What’s New(2012)
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第35回日本分子生物学会年会の、特別企画「使ってみようバイオデータベース~つながるデータ,広がる世界」 にDDBJ ブースを出展します。
「新遺伝研スパコンとDDBJサービスの新展開、および、新登録システムの紹介」をテーマにデモ展示を行います。
日程:12月11日(火) ~ 14日(金) 9:00~17:00 (最終日は16:15まで)
会場:福岡マリンメッセ バイオデータベースコーナー
スタッフが質問などにもお答えしますので、どうぞお気軽にお立寄り下さい。
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Feature Table Definition は, DDBJ/EMBL-Bank/GenBank 国際塩基配列データベース構築のために,DDBJ, EMBL-Bank, GenBank が三者間で定めた共通のアノテーション規範です。2012年11月に Feature Table Definition は version 10.2 に改訂されました。
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Nucleic Acids Research では,毎年データベース特集号が発行されています。DDBJ の活動に関連する下記の論文が発表されましたのでお知らせします。
"DDBJ new system and service refactoring"
Osamu Ogasawara, Jun Mashima, Yuichi Kodama, Eli Kaminuma, Yasukazu Nakamura, Kousaku Okubo and Toshihisa Takagi
Nucl. Acids Res. (2012) doi: 10.1093/nar/gks1152
"The International Nucleotide Sequence Database Collaboration"
Yasukazu Nakamura, Guy Cochrane and Ilene Karsch-Mizrachi on behalf of the International Nucleotide Sequence Database Collaboration
Nucl. Acids Res. (2012) doi: 10.1093/nar/gks1084
11月22日(金) 3:00頃の静岡県東部地区(DDBJ 所在地)への落雷が原因の停電により, 国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステムが緊急停止し,DDBJ HP を含めてDDBJ の多くのサービスが停止いたしました。
11月26日(月) 9:00現在,既に多くのサービスが再開しております。
長時間にわたるサービス停止となり, ユーザの皆さまには大変なご迷惑をおかけいたしましたことをお詫びいたします。
なお,一部のサービスにつきましては,引き続き復旧に向けての作業を急いでおります。もうしばらくお待ちくださいますよう,ご理解とご協力をお願いいたします。
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農業生物資源研究所から登録されたコナガ (Plutella xylostella) WGS データが公開されました。
getentry から検索可能です。
アクセッション番号は以下の通りです。
- WGS: BAGR01000001-BAGR01088530 (BAHO.gz) (88,530 entries)