What’s New

日本農芸化学会2013年度大会 附設展示会 へDDBJ ブースを出展し、各種サービスの紹介をいたします。


  日程：2013年3月25日(月) ～ 27日(水) 9：00～16：30 (最終日は13：00まで)
  会場：東北大学 川内北キャンパス 川内体育館


スタッフが質問などにもお答えしますので、大会にお越しの際は、どうぞお気軽にお立寄りください。

産業技術総合研究所から登録された森林の土壌メタゲノム (forest soil metagenome) 由来の TSA データが公開されました。

アクセッション番号は以下の通りです。（getentry または DRASearch から検索可能です）

    TSA: FX000001-FX056084 (56,084 entries)
    raw data: DRR000345

【目次】 anonymous FTP のディレクトリ構成変更 FTP のddbj_database 配下にunified-all を新設し、 これに伴いnon-redundant からunified-new に名称を変更しました。 日本特許庁(JPO)データにおける公開フラットファイルの新フォーマット紹介 JPO データの新フォーマットの特徴を特許担当アノテータが紹介いたします。 "DDBJ 塩基配列登録システム FAQ" --その3. 2012年10月より運用を開始しました「DDBJ 塩基配列登録システム」に関する 質問と回答です。ご登録の際、参考にしてください。 ホームページでもご覧になれますが，お申し込み頂いた方にはメール配信をいたします。 配信を希望される方は，申込・変更ページ で簡単に手続きができますので，この機会に是非お申し込み下さい。また，RSS 配信も行っております。

FTP の ddbj_database (DDBJ 由来データ) 配下のディレクトリに unified-all を新設しました。また、これに伴い、non-redundant から unified-new に名称変更しました。
ddbj_database 以下の構成の詳細は、同ディレクトリ内の README.TXT をご参照下さい。定期監視されている場合は、この変更による影響のご確認をお願いいたします。

unified-all; ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/ddbjnew/unified-all

このディレクトリには ddbj と ddbjnew のディレクトリ内に含まれる全ファイルを統合して、更新されたエントリを最新のバージョンのみ含むようにしています。つまり、置き換えられた以前のバージョンのエントリを除いています。

ディレクトリ構成

　unified-all
　　|- fasta   : in FASTA file format
　　|- blastdb : in BLAST DB format

unified-new; ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/ddbjnew/unified-new

このディレクトリには ddbjnew のディレクトリ内に含まれる全ファイルを統合して、更新されたエントリを最新のバージョンのみ含むようにしています。 つまり、置き換えられた以前のバージョンのエントリを除いています。

ディレクトリ構成

　unified-new  : in DDBJ flat file format
　　|- fasta   : in FASTA file format
　　|- blastdb : in BLAST DB format

【目次】 国立遺伝学研究所 特任研究員 (DDBJアノテータ) 募集 DDBJ、DRA、DOR、個人ゲノムデータのデータベースについて構築・公開を 担当する特任研究員 (DDBJアノテータ)を募集いたします。 停電によるDDBJ 公開サービスの一時停止 3月8～11日の期間でDDBJ の全公開サービスを一時停止いたします。 サービスによって停止期間が異なりますのでご注意ください。 ホームページでもご覧になれますが，お申し込み頂いた方にはメール配信をいたします。 配信を希望される方は，申込・変更ページ で簡単に手続きができますので，この機会に是非お申し込み下さい。また，RSS 配信も行っております。