し,現在は正しく配置されています。
ユーザの皆様には長期間にわたりご迷惑をお掛けいたしました事を深くお詫び申し上ると共に,今後このような事態が発生することのないよう努めます。
アクセッション番号 (Anonymous FTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。
- Solanum melongena: FS000001-FS098086 (98,086 entries) (Solanum_melongena_EST_091020_1.seq.gz)
- Solanum torvum : FS098087-FS126465 (28,379 entries)(Solanum_torvum_EST_091020_1.seq.gz)
これらは10月20日分の新着データとしてDDBJより公開されております。
- 公開日:2009年10月14日
- エントリ数:15,359,639 総アミノ残基数:4,200,060,817
- DAD Release Note
- 現在公開されているリリースの情報
- 休止期間: 2009年10月20日(火)9時から18時まで (作業が完了次第 サービスを再開し,HP にてお知らせいたします。)
- 休止サービス:
・ARSA の DDBJ,DAD 検索(その他 18DB は利用可能です。検索結果中に DDBJ ならびに DAD の検索結果は含まれません。)
・TXSearch からの ARSA 参照機能
・DDBJ HP (上部検索窓) からの DNA/Protein/AllDBs 検索機能 - 休止理由: DDBJ リリース79.0, DAD リリース49.0 の更新作業
ご迷惑をおかけいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
保守作業は終了しました。ご協力ありがとうございました。(10月20日17時15分)
- 日時: 2009年11月26日(木)~27日(金)
- 場所: ライフサイエンス統合データベースセンター 東京都文京区弥生2-11-16 東京大学工学部12号館5階
- 主催: 国立遺伝学研究所 JST BIRD 受託事業「バイオ情報資源の高準化と共有化」
- 協力: ライフサイエンス統合データベースセンター
- 参加費: 無料(懇親会参加費は別途 ¥1,000.-)
<プログラム内容>
「バイオ分野のデータベースを調べる」「バイオ分野の解析ツールを調べる」「WABI を用いた問題解決例の紹介」「ライフサイエンスDB 統合の動向」「実習のための問題提示および解決に向けた討論」などの講義,実習
本ワークショップでは,WABI や他機関が提供するデータベース・解析ツールを利用してバイオ分野で日々実際に取り組まれている解析の一連の手順(ワークフロー)を効率化する方法について、講義と実習によって学ぶことができます。
プログラミングの経験が無い方でも、Web ブラウザ上の操作だけで一連の手順構築をご経験頂けます。また,プログラミングの経験がある方は,遺伝研やNCBI,EBI などが整備してきたデータベースや解析ツールをプログラム内から利用するためのWeb API を選択・組み合わせて一連の解析手順を構築して頂きます。
<参加申込>
現在申込受付中。お申込,お問い合わせ等の詳細は こちらへ
定員に達しましたので,受付を終了しました(11/17)。
- エントリ数:108,593,519 塩基数:106,684,379,504
- DDBJ Release Note
- 現在公開されているリリースの情報
これまでは, TPA(Third-Party Annotaion) データは, ddbj, ddbjnew (デイリー更新データ), wgs のディレクトリに散在していましたが, 今後は TPA関連データを tpa ディレクトリ配下に一元化して提供いたします。ddbj_database 以下の構成の詳細は,同ディレクトリ内の README.TXT をご参照下さい。定期監視されている場合は, お早めの変更をお願いいたします。
アクセッション番号は AP008207-AP008218 です。また,この更新により,日本を中心とした国際的なイネゲノムアノテーションプロジェクト,The Second Rice Annotation Project Meeting (RAP2) の解析結果が付加され,約28,000個のタンパク質コード領域(CDS)が記載されました。
アクセッション番号 (Anonymous FTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。

- AP008207-AP008218 (Oryza_sativa_Japonica_Group_CON_090807_1.seq.gz) (12 entries)
関連サイト
- Rice Annotation Project Database (RAP-DB)
- IRGSP (International Rice Genome Sequencing Project)
- DDBJ その他の生命情報リンク : 生物ごとのデータベース(イネ)
- RAP 1 (build 3)
その後の調査により,データベースについても一部不具合が発生していた可能性があり,休止時刻前後に送信されたクエリについての検索・解析結果が保証されない状況であることが判明いたしました。そのため,下記時間帯に送信されたクエリについては,検索・解析の再実行をお願いいたします。なお,相同性検索ならびに ClustalW は現在はサービスを再開しており,正常な検索・解析が行なえることを確認しております。
