配列ファイルのみ送付で塩基配列の登録は可能ですか

いいえ、配列ファイルのみでは登録できません。アノテーションファイルが必要です。
配列ファイル形式、アノテーションファイル形式をご確認ください。
こちらのサイトで、サンプルアノテーションをご覧ください。