MiGap がDDBJ より再開 2012.05.02
MiGap (Microbial Genome Annotation Pipeline) は,微生物ゲノム配列に自動的にアノテーションを付加するパイプラインツールです。
2012年5月1日より DDBJ での利用が可能になりました。
http://migap.ddbj.nig.ac.jp
MiGapの利用を希望される場合には, スーパーコンピュータシステムの利用申込 ページの「Webサービスの利用申込: 新規申込」 よりアカウントを取得してください。(既にスパコンアカウントを登録済みの方は,同じアカウントで利用できますので登録の必要はありません)。
利用方法の参考:
MiGAP~微生物ゲノム注釈ツール利用法(「第25回DDBJing 講習会 in 三島」 講義資料)
注)ご利用は,現在は新規解析のみ可能です。2012年2月中旬までの解析結果の参照につきましては準備中です。
DRA と BioProject の動画マニュアルを公開 2012.04.27
DDBJ Sequence Read Archive と BioProject の動画マニュアルを公開しました。
DDBJ Sequence Read Archive
- データの登録1 ~必要なデータ~
- データの登録2 ~データの登録~
- データの登録3 ~データの転送~ Windows Mac
- データの登録4 ~鍵ペアの作成~ Windows Mac
DDBJ メールマガジン No.70 配信 2012.04.25
No. 70 (2012年4月24日発行) は,こちらへ
【目次】
(DDBJ サービスの状況について(4/20時点での新システムへの移行後の状況 )
Q and A 内検索機能を追加
(4/23-26) DRA, BioProject 関連システムの一部停止
大量データの公開
- 日頃より DDBJ をご利用頂きましてありがとうございます。
国立遺伝学研究所では,2012年3月にスーパーコンピュータシステムの新システムへの更新(リプレース)を実施いたしました。更新作業に伴い、一部のサービスにつきましては、2012年2月15日より一時中断(一部サービスについては終了)し,ユーザの皆さまには多大なご迷惑とご不便をおかけしていましたが、2012年4月20日までに、多くのサービスが再開または新サービスへの移行が完了いたしました。
今後も DDBJ のサービスをどうぞご利用ください。
公開中のサービス
HP の閲覧・更新
大量データ登録での受付(massFTP を利用しない場合)
アクセッション番号発行
データ公開・更新業務 など
利用をご希望の方は,情報・システム研究機構国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステム利用の条件(暫定)をご覧の上,「スーパーコンピュータシステムの利用申込」より申請して下さい。詳しくは,「スーパーコンピュータシステム利用」をご参照下さい。
休止中のサービス・業務(再開日程は決まり次第,当ホームページに掲載)
DDBJ Read Annotation Pipeline
Web API
GIB・GIB-V
massFTP を利用した大量データ登録
(大量登録は受け付けています。データは,メールの添付またはメディアにてお送りください)
ClustalW サービス再開 2012.04.19
-
新システムへの移行に伴い停止しておりました,ClustalW サービスを再開しました。
ユーザのみなさまには,大変長らくお待たせいたしました。
どうぞご利用下さい。
(参考)2012/3実施のコンピュータシステム移行に伴うお知らせ(タイトル一覧)