- 対象クエリ:サービス停止時刻(2009年8月2日6:00(JST)) 前後よりサービス再開時刻(8月3日 17:40(JST) までに送信されたもの
ご迷惑をお掛けいたしますことを重ねてお詫びいたします。
ご迷惑をお掛けいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
復旧作業が終了し,サービスを再開しました。長時間にわたるサービス休止により,ユーザの皆様に大変ご迷惑をお掛けしましたことをお詫びいたします。(8月3日 17時40分)
-
日本たばこ産業から登録されたタバコ (Nicotiana tabacum) の
EST データ 65,102 エントリが公開されました。アクセッション番号 (Anonymous FTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。
- FS373218-FS438319 (Nicotiana_tabacum_EST_090723_1.seq.gz) (65,102 entries)
これらは7月23日分の新着データとして DDBJ より公開されております。
- 日時:2009年7月19日(日) 9時58分より
- 内容: ARSA の DDBJ 検索の一時休止
- 備考:現在 ARSA でその他( 19DS )での検索は可能です。検索結果中に DDBJ の検索結果は含まれません。
ご迷惑をお掛けいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
復旧作業は終了しました。ご協力ありがとうございました。(7月21日 19時50分)
"Web API for biology with a workflow navigation system"
Yeondae Kwon, Yasumasa Shigemoto, Yoshikazu Kuwana and Hideaki Sugawara
Nucleic Acids Research, 2009, Vol. 37, No. suppl_2 W11-W16
- 公開日:2009年7月14日
- エントリ数:14,710,673 総アミノ残基数:3,992,515,218
- DAD Release Note
- 現在公開されているリリースの情報
- 休止期間:2009年7月15日(水)9時から20時まで (作業が完了次第 サービスを再開し,HP にてお知らせいたします)
- 休止サービス:
・ARSA の DDBJ, DAD 検索(その他 18DB は利用可能です。検索結果中にDDBJ ならびに DAD の検索結果は含まれません。)
・TXSearch からの ARSA 参照機能
・DDBJ HP (上部検索窓) からの DNA/Protein/AllDBs 検索機能 - 休止理由:システムメンテナンスおよび DDBJ リリース78.0, DAD リリース48.0 の更新作業
ご迷惑をお掛けいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
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ご迷惑をお掛けいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
メンテナンス作業は終了しました。ご協力ありがとうございました。(7月13日14時00分)
- エントリ数:105,737,359 塩基数:104,597,360,291
- DDBJ Release Note
- 現在公開されているリリースの情報
2009年2月に,getentry にてサプレスエントリを検索した際に,一部のケースで誤った出力形式の結果が表示される状態が発生しておりましたが,このたび修正対応が完了し,正しい結果表示が可能となりました。
備考:getentry でサプレスエントリのデータが正しく表示されないことへのお詫び 2009.2.26
ユーザの皆さまにはご迷惑をお掛けいたしました事を深くお詫び申し上げます。
- 休止日時:2009年6月30日(火) 9時より 7月2日(木) 17時まで
- 理由:システムメンテナンス(OS バージョンアップ)
皆様には大変ご迷惑をお掛けいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
保守作業は終了しました。ご協力ありがとうございました。(7月1日14時45分)
- 期間:2009年6月2日(火)20:32 (JST) - 6月3日(水)15:00 (JST)
- 対象サービス:BLAST,PSI-BLAST
- 対象データ:アミノ酸デフォルトデータ,Uniprot,Uniprot/TrEMBL
- 不具合の状況:上記条件で検索した場合、結果がヘッダのみで、検索結果が表示されない
- 原因:対象データのfastaデータに想定を超える長大データが存在したため
- 対応:既に対応が完了し,現在は正常に検索・解析を行なうことが可能です。
該当期間中にご利用いただきました解析については,再度,検索・解析の実行をお願いいたします。
ユーザの皆様にご迷惑をお掛けいたしました事を深くお詫び申し上げます。皆様のご理解とご協力をお願いいたします。
アクセッション番号は以下の通りです。
- AHAAB0000001-AHAAB0547473
- AHAAC0000001-AHAAC1704525
- AHAAD0000001-AHAAD2196220
(total 4,448,218 entries)
関連ページ: MGA 配列データについて
Anonymous FTP 一括取得:AH_resource_index
これらは6月1日分の新着データとして DDBJ より公開されております。
