What’s New
DDBJ をご利用いただきありがとうございます。
DDBJ では、５月にDDBJ ホームページをリニューアルしました。
今後も、より使いやすいホームページを目指して改善を行う予定です。
皆さまのご意見やご要望を伺い、改善に役立てたいと思いますので、アンケートへのご協力をお願いいたします。
DDBJ HP に関するアンケート（外部サイト） よりご回答ください。
なお、ご回答いただいたデータ等につきましては、本アンケートの目的のためだけに使用し、他の目的には使用いたしません。
DDBJ Web Magazine No. 84 (2013年7月18日発行) は、こちらへ
【目次】
DDBJ HP に関するアンケートへご協力をお願いいたします
2013年5月にリニューアルしましたDDBJ ホームページに関するアンケートへご協力をお願いいたします。
「第27回 DDBJing 講習会 in 三島」資料ダウンロード
2013年7月4日、三島にてDDBJing 講習会を開催いたしました。その際の講義資料をダウンロードページから取得できますので、ご登録の際などにご参照ください。
WABI(Web API for Biology) の再開
2012年3月より中断しておりましたWABI(Web API for Biology)を再開いたしました。検索速度、同時実行数などの性能が大幅に向上しておりますので、どうぞご利用ください。
DDBJ リリース 93.0，DAD リリース 63.0 完成
2013年6月11日DDBJ リリース 93.0，DAD リリース 63.0 が完成しました。
クロマグロ (Thunnus orientalis) ゲノム配列データの公開
カタユウレイボヤ (Ciona intestinalis) TPA CON データの更新
“DDBJ 塩基配列登録システム FAQ”––その6.
「DDBJ 塩基配列登録システム」へ頻繁に寄せられる質問とその回答です。ご登録の際に参考にしてください。
ホームページでもご覧になれますが、お申し込み頂いた方にはメール配信をいたします。 配信を希望される方は、申込・変更ページ で簡単に手続きができますので、この機会に是非お申し込み下さい。RSS 配信も行っております。
京都大学から登録されたカタユウレイボヤ (Ciona intestinalis) の TPA CON データが更新されました。
アクセッション番号は以下の通りです。getentry から検索可能です。
TPA CON: HT000001-HT001272 (1,272 entries)
中央水産研究所から登録されたクロマグロ (Thunnus orientalis) のゲノム配列データが公開されました。
アクセッション番号は以下の通りです。getentry から検索可能です。
WGS: BADN01000001-BADN01133062 (BADN.gz) (133,062 entries)
DDBJ では、プログラムから利用可能な Web サービス WABI (Web API for Biology) を再開しました。WABI (Web API for Biology) は、Perl, Ruby, Java などによるプログラムを利用することにより、DDBJの検索サービス を Web画面 を介せずに利用することができるサービスです。
DDBJ では、これまでも SOAP, REST によるWeb API サービスを提供していましたが、2012年3月のスーパーコンピュータのシステム切り替えに伴い、サービスの仕様が変更になったため、提供を中断しておりました。
今回の変更により検索速度、同時実行数などの性能が大幅に向上しております。
今回再開するのは BLAST です。
数百から数万の配列を検索する場合、Web画面からの入力では、multi fasta 形式でも複数回に分けて入力する必要があり、煩雑なコピー&ペーストの作業を繰り返す必要がありましたが、WABI BLAST を使用すると、このコピー&ペーストの手作業の繰返しを自動化することができます。近年、次世代シークエンサ出力データやメタゲノムなど、大容量のデータの解析が求められるようになっており、そのような場合にWABI は最適です。是非ご利用ください。WABI BLAST の詳細は、下記をご参照ください。
DDBJ では、WABIのサービスを、ClustalW や ARSAなどにも拡張し、より使いやすい形式で公開して行く予定です。
