• 新規作成した DDBJ アカウントで sftp ができない不具合
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第38回 INSDC meeting report 2025年6月10~12日 英国ケンブリッジ

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第38回 INSDC meeting report 2025年6月10~12日 英国ケンブリッジ

International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC) は、その共同事業の運営・推進を図るために、年1回、会議を開催しています。
2025年は6月10日~12日に英国ケンブリッジで開催され、運営上の実務的な問題を討論しました。
会議の報告を以下にまとめました。

検討事項

/transcript_id

CDS と mRNA feature の対応関係を示す /transcript_id qualifier の導入を検討しています。

Feature と Qualifier の記載則改訂

  • /organelle 規定値に “nitroplast” 追加
  • /inference TYPE の規定値に “domain architecture” と “ortholog evidence” を追加
  • /organism に記載される生物名と部分的に重複する /variety と /sub_species の廃止