DDBJの各エントリの1行目にあるLOCUS名は、これまでは頭3文字で生物種名、残りで遺伝子名やプロダクト名などを示すような最大10文字のアルファベットもしくは数字を用い、他のエントリとの重複を避けるように命名されてきました。
しかし、この方式で使用可能な文字列が残り少なくなってきたことから、7月1日以降登録される配列のLOCUS名は、原則的にAccession Noをそのまま用いることになりました。
GenBankでもすでに旧来の命名法を改め、ESTデータではDDBJの新方式と同様にAccession Noを、通常データでは頭2文字で生物種名+Accession NoをLOCUS名として用いています。
この変更により従来のデータベース解析ソフトウエアを修正する必要や、検索方法を変える必要のある場合もありますので、ご配慮お願いします。
特に、LOCUS名で生物種を検索している方は、今後はそれができなくなりますので、ご注意ください。
生物種名はSOURCE欄に記載されていますので、そちらをご参照ください。
[旧方式]
LOCUS HUMNANIKA 777 bp ss-mRNA HUM 01-JUL-1996DEFINITION Human Brain mRNA for NANIKA protein, complete cds.ACCESSION D99999KEYWORDS NANIKA protein; sample entry.SOURCE Homo sapiens Brain mRNA, clone:NANIKA7.1. ORGANISM Homo sapiens Eukaryota; Animalia; Chordata; Vertebrata; Mammalia; Theria; Eutheria; Primates; Haplorhini; Catarrhini; Hominidae.REFERENCE 1 (bases 1 to 777) : : :</code>
[新方式]
LOCUS D99999 777 bp ss-mRNA HUM 01-JUL-1996DEFINITION Human Brain mRNA for NANIKA protein, complete cds.ACCESSION D99999KEYWORDS NANIKA protein; sample entry.SOURCE Homo sapiens Brain mRNA, clone:NANIKA7.1. ORGANISM Homo sapiens Eukaryota; Animalia; Chordata; Vertebrata; Mammalia; Theria; Eutheria; Primates; Haplorhini; Catarrhini; Hominidae.REFERENCE 1 (bases 1 to 777) : : :</code>