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メンテナンスのため、下記期日におきまして、国立遺伝学研究所ならびにDDBJ ネットワークが一時停止します。

  • 作業日時:2013年6月14日(金) 午前 0:00 ~ 2:00 (この時間帯において60分程の通信停止が1回発生)
  • 作業内容:学術情報ネットワークのメンテナンス


ご迷惑をお掛けいたしますが、ご理解とご協力をお願いいたします。

*本講習会は終了いたしました [ddbjing_table_01]日 時,2013年7月4日(木) 10:00~17:00 (受付は 9:30より)|場 所,国立遺伝学研究所 DDBJセンター 4F会議室 |主 催,日本 DNA データバンク(DDBJ)|対 象,DDBJ を利用される方をどなたでも歓迎します(定員20名 先着順)|参加費,無料|内 容,今回の講習会テーマは「NGS 配列解析と DDBJ データ登録」です。
実習を交えた講習を行います。参加申込みの際は、詳細の項を必ずお読みください。|詳 細,[講習会の日程][PC について][アクセス][お問い合わせ][参加申込み][/ddbjing_table_01]  

講習会の日程

[ddbjing_table_02]7月4日(木) 10:00~17:00 時間 内容・講師 9:30-10:00 受付 10:00-11:10
(70) DDBJ と NIG SuperComputer の紹介、大量配列情報解析 中村保一(国立遺伝学研究所 教授) 11:20-12:10
(50) 公共 NGS データの二次利用を支える技術 大田達郎(ライフサイエンス統合データベースセンター) 12:10-13:10 昼食休憩 13:10-14:00
(50) カメ de novo ゲノムと RNAseq データの異種間比較 入江直樹(理化学研究所  発生・再生科学総合研究センター) 14:00-14:50
(50) DDBJ Read Annotation Pipeline の紹介と実習 長崎英樹(国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室) 15:00-15:30
(30) DDBJ Sequence Read Archive, BioProject, BioSample の紹介 児玉悠一(DDBJ 構築チーム アノテータ) 15:30-16:00
(30) 大量登録システム(MSS) の紹介:大規模アセンブル配列の登録 大城戸利久(DDBJ 構築チーム アノテータ) 16:10-17:00
(50) DDBJ 塩基配列登録システムの紹介と実習:Web から塩基配列を登録 小菅武英(DDBJ 構築チーム アノテータ)[/ddbjing_table_02]  

PC について

無線LAN 接続が可能なPC をご持参ください。  

アクセス

〒411-8540 静岡県三島市谷田1111 国立遺伝学研究所 DDBJ センター 4F  アクセス  

お問い合わせ

お問い合わせ の「講習会」までご連絡ください。  

参加申込み

本講習会は終了いたしました  

DDBJing 講習会とは?

日本DNA データバンク(DDBJ)では、研究者の皆様が決定された塩基配列の登録を受け付け、それらを DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベース に格納し公開することや、塩基配列やアミノ酸配列などのデータベースを検索し解析するソフトを WWW などで広く提供することを行なっています。 DDBJing とは、DDBJ が提供するこれらのシステムを使って頂くことです。これまで国立遺伝学研究所で11回、所外で15回、DDBJ をより有効に活用して頂くために、全国各地で DDBJing 講習会を開催しております。
・過去のDDBJing 講習会: DDBJing 講習会資料ダウンロード / 過去の講習会 一覧
国立遺伝学研究所のネットワークシステムのメンテナンスにともない、以下の日程でDDBJ の公開サービスの一部機能を休止いたします。

全てのサービスが再開しました。ご迷惑をおかけしたことをお詫びいたします。(5/21 11:50)

サービス名 休止する機能 休止期間
DDBJ ホームページ お問い合わせページからの送信
大量登録システム利用申込み
DDBJ Web Magazine 申込・変更・中止
2013.05.17 (金)18:00
    ~ 05.18(土) 09:00
DDBJ Sequence Read Archive
DDBJ Trace Archive
DDBJ BioProject Database
D-way アカウント作成
D-way 経由のデータ登録・更新
検索
2013.05.17 (金)15:00
   
getentry
ARSA
データの公開・更新 2013.05.18 (土)15:00
    ~ 05.20(月)12:00
保留分は再開後に更新
FTP データの取得
データの公開・更新
2013.05.18 (土)15:00
   
ご迷惑をお掛けいたしますが,ご理解とご協力をお願いいたします。

2013年5月13日

国立遺伝学研究所から登録されたマウス (Mus musculus strain MSM/Ms) のゲノム配列データが公開されました。
アクセッション番号は以下の通りです。getentry から検索可能です。
    WGS: BAAG010000001-BAAG011237600 (BAAG.gz) (1,237,600 entries)

No. 82 (2013年4月18日発行) は、こちらへ


【目次】 DDBJ リリース92.0,DAD リリース62.0 完成 2013年3月21日にDDBJ リリース92.0,DAD リリース62.0を公開しました。
BLAST の機能改善 BLAST に大幅な機能改善をおこないました。「結果の取得方法にE-mail追加」 「結果画面中のアクセッション番号にgetentry へのリンク追加」など。
大量データの公開 ナンヨウアブラギリのゲノム配列データ、コモンマーモセット由来の 5'-EST データが公開されました。
"DDBJ 塩基配列登録システム FAQ" --その4. 「DDBJ 塩基配列登録システム」へ頻繁に寄せられる質問と回答です。ご登録の際に参考にしてください。



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