g)利用申請継続手続きについての再度のご案内などです。ホームページでもご覧になれますが,お申込み頂いた方にはメール配信をいたします。配信を希望される方は,申込み・変更ページで簡単に手続きができますので,この機会に是非お申し込み下さい。
- 期間:2009年5月12日(火)18:15 頃 (JST) - 22:20 頃(JST)
現在は全てのサービスが復旧しており,正常に検索・解析を行なうことができます。 - 影響のあるサービス:FASTA,BLAST,PSI-BLAST,SSEARCH,HMMPFAM,ClustalW
- 原因:システム障害のため
- 該当期間中に投入されたクエリについては,正常に受け付けたもの(リクエストIDが発行されたもの)と受付不可となったものとがあります。正常に受け付けたものについては現在順次解析を実行中です。受付不可となったもの(リクエスト ID が発行されなかったもの)については,お手数ですが,再度,入力・送信をお願いいたします。
ユーザの皆様にご迷惑をお掛けいたしました事を深くお詫び申し上げます。皆様のご理解とご協力をお願いいたします。
- 京都大学から登録されたアカハライモリ(別名:ニホンイモリ)(Cynops pyrrhogaster) 由来の EST データ 25,600 エントリが公開されました。
アクセッション番号は以下の通りです。- FS290155-FS315754(25,600 entries)
これらは4月25日分の新着データとしてDDBJより公開されており,getentry から検索可能です。
(写真は登録者提供)
アクセッション番号 (Anonymous FTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。
- FJ966079-FJ966086
- FJ966952-FJ966983
参照 URL:
上記配列のうち,HA(ヘマグルチニン)遺伝子について,ClastalW を利用し作成した系統樹
結果画像
アクセッション番号 (Anonymous FTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。
- FS238592-FS289185 (Glycyrrhiza_uralensis_EST_090424_1.seq.gz) (50,594 entries)
これらは4月24日分の新着データとしてDDBJより公開されております。
- 休止期間:2009年4月21日(火)10時から22日(水)18時まで (終了次第 HP にてお知らせいたします)
- 休止サービス:
・ARSA
・TXSearch からの ARSA 参照機能
・DDBJ HP (上部検索窓) からの DNA/Protein/AllDBs 検索機能 - 休止理由:サーバ増強作業および DDBJ リリース77.0, DAD リリース47.0 の更新作業
ご迷惑をお掛けいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
保守作業は終了しました。ご協力ありがとうございました。(4月22日16時40分)
- 対象データベース : Protein データベースの Patent
- 該当アクセッション番号:DI500718 - DI613550 のうち4,541 エントリ(別紙参照)
- 公開されていた期間: 2009年3月31日から4月8日まで
- 原因:既公開データに関して誤りのあった部分を修正し再公開する作業において,特許番号とアクセッション番号の対応関係がずれてしまった
- 対応:問題があった修正分データは削除済で,現在は修正前の状態に戻っています。再公開分のデータについては,是正が完了次第,再公開する予定です。誤ったデータを是正の上,再公開致しました。現在は,getentry にて,正しいデータが取得できます。( 5月 1日)
ユーザの皆さまにはご迷惑をお掛けしますことをお詫びいたします。
- 公開日:2009年4月13日
- エントリ数:14,237,430 総アミノ残基数:3,845,458,844aa
- DAD Release Note
- 現在公開されているリリースの情報
緊急の保守作業のため,サービスを一時休止いたします。詳細は以下の通りです。
- 休止期間:2009年4月14日 9:00 から 17:00 まで
- 休止理由:システム保守作業の為
急なお知らせでご迷惑をお掛けしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
保守作業は終了しました。ご協力ありがとうございました。(4月14日18時00分)
- 停電の発生時刻:2009年4月12日(日) 5時頃
- 影響のあったサービス:国立遺伝学研究所のネットワーク通信
- すべてのサービスが停止した期間:4月12日(日)5時時頃~4月13日(月)11時20分
現在全てのサービスが復旧しています。ご迷惑をお掛けしましたことをお詫びいたします。
参照 URL:
http://www.anim.med.kyoto-u.ac.jp
アクセッション番号 (Anonymous FTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。
- FT000001-FT227486 (Rattus_norvegicus_GSS_090401_1.seq.gz) (227,486 entries)
これらは4月1日分の新着データとしてDDBJより公開されております。
- エントリ数:102,099,156 塩基数:101,765,388,414
- DDBJ Release Note
- 現在公開されているリリースの情報
- 休止日時: 2009年3月31(火) 9時より 4月1日(水) 17時まで
