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(6/14) 国立遺伝学研究所ならびにDDBJ ネットワークの一時停止 2013.05.30

メンテナンスのため、下記期日におきまして、国立遺伝学研究所ならびにDDBJ ネットワークが一時停止します。

作業日時：2013年6月14日(金) 午前 0:00 ～ 2:00 (この時間帯において60分程の通信停止が1回発生)
作業内容：学術情報ネットワークのメンテナンス

ご迷惑をお掛けいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。

「第27回 DDBJing 講習会 in 三島(2013.7.4.開催)」のご案内 2013.05.15

＊本講習会は終了いたしました [ddbjing_table_01]日　時,2013年7月4日(木) 10:00～17:00 （受付は 9:30より）|場　所,国立遺伝学研究所 DDBJセンター 4F会議室 |主　催,日本 DNA データバンク（DDBJ）|対　象,DDBJ を利用される方をどなたでも歓迎します（定員20名先着順）|参加費,無料|内　容,今回の講習会テーマは「NGS 配列解析と DDBJ データ登録」です。
実習を交えた講習を行います。参加申込みの際は、詳細の項を必ずお読みください。|詳　細,[講習会の日程][PC について][アクセス][お問い合わせ][参加申込み][/ddbjing_table_01]

講習会の日程

[ddbjing_table_02]7月4日（木） 10:00～17:00 時間内容・講師 9:30-10:00 受付 10:00-11:10
(70) DDBJ と NIG SuperComputer の紹介、大量配列情報解析 中村保一（国立遺伝学研究所　教授） 11:20-12:10
(50) 公共 NGS データの二次利用を支える技術 大田達郎（ライフサイエンス統合データベースセンター） 12:10-13:10 昼食休憩 13:10-14:00
(50) カメ de novo ゲノムと RNAseq データの異種間比較 入江直樹（理化学研究所　発生・再生科学総合研究センター） 14:00-14:50
(50) DDBJ Read Annotation Pipeline の紹介と実習 長崎英樹（国立遺伝学研究所　大量遺伝情報研究室） 15:00-15:30
(30) DDBJ Sequence Read Archive, BioProject, BioSample の紹介 児玉悠一（DDBJ 構築チーム　アノテータ） 15:30-16:00
(30) 大量登録システム(MSS) の紹介：大規模アセンブル配列の登録 大城戸利久（DDBJ 構築チーム　アノテータ） 16:10-17:00
(50) DDBJ 塩基配列登録システムの紹介と実習：Web から塩基配列を登録 小菅武英（DDBJ 構築チーム　アノテータ）[/ddbjing_table_02]

PC について

無線LAN 接続が可能なPC をご持参ください。

アクセス

〒411-8540 静岡県三島市谷田1111 国立遺伝学研究所 DDBJ センター 4F アクセス

お問い合わせ

お問い合わせの「講習会」までご連絡ください。

参加申込み

本講習会は終了いたしました

DDBJing 講習会とは？

日本DNA データバンク（DDBJ）では、研究者の皆様が決定された塩基配列の登録を受け付け、それらを DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースに格納し公開することや、塩基配列やアミノ酸配列などのデータベースを検索し解析するソフトを WWW などで広く提供することを行なっています。 DDBJing とは、DDBJ が提供するこれらのシステムを使って頂くことです。これまで国立遺伝学研究所で11回、所外で15回、DDBJ をより有効に活用して頂くために、全国各地で DDBJing 講習会を開催しております。
・過去のDDBJing 講習会： DDBJing 講習会資料ダウンロード / 過去の講習会一覧

(5/17-20)DDBJ 公開サービスの一部機能の休止(再開済) 2013.05.13

国立遺伝学研究所のネットワークシステムのメンテナンスにともない、以下の日程でDDBJ の公開サービスの一部機能を休止いたします。

全てのサービスが再開しました。ご迷惑をおかけしたことをお詫びいたします。（5/21 11:50）

サービス名	休止する機能	休止期間
DDBJ　ホームページ	お問い合わせページからの送信大量登録システム利用申込み DDBJ Web Magazine 申込・変更・中止	2013.05.17 （金）18:00 ～ 05.18（土） 09:00
DDBJ Sequence Read Archive DDBJ Trace Archive DDBJ BioProject Database	D-way アカウント作成 D-way 経由のデータ登録・更新検索	2013.05.17 （金）15:00
getentry ARSA	データの公開・更新	2013.05.18 （土）15:00 ～ 05.20（月）12:00 保留分は再開後に更新
FTP	データの取得データの公開・更新	2013.05.18 （土）15:00

ご迷惑をお掛けいたしますが，ご理解とご協力をお願いいたします。

2013年5月13日

マウス (Mus musculus strain MSM/Ms) ゲノム配列データの公開 2013.04.19

国立遺伝学研究所から登録されたマウス (Mus musculus strain MSM/Ms) のゲノム配列データが公開されました。
アクセッション番号は以下の通りです。getentry から検索可能です。
WGS: BAAG010000001-BAAG011237600 (BAAG.gz) (1,237,600 entries)

DDBJ Web Magazine No.82 配信 2013.04.18

No. 82 (2013年4月18日発行) は、こちらへ

【目次】 DDBJ リリース92.0，DAD リリース62.0 完成 2013年3月21日にDDBJ リリース92.0，DAD リリース62.0を公開しました。
BLAST の機能改善 BLAST に大幅な機能改善をおこないました。「結果の取得方法にE-mail追加」「結果画面中のアクセッション番号にgetentry へのリンク追加」など。
大量データの公開 ナンヨウアブラギリのゲノム配列データ、コモンマーモセット由来の 5'-EST データが公開されました。
"DDBJ 塩基配列登録システム FAQ" --その４. 「DDBJ 塩基配列登録システム」へ頻繁に寄せられる質問と回答です。ご登録の際に参考にしてください。

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