ftpの検索対象とするデータベースをDDBJに統一することに伴い、DDBJでの検索システム、get-entry及びSFgate+WAISに変更を行ないましたので、お知らせいたします。
get-entry 変更点
ftpでの検索対象データベースをDDBJに統一する作業に伴いget-entryにおける機能改 造と機能追加を行いました。
機能の改造および追加は以下の通りです。
(1) DNAの対象データベースからGenBank,EMBLの項目を削除し"DDBJ/GenBank/EMBL"に統合しました。
(2) DNAの出力フォーマットに"EMBL形式"と"翻訳データ表示"を追加しました。 翻訳データ表示機能とはDADをよりユーザに使用してもらうためにDNAエントリから翻訳データのみをfasta形式で出力する機能です。 これはDNAのデータにtranslationが存在するエントリであれば瞬時に翻訳データを出力できます。 操作方法はDNAデータベースの出力フォーマット選択項目から「翻訳」を選択することにより表示が可能となります。
現在のDNAデータから出力可能なフォーマットは以下の４パターンです。
(1) 標準フォーマット出力
(2) FASTAフォーマット出力
(3) EMBLフォーマット出力
(4) 翻訳データのfastaフォーマット出力
SFgate+WAIS 変更点
SFgate+WAISによるキーワード検索システムの変更は以下の点です。
(1) DNAの対象データベースを DDBJ(Release+daily updates), DDBJNEW(daily updat es)とする(daily updatesにはEMBL/GenBankのdaily updatesも含まれる)。