- 理由:ハードウェアの移設作業のため
ユーザの皆様にはご迷惑をお掛けいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
サービスを再開しました。(4月1日)
参照 URL:
http://www.pgb.kazusa.or.jp/kaftom/
http://www.kazusa.or.jp/jsol/microtom/indexj.html
アクセッション番号 (Anonymous FTP 一括取得ファイル名) は以下の通りです。
- full length cDNA:
AK319176-AK330134 (Solanum_lycopersicum_HTC_090319_1.seq.gz) (10,959 entries) - EST:
FS179211-FS206426 (Solanum_lycopersicum_EST_090319_1.seq.gz) (27,216 entries)
これらは3月19日分の新着データとして DDBJ より公開されております。
- 期間:2009年3月8日(日)17:55 (JST) - 3月9日(月)09:08 (JST)
- 影響のあるサービス:FASTA,BLAST,PSI-BLAST,SSEARCH,HMMPFAM,ClustalW
- 原因:サーバダウンのため
- 該当期間中にご利用頂きました解析については,再度,検索・解析の実行をお願いいたします。
ユーザの皆様にご迷惑をお掛けいたしました事を深くお詫び申し上げます。皆様のご理解とご協力をお願いいたします。
- 作業日時:2009年3月11日(水) 21:00 ~ 22:00
上記時間帯において15分の通信断が発生します。 - 作業内容:ルータメンテナンス
皆様には大変ご迷惑をお掛けいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
参考 URL: http://www.osc.riken.jp/
アクセッション番号は以下の通りです。
- AFAAA0000001-AFAAA0543260 (543,260 entries)
- AFAAB0000001-AFAAB0191814 (191,814 entries)
- AFAAC0000001-AFAAC0474745 (474,745 entries)
- AFAAD0000001-AFAAD0353461 (353,461 entries)
- AFAAE0000001-AFAAE0270208 (270,208 entries)
- AFAAF0000001-AFAAF0513982 (513,982 entries)
- AFAAG0000001-AFAAG0349448 (349,448 entries)
- AFAAH0000001-AFAAH0425524 (425,524 entries)
- AFAAI0000001-AFAAI0358861 (358,861 entries)
- AFAAJ0000001-AFAAJ0285303 (285,303 entries)
- AFAAK0000001-AFAAK0327328 (327,328 entries)
- AFAAL0000001-AFAAL0456381 (456,381 entries)
- AFAAM0000001-AFAAM0436519 (436,519 entries)
- AFAAN0000001-AFAAN0499442 (499,442 entries)
- AFAAO0000001-AFAAO0682996 (682,996 entries)
- AFAAP0000001-AFAAP0716451 (716,451 entries)
- AFAAQ0000001-AFAAQ0546880 (546,880 entries)
- AFAAR0000001-AFAAR0391757 (391,757 entries)
関連ページ: MGA 配列データについて
Anonymous FTP 一括取得:AF_resource_index
これらは2/27分の新着データとしてDDBJより公開されております。
このたび,getentry にてサプレスエントリを検索した際に,一部のケースで誤った出力形式の結果が表示される状態が発生していることが判明いたしました。詳細は以下の通りです。
[該当する検索条件]
- 対象データベース : DDBJ
- 出力形式: FASTA(CDS含む),DDBJ-XML,INSD-XML
- 取得方法: メール送信,FTPファイル転送
[状態]
上記の検索条件にてサプレスエントリを検索した場合,該当サプレスエントリのみ検索結果が指定した出力形式ではなくフラットファイル形式で出力されます。上記の検索条件に該当しない場合,およびサプレスエントリ以外を検索する場合は出力形式に問題ありません。
[対応]
現在問題箇所を修正中です。対応次第 HP にてご連絡いたします。ユーザの皆さまにはご迷惑をお掛けしますことをお詫びいたします。
このたび、システム障害の発生により、正常に受付ができない状態になっていた期間があったことが判明いたしました。詳細は以下の通りです。
- 期間:2009年1月8日より2月14日 2:52 まで
- 状態:
結果受け取り方法にWWW を指定した場合:view result で結果を見ても空ページとなる
結果受け取り方法にE-mail を指定した場合:受け付け後に空ファイルが返信される - 原因:システム障害による
現在は障害も解消し、正常に結果が表示されます。
長期間にわたって不具合が続いており、ユーザの皆様に大変ご迷惑をお掛けいたしましたことをお詫びいたします。
