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第39回 DDBJing 講習会 with 「先進ゲノム支援」情報解析講習会

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第39回 DDBJing 講習会 with 「先進ゲノム支援」情報解析講習会

本講習会は中級者向け情報解析講習会として、プログラミング言語「Python」を用いたRNA-seqデータの視覚化や多変量解析等のプログラミング実習を中心に実施しました。

  • 日時:2019年10月9日 ~ 11日

  • 場所:国立遺伝学研究所(DDBJ)

  • 想定スキルレベル:情報解析中級者

  • 参加人数:若手研究者20名程度

  • 共催:先進ゲノム支援(PAGS), ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)

  • 内容:

    タイトル 講師 資料
    Pythonの基本文法 新海 典夫(理化学研究所)
    文字列処理、ファイルの読み書き、正規表現 高橋 弘喜(千葉大学)
    Jupyter notebook、Biopython 谷澤 靖洋(国立遺伝学研究所)
    表形式ファイルの処理(Pandas)、RNA-seqデータの補正 坂本 美佳(国立遺伝学研究所)
    視覚化 (matplotlib, seaborn) 孫 建強(農研機構)
    統計的仮説検定 森 宙史(国立遺伝学研究所)
    多変量解析 東 光一(国立遺伝学研究所)

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