入力した配列が，BLAST プログラムによりフィルタリングされたためです。
フィルタリングにより，入力した配列のうち構造の複雑度が低い領域は
“N”（アミノ酸配列の場合は “X”）に 置き換わります。 フィルタリングの詳細は，BLAST HELP の
フィルター をご覧下さい。 フィルタリング機能を OFF
にする場合は，設定画面の下の方にある「フィルター」オプションの ラジオボタンで OFF を選択して下さい。
なお，このオプションを OFF にすると検索時間が通常よりかかる場合がありますので，ご注意下さい。