ユーザの皆様にはご迷惑をおかけいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
- 休止日時: 2009年2月20(金)17時より 2月23日(月) 12時まで
- 理由:メンテナンスのため
このため, 2009年2月5日早朝以降,別紙リストに記載のアクセッション番号(98 エントリ)についてのみ,検索結果データが最新ではありません。(該当アクセッション番号以外は問題ございません)
現在,データの修正作業をおこなっておりますが(2/6中に完了予定です。作業が完了次第 DDBJ HP にてお知らせいたします),作業が完了するまでの間は最新のデータが得られない可能性があります。2月5日早朝以降に getentry, ARSA で DDBJ を検索対象データベースとして検索を行ない、検索結果中に該当エントリが含まれていた場合は,大変申し訳ありませんが、修正対応終了後に再度検索を実行して頂きますようお願い申し上げます。
ユーザの皆さまにはご迷惑をお掛けしますことをお詫びいたします。
修正作業は終了しました。ご迷惑をお掛けいたしました。(2月6日18時40分)
詳細は以下の通りです。
| サービス名 | 休止期間 |
| - SAKURA | 2/17(火) 17:00 - 2/18(水) 17:00 |
|
- DDBJHP - getentry - TXSearch - ARSA - 相同性検索システム(Clustalw含む) - Vector Screening System |
2/18(水) 9:00 - 17:00 |
上記休止期間は予定です。作業が終了したサービスより順次再開いたします。
ご不便をお掛けいたしますが,ご理解下さいますようお願いいたします。
全てのサービスを再開いたしました。どうぞご利用下さい。(2009.2.18 17時00分)
2008年6月に,CON エントリの配列表示の不具合が発生し,一部については対応が未完了となっていましたが,このたび全ての修正対応が完了し,正しい結果表示が可能となりました。
詳細については下記の通りです。
2008年6月に発生した不具合 :
(1)引用されているピースエントリの配列の領域が complement の場合に,正しくは相補鎖 ( complement ) を抜き出すべきところを,誤って順鎖向き (forward) の配列が抜き出されてしまう (2008.07.03 に対応完了済み)
(2)ピースエントリに CON エントリが含まれている場合,配列を正しく表示できない。
今回対応が完了した不具合について:
(1)不具合箇所: ピースエントリに CON エントリが含まれている場合,検索結果において下記の配列表示あるいは配列ファイル転送が正常に動作しない。
- 出力形式:"全塩基配列 FASTA" を選択
取得方法:"画面表示","メール送信" または,"FTP ファイル転送" を選択 - 出力形式:"フラットファイル ( DDBJ )" を選択
検索結果画面において,DNA 配列を FASTA 形式で一括転送 (ftp) または一括表示
(2)影響のあったサービス: getentry,ARSA, Web API ( GetEntry )
(3)対応完了日:2009年1月13日
(4)備考: getentry での CON エントリの配列表示の不具合についてのお詫び (2008.6.20)
ユーザの皆様には長期間にわたりご迷惑をお掛けしましたことを深くお詫びいたします。
- エントリ数:13,526,116 総アミノ残基数:3,599,816,846aa
- 今リリースでの変更点:
2008年10月に DDBJ/EMBL/GenBank Feature Table: Definition が改訂されました - DAD Release Note
- 現在公開されているリリースの情報
- 停止期間:2009年1月16日(水)9時から18時まで(終了次第HPにてお知らせいたします)
- 停止サービス:
・ARSA の DDBJ, DAD 検索(その他 18DB は利用可能です。検索結果中にDDBJ ならびに DAD の検索結果は含まれません。)
・TXSearch からの ARSA 参照機能
・DDBJ HP (上部検索窓) からの DNA/Protein/AllDBs検索機能(DDBJ/DAD以外は利用可能です)
備 考:上記停止期間中も ARSA での検索はご利用いただけますが,結果中に DDBJ ならびに DAD の検索結果は含まれません。その他の サービスも利用可能です。
ご迷惑をおかけいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。
保守作業は終了しました。ご協力ありがとうございました。(1月16日18時30分)
1月1日に発生したシステム障害により,1月1日9時より本日(1月5日 10時)まで,ARSA サービスが休止状態となっておりました。現在は復旧しており,問題なく検索がおこなえます。障害の発生が年末年始休業中であったために,長期間にわたりサービスが休止し,ユーザの皆様に多大なご迷惑をお掛けすることとなりましたことをお詫びいたします。
- 公開日:2008.12.26
- エントリ数:1,040,207 総アミノ残基数:343,709,341
- 現在公開されているリリースの情報
- エントリ数:98,220,409 塩基数:98,741,908,446
- 今リリースでの変更点:
2008年10月に DDBJ/EMBL/GenBank Feature Table: Definition が改訂されました - DDBJ Release Note
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