LION AG社で開発されている遺伝子配列検索システム「SRS」の最新版 SRS 6.0.5.1 を正式公開いたしました。SRS では,例えば以下のような検索ができます。
フィールド毎のキーワード検索
例)Definision に acetylchol と receptor を含んでいて,かつmuscarinic を含んでいないものを検索する場合。
- 指定方法 acetylchol* & receptor* ! muscarinic
- 数値の範囲指定検索
例)エントリの配列長が 10000 以上 20000 以下のものを検索する場合。 - 指定方法 10000 : 20000
- 日付の範囲指定検索
例)エントリの最終更新日が 2000/1/1 以降のものを検索する場合。 - 指定方法 1-jan-2000 :
- キーワードの詳しい指定方法は,ここをご参照下さい。
※注意
AllText フィールドというのが用意されていますが,これには Feature情報は含まれていません。 Feature 情報全体は,Feature Description でキーワードを指定することで検索可能です。 従いまして,全フィールドに対して検索をかけたい場合は,AllText とFeature Descriptionの両方にキーワードを指定して下さい。
なお,検索対象データベースとして以下のものを用意しております。
Sequence | DDBJ, DDBJNEW, DAD, DADNEW, SWISSPROT, PIR |
Sequence Related | PROSITE, PROSITEDOC, BLOCKS, PRINTS, PFAMA, PFAMB, SWISSPFAM, PFAMHMM, PFAMSEED, PRODOM, ENZYME |
Protein 3D Struct | PDB, HSSP, FSSP |
Metabolic Pathway | PATHWAY, LENZYME, LCOMPOUND |
また,一部データベースについては検索結果から CLUSTALW/BLASTP を実行できるようになっております。